【数据可视化应用】绘制森林图(附Python和R语言代码)
生活随笔
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【数据可视化应用】绘制森林图(附Python和R语言代码)
小編覺(jué)得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.
森林圖(Forest Plot)的簡(jiǎn)單介紹
森林圖(Forest Plot) 常用于Meta分析結(jié)果展示使用。森林圖(可以將觀察到的效果、置信區(qū)間以及每個(gè)研究對(duì)象的權(quán)重等信息全部表示出來(lái),是一種簡(jiǎn)單直觀地展示單一研究和匯總研究的可視化圖表。下面,小編再附上森林圖各個(gè)繪圖元素間關(guān)系的解釋圖:
Key Elements of the Forest plot
下面就介紹下如何使用R和Python繪制森林圖(Forest Plot),可視化結(jié)果可能會(huì)有所不同。
R-森林圖(Forest Plot)繪制方法
使用R繪制森林圖(Forest Plot)的方法比較多,這里重點(diǎn)介紹R-forestplot包和R-ggforestplot包繪制。
「注意」:安裝R-ggforestplot包之前,確保broom包已安裝,否則可能會(huì)安裝出錯(cuò)。
R-forestplot包繪制
這一部分我們直接使用提供的數(shù)據(jù)進(jìn)行繪制,重點(diǎn)在于展示forestplot包中一些繪圖參數(shù)的設(shè)置。
「樣例一」:
library(tidyverse) library(forestplot) library(meta) # 構(gòu)建數(shù)據(jù)集 cochrane_from_rmeta <- structure(list( mean = c(NA, NA, 0.578, 0.165, 0.246, 0.700, 0.348, 0.139, 1.017, NA, 0.531), lower = c(NA, NA, 0.372, 0.018, 0.072, 0.333, 0.083, 0.總結(jié)
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