關于圖表的組合排版，在之前的微信文章中介紹過很多常規的方法，比如《繪制復雜組合圖表的獨家秘笈分享》、《如何用Graphpad Prism繪制超復雜組合圖？》、《如何用Origin完成圖表排版？》等。可是，有小伙伴就問了，正如小項羽所言，“劍一人敵，不足學，學萬人敵”，那么有沒有批量自動化拼圖的方法？既然是批處理，就免不了需要寫腳本，這里推薦兩個專職拼圖的R包：cowplot和patchwork，二者在很多地方都很相似，下面我們就一起比較、學習下如何使用這兩個R包實現圖表的批量組合、嵌套、對齊、畫中畫、自動化加標簽、圖例合并等操作。#先使用ggplot2繪制4個范例圖表，數據為R自帶的mtcars數據集；
library(ggplot2)
head(mtcars)

p1?p1p2?"skyblue")
p2
p3???theme(axis.text.x = element_text(size = 10, angle = 60, vjust = 0.5))
p3
p4?"skyblue") + facet_wrap(~cyl)
p4#載入patchwork包；library(patchwork)#載入cowplot包；library(cowplot)

整合多個圖表?

patchwork：#使用“+”操作符組合圖表；p?p

#patch可以自動添加圖表標簽；p+plot_annotation(tag_levels = 'A',tag_suffix='.')#tag_levels：'a' 小寫字母, 'A' 大寫字母, '1' 數字, 'i' 小寫羅馬數字, 'I' 大寫羅馬數字；#tag_prefix和tag_suffix設置序號的前后綴字符 ；

cowplot：#使用plot_grid()函數組合圖表；plot_grid(p1, p2, p3, p4)

#cowplot也可自動添加編號標簽；plot_grid(p1, p2, p3, p4,labels = "AUTO")#調整標簽的字體大小(默認14)、樣式、顏色等；plot_grid(p1, p2, p3, p4,labels = c('A.', 'B.','C.', 'D.'),label_size?= 12,label_fontfamily?= "serif",label_fontface?= "plain",label_colour?= "black")

通過比較組合效果可以發現，默認情況下，二者會保持拼圖結果為正方形；patchwork有自動對齊圖形區域的功能，而cowplot的組合效果更緊湊。

指定排列順序

patchwork：#cowplot主要使用nrow 和 ncol兩個參數確定排列方式,并“逐行”填充；plot_grid(p1, NULL, p2,p3, ncol = 2,align = "hv")

cowplot：#cowplot主要使用nrow 和 ncol兩個參數確定排列方式：plot_grid(p1, NULL, p2,p3,labels = "AUTO", ncol = 2)

設置拼圖比例

patchwork：#設置寬高比例；pp?pp?+ plot_layout(widths = c(3, 1), heights = c(3,1))

cowplot：

#設置寬高比例；類似的使用rel_widths 和 rel_heights 設置圖表的相對大小；plot_grid(p2, p3, p1, NULL, rel_widths = c(1.5, 1),rel_heights=c(2,1))

嵌套拼圖

patchwork：patchwork提供了兩個操作符來直接實現不同圖表的嵌套拼接。#|：將這些圖橫向排列，/：將圖表豎向堆疊(豎排優先級高于橫排)；p1?| (p2 / p3)
(p2?| p3 )/ (p1 | plot_spacer())

cowplot：#“手工”嵌套；bottom_row?bottom_rowplot_grid(p1, bottom_row, ncol = 2)

指定對齊方式

patchwork：#拼圖時自動對齊；p1?+ p2 + p3 + p4

#Tips:獲取維度信息；p3_dims?p1_aligned?p3p1_aligned#注意p1_aligned無法和其他圖表組合；cowplot：#使用plot_grid()函數的align參數使網格線和坐標軸對齊；#可組合使用：align = "vh"` 或 `align = "hv"plot_grid(p1, p3, ncol = 2, align = "h")#垂直對齊失敗；plot_grid(p1, p3, nrow = 2, align = "v")#坐標軸范圍不一致時,可以對齊坐標軸；#組合關系："t" (top), "r" (right), "b" (bottom), and "l" (left)；plot_grid(p1, p2, p3, p4, nrow = 2, align = "v", axis = "tlbr")

合并圖例

patchwork：#如果圖例顏色、樣式不同，會同時保留；p1?+ p2 + p3 + p4 +plot_layout(guides = 'collect')

(p2?/ p3 + plot_layout(guides = 'collect')) | p1
((p2?/ p3 + plot_layout(guides = 'auto')) | p1) + plot_layout(guides = 'collect')

默認guides = 'auto',當guides = 'collect'時合并圖例，當guides = 'keep'時強制將圖例置于原圖旁。cowplot：#對于cowplot，需先繪制無圖例的組合圖；p3a?"none")
plot2?plot2

#提取圖例；
legend?#將圖例組合進來；
plot_grid(plot2, legend, rel_widths = c(3, 0.5))

#同樣的方法，可以將圖例加到底部；legend_b?"bottom"))
plot_grid(plot2, legend_b, nrow = 2,rel_heights = c(3, 0.5))

畫中畫效果

patchwork：#inset_element()指定相對位置插入圖形；#align_to ='panel' (默認), 'plot', 'full';p1?+ inset_element(p2, left = 0.6, bottom = 0.6, right = 1, top = 1,align_to?= 'panel', ignore_tag = TRUE)+theme_cowplot(10)#這里使cowplot的theme_cowplot()主題，字體為10號；

cowplot：#先應用主題；p2a?#使用draw_plot()函數在指定的位置添加圖形；ggdraw(p1) + draw_plot(p2a, x=0.58, y=0.58, width =0.4, height =0.4)

#可以加上標簽；ggdraw(p1 +theme_half_open(14)) + draw_plot(p2a, x=0.58, y=0.58, width =0.4, height =0.4) +draw_plot_label(c("A", ""),c(0, 0.45),c(1, 0.95),size = 15)

通過對這兩個R包的拼圖方法和效果比較，我可能更喜歡patchwork的一些，操作簡單更容易上手，好啦，今天的內容就分享到這里啦~

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總結

以上是生活随笔為你收集整理的双y轴如何合并图例_如何对图表批量组合、对齐、画中画、合并图例、自动化加标签。。。...的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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