前面寫了一篇生信人的自我修養(yǎng)：Linux 命令速查手冊，有朋友覺得是為 IT 人員準備的。

科普任重而道遠，我還是用這篇文章解釋一下吧。

兩個方面的需求：

數(shù)據(jù)處理

服務(wù)器運維

數(shù)據(jù)處理方面的需求

1. 首先是必要需

生物信息學(xué)是真正的大數(shù)據(jù)專業(yè)，對計算資源要求較大，很多時候需要在服務(wù)器上分析數(shù)據(jù)，而 Linux 是最常用的服務(wù)器操作系統(tǒng)。

比如一個基因組組裝，需要 1 T 內(nèi)存，20 T 硬盤，你很容易就排除掉了 Windows 和 Mac 系統(tǒng)了是吧。

2. 其次是好用

Linux 為生產(chǎn)而生，所以在上面做數(shù)據(jù)分析肯定是很好的。Linux 有很多現(xiàn)成的小工具可以直接使用，比如 grep, sed, awk，非常方便。另外也可以寫腳本自動化執(zhí)行許多重復(fù)性的工作，這些都是 Windows / Mac 平臺沒法比的。

3. 行業(yè)共識

鑒于以上兩個原因，行業(yè)逐步達成了共識。人才往這方面培養(yǎng)，軟件往這方面開發(fā)。

人才方面，生信專業(yè)從考研開始，就要考 Linux 基礎(chǔ)知識。

軟件方面，很多生信軟件優(yōu)先開發(fā) Linux 版本，甚至只有 Linux 版本。

服務(wù)器運維方面的需求

愉快的大學(xué)生活就要結(jié)束了，你反復(fù)考慮，決定要讀研。經(jīng)過一段時間的挑燈夜戰(zhàn)，終于考上生物信息研究生。進入實驗室后。。。

你：老板，搞數(shù)據(jù)分析需要服務(wù)器啊。

老板：這是 5 萬塊。

然后你去電腦城，弄了臺 5 萬塊的服務(wù)器，開始搞分析。第二年，師弟師妹來了。。。

師弟師妹：老板，服務(wù)器不夠用。

老板：這里還有 5 萬塊。

然后你和師弟師妹一起又去電腦城搞了臺服務(wù)器。幾年下來，已經(jīng)有 4、5 臺服務(wù)器了，總不能為每一位同學(xué)都配一臺吧。

于是如何充分利用現(xiàn)有的計算資源，就成為了當(dāng)務(wù)之急。

大家上網(wǎng)苦苦搜索，發(fā)現(xiàn)一個叫做 SGE （Sun Grid Engine）的東西，可以把幾臺零散的服務(wù)器組成一個集群，用戶使用這個集群的所有計算機，就像使用一臺一樣。

這個光榮而艱巨的任務(wù)，當(dāng)然由你來干。集群弄好了，加個賬戶、添塊硬盤、排下錯誤，于是你久病成良醫(yī)，硬把自己折騰成了一個運維人員，要轉(zhuǎn)行也是分分鐘的事。

（以上故事純屬虛構(gòu)，如有雷同，實屬巧合。）

說完了實驗室的情況，再聊一聊企業(yè)。一般大型的生物信息公司，都有自己的計算集群，有專門的服務(wù)提供商（比如榮之聯(lián)）。此外，如果用阿里、華為這樣的云服務(wù)器，則運維的事情會少很多。

寫在最后

Linux 對于生信來說，運維不是剛需，但使用是剛需。生物信息學(xué)如何快速入門 Linux，請移步到下面這篇文章。

生信人的自我修養(yǎng)：Linux 命令速查手冊

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總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的科普任重而道远：生物信息为什么要学 Linux？的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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