學(xué)習(xí)筆記，僅供參考，有錯(cuò)必糾

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從GitHub中下載R包

這里，我們將介紹兩種下載并加載R包的方式，即通過(guò)在線安裝和本地安裝。

在線安裝

我們?cè)谑褂迷诰€安裝的方法時(shí)，可能會(huì)遇到各種各樣的問(wèn)題，這里，我們?cè)囍螺d2種R包，來(lái)盡量詳細(xì)的闡述這個(gè)問(wèn)題。

• JuliaCall包

首先，我們需要安裝devtools包：

install.packages("devtools")

如果我們想要下載https://github.com/Non-Contradiction/JuliaCall下的R包(項(xiàng)目名為:JuliaCall, 開(kāi)發(fā)者名為:Non-Contradiction)，可以敲入如下代碼：

devtools::install_github("Non-Contradiction/JuliaCall")

這時(shí)，報(bào)了個(gè)錯(cuò)：

Error: Failed to install 'JuliaCall' from GitHub:Could not find tools necessary to compile a package Call `pkgbuild::check_build_tools(debug = TRUE)` to diagnose the problem.

按照提示信息，我安裝了一個(gè)Rtools：下載地址

安裝完后，再執(zhí)行上述代碼：

> devtools::install_github("Non-Contradiction/JuliaCall") Downloading GitHub repo Non-Contradiction/JuliaCall@HEAD These packages have more recent versions available. It is recommended to update all of them. Which would you like to update?1: All 2: CRAN packages only 3: None 4: mime (0.8 -> 0.9 ) [CRAN] 5: xfun (0.11 -> 0.15 ) [CRAN] 6: Rcpp (1.0.3 -> 1.0.5) [CRAN] 7: knitr (1.26 -> 1.29 ) [CRAN]Enter one or more numbers, or an empty line to skip updates:2 stringi (NA -> 1.4.6) [CRAN] mime (0.8 -> 0.9 ) [CRAN] xfun (0.11 -> 0.15 ) [CRAN] Rcpp (1.0.3 -> 1.0.5) [CRAN] knitr (1.26 -> 1.29 ) [CRAN] Installing 5 packages: stringi, mime, xfun, Rcpp, knitrThere is a binary version available but the source version is later:binary source needs_compilation Rcpp 1.0.4.6 1.0.5 TRUEtrying URL 'https://mirrors.nju.edu.cn/CRAN/bin/windows/contrib/3.6/stringi_1.4.6.zip' Content type 'application/zip' length 15310634 bytes (14.6 MB) downloaded 14.6 MBtrying URL 'https://mirrors.nju.edu.cn/CRAN/bin/windows/contrib/3.6/mime_0.9.zip' Content type 'application/zip' length 48395 bytes (47 KB) downloaded 47 KBtrying URL 'https://mirrors.nju.edu.cn/CRAN/bin/windows/contrib/3.6/xfun_0.15.zip' Content type 'application/zip' length 229980 bytes (224 KB) downloaded 224 KBtrying URL 'https://mirrors.nju.edu.cn/CRAN/bin/windows/contrib/3.6/Rcpp_1.0.4.6.zip' Content type 'application/zip' length 3030916 bytes (2.9 MB) downloaded 2.9 MBtrying URL 'https://mirrors.nju.edu.cn/CRAN/bin/windows/contrib/3.6/knitr_1.29.zip' Content type 'application/zip' length 1436187 bytes (1.4 MB) downloaded 1.4 MBpackage ‘stringi’ successfully unpacked and MD5 sums checked Error: Failed to install 'JuliaCall' from GitHub:(converted from warning) cannot remove prior installation of package ‘stringi’

發(fā)現(xiàn)報(bào)錯(cuò)，現(xiàn)在我們把原本的stringi包刪掉，重新下載stringi包，運(yùn)行代碼，又報(bào)了如下錯(cuò)誤：

(converted from warning) cannot remove prior installation of package ‘Rcpp’

我再次將Rcpp包刪除，并重新下載Rcpp包，運(yùn)行代碼，遇到下面的對(duì)話框，我選擇是：

下載完畢，導(dǎo)入成功：

library(JuliaCall)

• gapminder包

我們從GitHub上下載gapminder包：

devtools::install_github("jennybc/gapminder")

報(bào)錯(cuò)：

Error: Failed to install 'devtools' from GitHub:schannel: failed to receive handshake, SSL/TLS connection failed

現(xiàn)在，有如下解決方案：解決 devtools::install_github 的 SSL/TLS connection failed 問(wèn)題

我們?cè)囍眠@種方案，解決這個(gè)問(wèn)題。

首先，在Git Bash中敲入如下代碼：

git config --global http.sslBackend "openssl" git config --global http.sslCAInfo F:\software\R-3.6.2\library\openssl\cacert.pem

再次運(yùn)行代碼，發(fā)現(xiàn)又報(bào)出了如下錯(cuò)誤：

(converted from warning) cannot remove prior installation of package ‘ellipsis’

么得辦法，遇到該問(wèn)題，可以刪除該包，并重新下載。

在這里，我為了防止一些列麻煩，干脆把所有以安裝的R包更新一遍，并再次運(yùn)行代碼，對(duì)gapminder包進(jìn)行下載。

最后，下載完畢，導(dǎo)入成功：

library(gapminder)

• 注意事項(xiàng)

在線安裝的過(guò)程中，可能會(huì)遇到各種各樣的錯(cuò)誤，大家可以查閱各種資料，耐心解決。

本地安裝

• 如何下載GitHub項(xiàng)目到本地呢？

我們可以從GitHub上clone一個(gè)項(xiàng)目，也可以下載R的zip包，但是從GitHub上clone一個(gè)項(xiàng)目是真的慢…

這里，說(shuō)一句題外話，我們先來(lái)熟悉一下如何利用碼云從GitHub上clone一個(gè)項(xiàng)目，再學(xué)習(xí)如何加載R包。

利用碼云clone一個(gè)項(xiàng)目

打開(kāi)碼云，點(diǎn)擊從GitHub導(dǎo)入倉(cāng)庫(kù)：

將項(xiàng)目的url填入，并點(diǎn)擊網(wǎng)頁(yè)下方的導(dǎo)入：

很快，項(xiàng)目就被導(dǎo)入到碼云上了：

現(xiàn)在，我們打開(kāi)Git Bash，從碼云上clone項(xiàng)目：

git clone https://gitee.com/goatbishop/efficientR.git

現(xiàn)在，它彈出一個(gè)用戶名密碼框，我們填入碼云的用戶名和密碼，點(diǎn)擊確定：

開(kāi)始clone了，可以看到速度非常迅速：

Cloning into 'efficientR'... remote: Enumerating objects: 9330, done. remote: Counting objects: 100% (9330/9330), done. remote: Compressing objects: 100% (2266/2266), done. remote: Total 9330 (delta 7018), reused 9330 (delta 7018), pack-reused 0 Receiving objects: 100% (9330/9330), 60.73 MiB | 8.03 MiB/s, done. Resolving deltas: 100% (7018/7018), done.

現(xiàn)在，我們已經(jīng)完成了項(xiàng)目的下載了。

下載zip文件加載R包

回到正題，我們下載一個(gè)R壓縮包，并利用devtools包，對(duì)其進(jìn)行加載。

現(xiàn)在，我們?cè)囍螺dpipR包，我采用和上面相同的步驟，直到clone那一為止，我們不要在Git Bash中clone這個(gè)項(xiàng)目，而是在碼云上直接下載該壓縮包到本地：

現(xiàn)在，我需要將本地的R包所在地址作為參數(shù)，輸送給devtools包下的install_local函數(shù)：

devtools::install_local("F:\\temp_download\\pipeR-master.zip")

pipR包導(dǎo)入成功：

library(pipeR)
創(chuàng)作挑戰(zhàn)賽新人創(chuàng)作獎(jiǎng)勵(lì)來(lái)咯，堅(jiān)持創(chuàng)作打卡瓜分現(xiàn)金大獎(jiǎng)

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的R语言观察日志(part13)--从GitHub中下载R包的全部?jī)?nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。

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