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深度学习,提高前列腺癌诊断正确率

發(fā)布時(shí)間:2023/12/14 pytorch 74 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 深度学习,提高前列腺癌诊断正确率 小編覺(jué)得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.

文 / Google AI 醫(yī)療保健技術(shù)負(fù)責(zé)人 Martin Stumpe 和產(chǎn)品經(jīng)理 Craig Mermel?

在美國(guó),大約有九分之一的男性一生中會(huì)患上前列腺癌,這使其成為男性中最常見(jiàn)的癌癥。前列腺癌雖然常見(jiàn),但往往不具侵蝕性,因此醫(yī)生很難確定癌癥是否對(duì)患者構(gòu)成足夠大的風(fēng)險(xiǎn),以致于需要進(jìn)行治療,例如通過(guò)手術(shù)切除前列腺(前列腺切除術(shù))或放療。Gleason 分級(jí)是幫助我們對(duì)前列腺癌患者進(jìn)行 “風(fēng)險(xiǎn)分級(jí)” 的重要方法,其使用顯微鏡觀察載玻片,并根據(jù)樣本與正常前列腺之間的相似程度對(duì)癌細(xì)胞進(jìn)行分級(jí)。

然而,雖然前列腺癌 Gleason 分級(jí)的臨床意義已得到廣泛認(rèn)可,但過(guò)程非常復(fù)雜,并且具有主觀性。研究表明,病理學(xué)家對(duì)分級(jí)結(jié)果存在分歧的概率是 30% 到 53% [1][2]。此外,接受過(guò)專(zhuān)業(yè)培訓(xùn)的病理學(xué)家還遠(yuǎn)遠(yuǎn)不足,無(wú)法滿足全球的前列腺癌病理診斷需求,在美國(guó)以外的國(guó)家和地區(qū)尤其如此。最近提出的指導(dǎo)原則也建議病理學(xué)家在最終診斷報(bào)告中寫(xiě)明不同 Gleason 分級(jí)下的腫瘤預(yù)后良好概率,這不僅加大了病理學(xué)家的工作量,還為其帶來(lái)另一個(gè)主觀性挑戰(zhàn) [3]。總體來(lái)看,這些問(wèn)題表明,我們可以利用基于深度學(xué)習(xí)的模型來(lái)改進(jìn)前列腺癌的診斷和臨床管理。這類(lèi)似于?Google?及其他機(jī)構(gòu)利用此類(lèi)技術(shù)證明提高轉(zhuǎn)移性乳腺癌檢測(cè)準(zhǔn)確率的方法。

在《用于改進(jìn)前列腺癌 Gleason 評(píng)分的深度學(xué)習(xí)算法的開(kāi)發(fā)與驗(yàn)證》(Development and Validation of a Deep Learning Algorithm for Improving Gleason Scoring of Prostate Cancer) 一文中,我們探討了深度學(xué)習(xí)能否提升對(duì)前列腺切除術(shù)樣本進(jìn)行前列腺癌 Gleason 分級(jí)的準(zhǔn)確度和客觀性。我們開(kāi)發(fā)了一個(gè)深度學(xué)習(xí)系統(tǒng) (DLS),首先將載玻片中的每個(gè)區(qū)域?qū)?yīng)至 Gleason 模式,與正常前列腺相似程度越高的腫瘤,對(duì)應(yīng)的模式就越低,以此反映病理學(xué)家的工作流程。然后,DLS 根據(jù)所呈現(xiàn)的兩種最常見(jiàn) Gleason 模式總結(jié)整體 Gleason 分級(jí)組別。分級(jí)組別越高,癌癥進(jìn)一步惡化的風(fēng)險(xiǎn)就越大,而患者從治療中獲益的可能性也越大。?


Gleason 模式的直觀示例,該模式用于對(duì)前列腺癌進(jìn)行分級(jí)的 Gleason 系統(tǒng)。系統(tǒng)根據(jù)癌細(xì)胞與正常前列腺組織的相似程度,為單個(gè)癌細(xì)胞圖塊分配 Gleason 模式。模式編號(hào)越小,對(duì)應(yīng)的腫瘤分化程度就越好。圖像來(lái)源:美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院


為了開(kāi)發(fā)和驗(yàn)證 DLS,我們收集了已去除個(gè)人信息的前列腺切除術(shù)樣本圖像,其中包含的前列腺癌細(xì)胞數(shù)量和種類(lèi)比通過(guò)針刺活檢獲得的要多,雖然后者是更常用的臨床過(guò)程。在訓(xùn)練數(shù)據(jù)方面,有 32 位病理學(xué)家針對(duì) Gleason 模式提供了詳細(xì)注釋(最終得到超過(guò) 1.12 億個(gè)經(jīng)過(guò)注釋的圖塊)和每張圖像的整體 Gleason 分級(jí)組別。為了克服前文提及的 Gleason 分級(jí)可變性問(wèn)題,驗(yàn)證數(shù)據(jù)集中的每個(gè)載玻片都分別由 3 至 5 位一般病理學(xué)家(從 29 位病理學(xué)家中選出)獨(dú)立分級(jí),并由一位泌尿生殖專(zhuān)業(yè)病理學(xué)家作出最終的 Gleason 分級(jí),從而獲得該載玻片的真實(shí)標(biāo)記。?

在論文中,我們展示了 DLS 的整體準(zhǔn)確率達(dá)到 70%,而在我們的研究中通過(guò)美國(guó)執(zhí)業(yè)資格認(rèn)證的普通病理學(xué)家的平均準(zhǔn)確率為 61%。我們選出 10 位在為驗(yàn)證數(shù)據(jù)集中每個(gè)載玻片分級(jí)中表現(xiàn)出色的一般病理學(xué)家,而 DLS 的準(zhǔn)確率超過(guò)了其中 8 位。在 Gleason 模式定量分析中,DLS 的準(zhǔn)確率也高于一般病理學(xué)家。我們可以將這些對(duì) Gleason 分級(jí)的改進(jìn)解讀為更好的臨床風(fēng)險(xiǎn)分級(jí):在識(shí)別術(shù)后疾病復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)更高的患者方面,DLS 的表現(xiàn)優(yōu)于水平一般的病理學(xué)家,這可能會(huì)使醫(yī)生能夠根據(jù)這些信息選擇更適合患者的療法。


DLS 與病理學(xué)家的評(píng)分表現(xiàn)比較。a:DLS 的準(zhǔn)確率(以紅色表示)與 29 位病理學(xué)家平均準(zhǔn)確率(以綠色表示)的比較。誤差線表示 95% 的置信區(qū)間。b:DLS、29 位病理學(xué)家,以及泌尿生殖專(zhuān)業(yè)病理學(xué)家提供的風(fēng)險(xiǎn)分級(jí)比較。我們根據(jù)患者的 Gleason 分級(jí)組別,將他們分為高風(fēng)險(xiǎn)和低風(fēng)險(xiǎn)組。這些風(fēng)險(xiǎn)組生存曲線(Kaplan-Meier 曲線)之間的較大分離區(qū)域表示更準(zhǔn)確的分級(jí)


我們還發(fā)現(xiàn) DLS 能夠描繪組織形態(tài)特征,這些特征似乎位于兩種 Gleason 模式的相交位置,這是病理學(xué)家進(jìn)行 Gleason 分級(jí)時(shí)出現(xiàn)分歧的一個(gè)原因,也表明我們或許可以更加細(xì)分前列腺癌的 “精確分級(jí)”。雖然這些中間模式(例如 Gleason 模式 3.3 或 3.7)的臨床意義尚不明確,但 DLS 提升的精確度將會(huì)推動(dòng)對(duì)這一有趣問(wèn)題的進(jìn)一步研究。?


評(píng)估 DLS 的區(qū)域級(jí)別分類(lèi)。a:3 位病理學(xué)家的注釋與 DLS 預(yù)測(cè)的比較。病理學(xué)家對(duì)腫瘤區(qū)域位置和范圍的判斷展現(xiàn)出普遍一致性,但在對(duì) Gleason 模式進(jìn)行分類(lèi)方面有較大分歧。系統(tǒng)通過(guò)在 Gleason 模式 3(綠色)、4(黃色)和 5(紅色)的 DLS 預(yù)測(cè)模式間進(jìn)行插值,來(lái)展示每個(gè)區(qū)域的 DLS 精確 Gleason 模式。b:DLS 預(yù)測(cè)?
模式與病理學(xué)家對(duì)測(cè)試數(shù)據(jù)集中 4100 萬(wàn)已注釋圖塊作出的 Gleason 模式分類(lèi)之分布情況的比較。病理學(xué)家存在分歧的圖塊中的組織更有可能位于兩種模式的相交位置,DLS 在其預(yù)測(cè)分?jǐn)?shù)中反映出這種不明確性


雖然這些初步成果很振奮人心,但在將類(lèi)似 DLS 的系統(tǒng)應(yīng)用于改進(jìn)對(duì)前列腺癌患者的治療之前,我們還有很多工作要做。首先,我們可以利用更多訓(xùn)練數(shù)據(jù)進(jìn)一步提高模型的準(zhǔn)確度,并基于包含更多和更多樣患者的獨(dú)立群體進(jìn)行驗(yàn)證。此外,我們正在積極完善 DLS 系統(tǒng),以將其用于診斷性針刺活檢,此類(lèi)活檢會(huì)在患者決定接受手術(shù)前進(jìn)行,也是 Gleason 分級(jí)在臨床決策方面具有更重大影響的原因。我們還需要進(jìn)行更深入的研究來(lái)評(píng)估如何以最佳方式將 DLS 整合到病理學(xué)家的診斷工作流程中,以及評(píng)估這種基于人工智能的輔助方法在臨床實(shí)踐中對(duì) Gleason 分級(jí)整體效率、準(zhǔn)確率和預(yù)后判斷能力的影響。盡管如此,我們?nèi)匀粸檫@類(lèi)技術(shù)顯著改進(jìn)癌癥診斷和患者治療的潛力感到振奮。



致謝

此項(xiàng)研究是多學(xué)科團(tuán)隊(duì)的努力成果,其中包括軟件工程師、研究人員、臨床醫(yī)生和后勤支持人員。此項(xiàng)目的主要貢獻(xiàn)者包括 Kunal Nagpal、Davis Foote、Yun Liu、Po-Hsuan (Cameron) Chen、Ellery Wulczyn、Fraser Tan、Niels Olson、Jenny L. Smith、Arash Mohtashamian、James H. Wren、Greg S. Corrado、Robert MacDonald、Lily H. Peng、Mahul B. Amin、Andrew J. Evans、Ankur R. Sangoi、Craig H. Mermel、Jason D. Hipp 和 Martin C. Stumpe。我們還要感謝 Tim Hesterberg、Michael Howell、David Miller、Alvin Rajkomar、Benny Ayalew、Robert Nagle、Melissa Moran、Krishna Gadepalli、Aleksey Boyko 和 Christopher Gammage。最后,如果沒(méi)有為此項(xiàng)研究注釋數(shù)據(jù)的病理學(xué)家的幫助,這個(gè)項(xiàng)目也不會(huì)成功。



參考文獻(xiàn)

  • 中樞和局部病理學(xué)家在根治性前列腺切除術(shù)組織學(xué)評(píng)估中的觀察者間差異:TAX 3501 多國(guó)臨床試驗(yàn)發(fā)現(xiàn) (Interobserver Variability in Histologic Evaluation of Radical Prostatectomy Between Central and Local Pathologists: Findings of TAX 3501 Multinational Clinical Tria).?Netto, G. J.,Eisenberger, M.,Epstein, J. I. 和 TAX 3501 試驗(yàn)研究者.《泌尿?qū)W》(Urology)?77,1155–1160 (2011)

  • pT3 期前列腺癌輔助性放療與等待觀望的第 3 階段對(duì)比研究:病理回顧對(duì)分析的影響?(Phase 3 Study of Adjuvant Radiotherapy Versus Wait and See in pT3 Prostate Cancer: Impact of Pathology Review on Analysis).?Bottke, D.,Golz, R.,St?rkel, S., Hinke, A.,Siegmann, A.,Hertle, L.,Miller, K.,Hinkelbein, W.,Wiegel, T.《歐洲泌尿外科雜志》(Eur.Urol)?64,193–198 (2013)

  • 前列腺活檢和前列腺切除術(shù)樣本中定量 Gleason 分級(jí)的應(yīng)用?(Utility of Quantitative Gleason Grading in Prostate Biopsies and Prostatectomy Specimens). Sauter, G.,Steurer, S.,Clauditz, T. S.,Krech, T.,Wittmer, C.,Lutz, F.,Lennartz, M.,Janssen, T.,Hakimi, N.,Simon, R.,von Petersdorff-Campen, M.,Jacobsen, F.,von Loga, K.,Wilczak, W.,Minner, S.,Tsourlakis, M. C.,Chirico, V.,Haese, A.,Heinzer, H.,Beyer, B.,Graefen, M.,Michl, U.,Salomon, G.,Steuber, T.,Bud?us, L. H.,Hekeler, E.,Malsy-Mink, J.,Kutzera, S.,Fraune, C.,G?bel, C.,Huland, H.,Schlomm, T.《歐洲泌尿外科雜志》(Eur.Urol) 69,592–598 (2016)



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    總結(jié)

    以上是生活随笔為你收集整理的深度学习,提高前列腺癌诊断正确率的全部?jī)?nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。

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