“福利公告：為了響應學員的學習需求，經過易生信培訓團隊的討論籌備，現決定安排擴增子16S分析、宏基因組、Python課程線上直播課。報名參加線上直播課的老師可在1年內選擇參加同課程的一次線下課 。期待和大家的線上線下相識。

• 轉錄組線上直播時間：2020/11/27-2020/11/29

• 宏基因組線上直播時間：2021/01/22-2021/01/24

• 擴增子線上直播時間：2020/12/04-2020/12/06

• 報名鏈接：http://www.ehbio.com/Training/index.php/Home/Index/index.html

”

常規轉錄組是我們最常接觸到的一種高通量測序數據類型，其實驗方法成熟，花費較低，是大部分CNS必備的技術，現在就如做個PCR一樣常見。而且分析思路簡潔清晰，是入門生信，學習生信分析思路和數據可視化的首選。

數據分析是相通的，通過一個簡單的課程理解其中的原理，就可以推而廣之，延伸到其它類型的數據分析，如擴增子、宏基因組、單細胞等。

第十一期?高級轉錄組分析和R數據可視化在于2020年11月27日在線開班，將系統講述基于和不基于比對的轉錄組分析流程，從原始數據到表達矩陣、差異基因、可變剪接、富集分析、加權共表達網絡、通路分析、可視化繪圖等一系列常見操作，理論和實踐兼備。

課程大綱

每節課1小時一個主題，理論結合實戰，學懂原理，實戰實操，全是老司機多年經驗和代碼的無私分享。下面是課程安排，如11代表第一天第一節課，26代表第二天第六節課，41為兩周后的線上集中視頻答疑。

編號內容簡介

01	預習Linux基礎	預付后提供學習視頻
02	預習R基礎	預付后提供學習視頻
03	軟件安裝	預付后提供安裝視頻
11	轉錄組概述	轉錄組設計、應用、批次效應等
12	轉錄組分析流程簡介	基于/不基于比對的分析流程講演
13	Salmon定量實戰	不基于比對直接定量基因和轉錄本的表達
14	差異基因分析	DESeq2多組差異基因分析和結果可視化
15	GO富集分析和可視化	泡泡圖、熱圖、網圖
16	GSEA富集分析和可視化	分組和時間序列GSEA
21	二代三代測序原理介紹	建庫測序過程及注意事項
22	R基礎	數據讀寫、處理、轉換
23	R數據可視化	16種常見圖形繪制實戰
24	Linux基礎	詳細解釋Linux代碼和文件格式轉換
25	轉錄組環境配置	Linux下軟件安裝、配置
26	文章常見圖表繪制和解讀	Illustrator制作CNS標準圖版
31	可變剪接分析	STAR，StringTie，rMATS，IGV
32	可變剪接分析	STAR，StringTie，rMATS，IGV
33	WGCNA基因加權共表達	網絡分析和性狀關聯
34	Cytoscape繪制	共表達網絡和調控通路網絡圖
35	每人一個問題環節	自評學習效果、知識點回顧
41	答疑-線上	答疑、考試內容串講

該課程為第12期，整個過程都比較成熟，可以在最短時間學習最多知識。

往期評價

教程內容簡介如下：

轉錄組的應用、設計和案例分享

轉錄組學研究技術介紹

轉錄組學實驗設計和測序原則、注意事項

二代、三代測序過程和原理解析

轉錄組學文章案例分析

在線基因表達資源數據庫

轉錄組分析流程實戰

轉錄組分析流程評估

測序數據質量評估和清洗

不基于比對的差異基因分析

基于比對的差異基因分析

轉錄本組裝和選擇性剪接分析

目標基因GSEA/GO富集分析

轉錄組高級分析

WGCNA基因共表達分析

WGCNA基因、表型關聯分析

Cytoscape 共表達網絡繪制

轉錄組常見圖形在線繪制

KEGG/Reactome通路圖繪制，表達映射

基因互作的文獻挖掘和數據庫挖掘展示

常見圖表解讀和圖形編輯排版

在培訓上，結合發表高水平文章，進一步講解16種常用分析圖的原理和使用范圍，讓你不僅讀懂圖，更知道如何應用于自己的研究，并親自輕松完成繪圖。

針對大家使用R語言繪圖學習時間成本較高的問題，易生信團隊針對常用16種圖開發了免費繪圖網站，一鍵出圖，更可鼠標點選參數修改圖形的個性樣式。

成果發表是科研過程中不可缺的一部分，發表成果又少不了圖形展示。文章圖表排版是否整齊規范、協調一致、重點突出對一篇文章的發表也是有不少貢獻的。之前推出的文章發表圖的修改和排版講演了部分圖形編輯和排版操作，本次培訓也會實踐從原始圖形、到細節修飾再到排版發表的整個過程和注意事項?；蚪M瀏覽器用于多組學數據的可視化和關聯分析，本地有IGV，在線有UCSC genome Browser和Epigenomebrowser，各有特色。

生信基礎知識

Linux/Windows下Rstudio和Linux命令的使用

Linux/Windows下轉錄組分析流程的搭建

生物學家必要掌握的Shell和R語言基礎知識。

這個為生信學習和生信作圖打造的開源R教程真香！！！

這個為生信學習打造的開源Bash教程真香！！(目錄更新)！

(如果基礎薄弱，報名付款成功后，可免費領取基礎程序課，做好準備工作, 讓程序成為我們的得力工具而不是學習新知識的絆腳石。)

授課模式

本課程以講解流程和實際操作為主，采用獨創四段式教學，封裝好的代碼全部分享，隨處可用：

• 第一階段 3天集中授課；

• 第二階段 自行練習2周；

• 第三階段 在線直播答疑；

• 第四階段 培訓視頻繼續學習；

• 實現教-練-答-用四個環節的統一協調。

培訓時間

每天早9點到晚5點

授課地點 (暫定，鼓樓附近)

北京市西城區鼓樓附近(鼓樓地鐵站周邊1公里)。

課程價格

開課兩周前報名?4500?元/人 (報名官網查看更多優惠)

名額有限，每次課程報名滿40人后自動關閉報名通道

提供易漢博基因科技實習機會或工作機會

課程福利

座位按報名并繳費或預付款成功順序從前到后龍擺尾式排序

贈送價值99元程序基礎課一份 (http://bioinfo.ke.qq.com)

多人 (N，10>N>1) 組團報名并同時繳費，每人還可減免N-1百元 (最高500)

贈送金士頓U盤一個(32G含培訓數據和腳本)

附推薦與分享對應的招生信息到朋友圈，截圖發到train@ehbio.com 可獲得200元生信寶典騰訊課堂課程優惠券(可拆分供多個課程使用)

易生信同時推出多門相關課程，連報優惠——同時選2門課，95折；三門課9折，4門及以上85折。還可與團購同時優惠！擴增子(項目初探)+宏基因組(高精尖)，祝你分析水平更上一層樓。

復制以下鏈接
http://www.ehbio.com/Training/ 或
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總結

以上是生活随笔為你收集整理的宏转录组方法_高级转录组分析和R语言数据可视化第十二期 （线上线下同时开课）...的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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