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關(guān)鍵詞:神經(jīng)元提示;神經(jīng)元跟蹤;自適應(yīng)射線發(fā)射模型

備注：…不知道在說啥

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3D neuron tip detection in volumetric microscopy images using an adaptive ray-shooting model

摘要

3D神經(jīng)元提示可以作為神經(jīng)元追蹤應(yīng)用的種子點。在此基礎(chǔ)上，提出了一種射線發(fā)射模型，通過分析神經(jīng)元尖端候選點附近的強度分布來檢測神經(jīng)元尖端。然而，該模型中需要考慮的射線的長度和z -切片的數(shù)量是固定的經(jīng)驗數(shù)字，因此它不能處理神經(jīng)元直徑變化很大的挑戰(zhàn)性數(shù)據(jù)集。

本文提出了一種自適應(yīng)射線發(fā)射模型，根據(jù)多模板快速移動(MSFM)方法獲得的神經(jīng)元的局部直徑，改變發(fā)射射線的長度和相鄰切片的數(shù)目。

實驗結(jié)果表明，在具有挑戰(zhàn)性的數(shù)據(jù)集上，該方法可以將檢測正確率提高10%左右。

簡介

在神經(jīng)生物學研究中，在大數(shù)據(jù)集的體積顯微圖像上進行三維神經(jīng)元重建(神經(jīng)追蹤)對于理解大腦回路如何工作至關(guān)重要[1 - 3,39]。神經(jīng)元示蹤方法是基于神經(jīng)元具有分支樹結(jié)構(gòu)這一事實，然后重建神經(jīng)元網(wǎng)絡(luò)的問題可以歸結(jié)為確定神經(jīng)元分支的去向以及它們?nèi)绾芜M一步分支成更細的分枝。

現(xiàn)有的大多數(shù)神經(jīng)元追蹤方法[1,3,5]都需要一組理想的種子。最直觀的種子點是神經(jīng)元結(jié)構(gòu)的起始點和結(jié)束點，即神經(jīng)元尖端(如圖1所示)。一旦給出神經(jīng)元尖端，許多神經(jīng)元追蹤工具，如Va

總結(jié)

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