參考：生信技能樹

# 每次運行前，激活創(chuàng)建的小環(huán)境rnaconda activate rna

1。搜索hista2 download

2。同樣找到linux版本，右鍵復(fù)制下載鏈接

3。下載到創(chuàng)建的文件夾 install-packages里

wget -c ftp://ftp.ccb.jhu.edu/pub/infphilo/hisat2/downloads/hisat2-2.1.0-Linux_x86_64.zip

-c 斷點續(xù)傳

4。解壓

查看解壓出的東西

5。mv移動文件到 biosoft(自己創(chuàng)建)里

cd進入biosoft目錄，ls查看，確實有hisat2

路徑形式調(diào)用 幫助命令

怎么樣才能不加路徑呢，就可以調(diào)用命令呢？

6。添加到PATH

追加到>>

echo 'export PATH="/home/teach/biosoft/hisat2-2.1.0/:$PATH" '>> ~/.bashrcsource ~/.bashrc #重新激活，才生效

1。搜索samtools

官網(wǎng) http://www.htslib.org/download/?

2。復(fù)制下載鏈接

3。下載

4。用tar解壓? tar -jxvr?解壓 更規(guī)范，雖然截圖沒這么寫

進入查看

5。編譯三部曲

??./configure?--prefix=

make

make install

編譯成功后，

可以看到biosoft/samtools-1.10/bin文件夾下有samtools

6。添加到PATH

help一下 就可以調(diào)用軟件了

1。搜索Trimmomatic

http://www.usadellab.org/cms/?page=trimmomatic?

2。復(fù)制下載鏈接

3。下載

4。解壓

5。mv移動文件到 biosoft(自己創(chuàng)建)里

6。

【生信技能樹】生信人應(yīng)該這樣安裝軟件

https://www.bilibili.com/video/av28836717

生物信息學(xué)常見1000個軟件的安裝代碼！

http://www.biotrainee.com/thread-856-1-1.html

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的linux 安装软件_Linux：其它软件安装方式的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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