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编程问答

【转载】生物软件之DNA分析

發布時間:2023/12/15 编程问答 37 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 【转载】生物软件之DNA分析 小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.

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DNA分析????????????
JaMBW 1.1 分子生物學軟件包。
ANNHYB 4.938 用來幫助進行PCR引物設計與基因探針設計的軟件。
Chromas 2.32 ABI格式文件顯示與編輯軟件。
DNAProbe 核苷酸序列設計工具。
DnaSP 4.10.9 基因多態性分析軟件。
DFW 2.51 trail DNA分析軟件。
Artemis R9 以Java語言寫成的序列查看工具。
ACT R6 以Java語言寫成的序列比較查看器。
GDA 1.1 主要用來進行不連續基因數據的統計分析。
Sequencher 4.7 Demo 序列拼接軟件。
MeltCalc 2.06 自動計算DNA序列熱力學數據的Excel電子表格宏軟件。
ConsInspector 3.3 DNA蛋白結合位點預測識別軟件。
GenomePixelizer 2003.10.1版 幫助理解基因組中的簇基因(clustering gene)之間的相互關系的軟件。
Gene Construction Kit 2.5 Demo 管理并顯示克隆策略中的分子構建過程軟件。
GenescanView 1.2 查看基因掃描(genescan)格式.fsa文件的小軟件。
Sequin 7.77 數據庫GenBank, EMBL, DDBJ 查詢軟件。
DNAuser 1.0 DNA序列處理軟件。
GenomeComp 1.3 中科院生物物理所生物信息實驗室推出的可視化的微生物基因組比較工具
Apollo 1.6.5 Java語言開發的基因組注釋顯示編輯軟件
SNPHunter 1.75 SNP(單核苷酸多態性)查找軟件。
SSRHunter 1.3 SSR(Simple Sequence Repeat,即簡單序列重復,又稱微衛星DNA)位點查找軟件。
iCE 3.5 Java語言編寫的顯示基因指紋圖及相關數據的軟件
MB6.84 免費的DNA分析軟件
FinchTV 1.4 免費的DNA圖譜分析軟件;
Sequence Scanner v1.0 顯示分析ABI基因分析儀DNA圖譜數據軟件,
CodonCode Aligner 2.0.1 DNA測序trace圖編輯、突變分析、contig編輯、序列拼接軟件。
WinGene 2.31 分析核酸序列的多用工具軟件;
BioLign 4.0.6 還增加免費序列拼接軟件;
PIC_Calc 0.6 多態信息含量計算程序。
SequenceViewer 1.0 DNA序列圖形顯示軟件;
SERIAL CLONER 1.2 DNA序列分析工具軟件
Xplorer 2.4.2 DNA圖譜查看分析軟件
生物化工  
brd.zip 生物反應器(發酵罐)設計軟件。
BioStat 4.3 BioStat B發酵罐控制程序。
PenSim v2.0 青霉素發酵模擬軟件。
BioProSim 4.0 發酵實時模擬軟件。
SuperPro Designer 6.0評估版 計算機輔助設計特別是生物工藝設計的軟件包。
FRAE 2.01 發酵記錄分析專家。
進化分析  
phylip 3.65 進化樹分析軟件,并可繪制進化樹。
TreeView 1.6.6 進化樹處理軟件。
GeneTree 1.3 比較基因與種系進化樹的程序。
NDE 0.5.0 用來編輯NEXUS格式文件的程序。
TreeMap 1.0 用來可視地比較主、從進化樹的程序。
Spectrum 分析進化信息而不用將之轉化為進化樹的軟件。
Phyltools 1.32 計算與處理進化樹數據的軟件。
tree-puzzle 5.2 核酸序列、蛋白序列相似性分析及進化樹構建工具。
ATV 1.92 JAVA語言編寫的顯示"New Hampshire"與NHX格式的進化樹文件軟件。
TREECON 1.3b Demo 構建和繪制進化樹的軟件包。
ProBiosys 0.9 比較表現型分類法數據和分析計算核酸序列數據距離值的軟件。
COMPONENT 2.0 分析進化樹免費軟件。
NJplot 小巧的顯示進化樹的免費軟件NJplot。
MEGA 4.0 免費分子進化遺傳分析軟件
PAUP 4 PAUP的快速使用手冊
TreeSAAP 3.2 蛋白序列進化分析軟件;
mesquite 2.0 進化分析軟件
PAL 1.51 進化分析java程序庫;
Vanilla 1.2 使用PAL編寫的進化分析命令行程序;
SplitsTree 4.8 JAVA程序編寫的分析和顯示進化數據軟件;
TCS 1.21 JAVA程序所寫的進化網絡分析軟件;
GEODIS 2.5 進化分析軟件;
RDP 3b22 重組分析軟件
FastME 1.0 快速精確的進化樹軟件;
REAP DOS下的進化分析軟件包;
T-REX 4.01 進化樹構建分析軟件;
FSTAT 2.9.3.2 基因差異分析軟件;
ProfDist 0.9.7 構建大進化樹軟件
STC 1.2 新的算法構建進化分析軟件,
SymmeTREE 命令行差異分析軟件
Phylogenetic Visualization tool 進化樹顯示工具
TREEFINDER 200706版 計算進化分析軟件
PHASE 2.0 序列進化分析軟件;
BAMBE 2.01b 分子生物進化分析軟件;
MODELTEST 3.7 核苷酸替換DNA進化最優模型分析軟件
MTgui 1.5 MODELTEST圖形操作介面軟件
Clann 3.02 以色列科學家編寫進化樹分析軟件;
Phylogenetic Independence 2.0 進化獨立性分析軟件 ;
Jevtrace2 v3.12b JAVA語言寫的進化分析軟件;
NimbleTree 2.6 建立進化樹軟件;
Phyl-O-Gen 1.1 構建進化樹軟件;
BEAST 1.4.6 貝葉斯進化分析軟件
MESA 1.9.23 宏進化分析和模擬軟件;
TreeJuxtaposer 2.1 進化樹比較分析軟件;
TreeExplorer 2.12 進化樹繪制顯示軟件;
TreeMe 03/2007 進化樹生成和顯示軟件;
DNATREE 1.2 DNA序列進化分析軟件
Genie 3.0 系譜間隔分析軟件
Pebble v1.0 進化分析軟件;
ArboDraw 進化樹繪圖軟件
PhyloDraw 0.82 進化樹繪圖軟件.
MrBayes 3.1.2 進化樹分析軟件;
Network 4.201 進化樹生成軟件;
PhyDE 0.993 進化數據編輯器;
PRAP 1.21 Parsimony ratchet分析軟件
圖像處理  
Image Tool 3.0 科學用途的處理圖像軟件。
Image J 1.38 用Java語言寫成的科學用途的處理圖像軟件。
Cross Checker 2.91 基因指紋圖分析軟件。
ALFmap 1.22 ALF (Amersham Pharmacia) 圖像格式轉換軟件。
Band Leader 3.0 凝膠圖像處理軟件。
Scion Image 4.03 圖像處理與分析工具。
OSIRIS 4.19 通用醫學圖像處理與分析軟件。
Melanie Viewer 6.0 免費Melanie圖像查看器。
TotalLab v2006c 評估版 圖像分析軟件。
LabImage 2.71 評估版 凝膠圖像分析軟件。
QuantiScan 3.0 Demo 使用簡單功能專一的凝膠掃描、分析軟件。
Engauge Digitizer 4.1 圖形數字化軟件。可以將曲線圖轉化為數據與等式。
Graph Digitizer version 2.16 圖形數字化軟件。
Peak Explorer 2.11 處理試驗圖譜圖像軟件。
電泳圖譜繪制器1.0 處理電泳圖譜圖像軟件。
Volocity LE 4.2.1 免費顯微圖像處理軟件。
GetData 2.22 圖像數字化處理軟件。
Bersoft Image Measurement 5.1 圖像數字化處理軟件。
DigitizeIt 1.5 圖像數字化處理軟件。
CellC v1.11 微生物顯微圖像處理軟件。

http://www.helixnet.cn/bbs/forum-69-1.html

總結

以上是生活随笔為你收集整理的【转载】生物软件之DNA分析的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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