R實戰 | 森林圖繪制

回答一下2022年VIP群里會員的問題。簡單的森林圖繪制。

Multivariate logistic regression determined independent candidate diagnostic biomarkers.

Ref：He S, Deng Z, Li Z, et al. Signatures of 4 autophagy-related genes as diagnostic markers of MDD and their correlation with immune infiltration. J Affect Disord. 2021;295:11-20. doi:10.1016/j.jad.2021.08.005

森林圖

森林圖是一種簡單直觀地展示單一研究和匯總研究的圖形，廣泛應用于薈萃分析、觀察研究和臨床試驗中。

Odds ratio(OR)

在病例對照研究（case-control study）中，分析暴露風險因素與疾病（或者用藥）的關聯程度；主要是反映暴露與疾病之間關聯強度的指標，OR常適用于病例對照研究，也可以運用于前瞻性的研究（當觀察時間相等時）

OR值的統計學意義：

• OR>1，暴露與疾病的危險度增加，兩者呈正相關

• OR<1，暴露與疾病的危險度減少，兩者呈負相關

• OR=1，暴露與疾病的危險度無關，兩者呈不相關

繪制

library(survival) library(survminer) library(eoffice)?#導出ppt用#?構建模型 #?以colon數據為示例數據 #?時間變量是time，結局變量是status，自變量選擇?sex，rx和?adhere model?<-?coxph(?Surv(time,?status)?~?sex?+?rx?+?adhere,data?=?colon?) #?森林圖 ggforest(model,??#coxph得到的Cox回歸結果data?=?colon,??#數據集main?=?'Hazard?ratio?of?colon',??#標題cpositions?=?c(0.05,?0.15,?0.35),??#前三列距離fontsize?=?1,?#字體大小refLabel?=?'reference',?#相對變量的數值標簽，也可改為1noDigits?=?3?#保留HR值以及95%CI的小數位數 )

參考

GitHub - cardiomoon/autoReg: R package autoReg

木舟筆記2022年度VIP企劃

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跟著Nat Commun學作圖 | 4.配對箱線圖+差異分析

跟著 Nat Med. 學作圖 | GSVA+limma差異通路分析+發散條形圖

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總結

以上是生活随笔為你收集整理的R实战 | 森林图绘制的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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