numpy h5py scipy

讀取mat文件并存為npy格式文件

具體見代碼，注意h5py的轉(zhuǎn)置問題

import numpy as np

from scipy import io

mat = io.loadmat('yourfile.mat')

# 如果報(bào)錯(cuò):Please use HDF reader for matlab v7.3 files

# 改為下一種方式讀取

import h5py

mat = h5py.File('yourfile.mat')

# mat文件里可能有多個(gè)cell，各對(duì)應(yīng)著一個(gè)dataset

# 可以用keys方法查看cell的名字, 現(xiàn)在要用list(mat.keys()),

# 另外，讀取要用data = mat.get('名字'), 然后可以再用Numpy轉(zhuǎn)為array

print(mat.keys())

# 可以用values方法查看各個(gè)cell的信息

print(mat.values())

# 可以用shape查看維度信息

print(mat['your_dataset_name'].shape)

# 注意，這里看到的shape信息與你在matlab打開的不同

# 這里的矩陣是matlab打開時(shí)矩陣的轉(zhuǎn)置

# 所以，我們需要將它轉(zhuǎn)置回來

mat_t = np.transpose(mat['your_dataset_name'])

# mat_t 是numpy.ndarray格式

# 再將其存為npy格式文件

np.save('yourfile.npy', mat_t)

npy文件的讀取很簡單

import numpy as np

matrix = np.load('yourfile.npy')

可以重新讀取npy文件保存為mat文件

方法一(在MATLAB雙擊打開時(shí)遇到了錯(cuò)誤：Unable to read MAT-file *********.mat. Not a binary MAT-file. Try load -ASCII to read as text. )：

import numpy as np

matrix = np.load('yourfile.npy')

f = h5py.File('yourfile.mat', 'w')

f.create_dataset('dataname', data=matrix)

# 這里不會(huì)將數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)置

方法二(使用scipy)：

from scipy import io

mat = np.load('rlt_gene_features.npy-layer-3-train.npy')

io.savemat('gene_features.mat', {'gene_features': mat})

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的python读取npy文件 mse_python读取mat或npy文件以及将mat文件保存为npy文件（或npy保存为mat）的方法...的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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