曲线 线性回归_GRAPHPAD作图技巧(二)--拟合曲线
計(jì)算藥物半抑制濃度IC50的擬合曲線(xiàn)圖的做法:
第一步:使用的版本是Graphpad Prism 5,打開(kāi)軟件后,選擇XY作圖方式:
第二步:將實(shí)驗(yàn)所得的數(shù)據(jù)填寫(xiě)入圖表中,注意x軸寫(xiě)入的是log[藥物],比如說(shuō)你加入的藥物濃度分別為1-100000nM,那首先你必須先將這個(gè)濃度進(jìn)行換算,一個(gè)有效的方法就是在Excel中進(jìn)行計(jì)算,通過(guò)log[濃度]獲得對(duì)于的對(duì)數(shù)值,如圖所示換算為0-5。
第三步:將換算值填入X列,Y列填寫(xiě)你實(shí)驗(yàn)所測(cè)活性:
第四步:填入數(shù)值后,點(diǎn)擊左側(cè)date1即可看到如下點(diǎn)狀圖:
第五步:接下來(lái)點(diǎn)擊上方analysis欄中中間那個(gè)非線(xiàn)性回歸曲線(xiàn),上圖紅色圈中圖標(biāo);進(jìn)入后,可以看到有多種非線(xiàn)性回歸曲線(xiàn)方式,由于我們做的是半抑制濃度IC50,因此選擇inhibition這一欄,應(yīng)用后,可以看到圖像中出現(xiàn)了一條曲線(xiàn)。
第六步:點(diǎn)擊左方的results欄目即可獲得此藥物的IC50=58.04nM。
此外,也可以用這種方法來(lái)做半活化濃度EC50的擬合曲線(xiàn)圖。如下圖所示填入XY軸數(shù)值。
隨后同樣點(diǎn)擊非線(xiàn)性回歸曲線(xiàn)
進(jìn)入后,選擇stimulation這一欄,應(yīng)用后,即可獲得活化曲線(xiàn)圖。
總結(jié)
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