日韩性视频-久久久蜜桃-www中文字幕-在线中文字幕av-亚洲欧美一区二区三区四区-撸久久-香蕉视频一区-久久无码精品丰满人妻-国产高潮av-激情福利社-日韩av网址大全-国产精品久久999-日本五十路在线-性欧美在线-久久99精品波多结衣一区-男女午夜免费视频-黑人极品ⅴideos精品欧美棵-人人妻人人澡人人爽精品欧美一区-日韩一区在线看-欧美a级在线免费观看

歡迎訪問 生活随笔!

生活随笔

當前位置: 首頁 > 运维知识 > linux >内容正文

linux

科普任重而道远:生物信息为什么要学 Linux?

發布時間:2023/12/20 linux 41 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 科普任重而道远:生物信息为什么要学 Linux? 小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.

前面寫了一篇生信人的自我修養:Linux 命令速查手冊,有朋友覺得是為 IT 人員準備的。

科普任重而道遠,我還是用這篇文章解釋一下吧。

兩個方面的需求:

  • 數據處理

  • 服務器運維

  • 數據處理方面的需求

    1. 首先是必要需

    生物信息學是真正的大數據專業,對計算資源要求較大,很多時候需要在服務器上分析數據,而 Linux 是最常用的服務器操作系統。

    比如一個基因組組裝,需要 1 T 內存,20 T 硬盤,你很容易就排除掉了 Windows 和 Mac 系統了是吧。

    2. 其次是好用

    Linux 為生產而生,所以在上面做數據分析肯定是很好的。Linux 有很多現成的小工具可以直接使用,比如 grep, sed, awk,非常方便。另外也可以寫腳本自動化執行許多重復性的工作,這些都是 Windows / Mac 平臺沒法比的。

    3. 行業共識

    鑒于以上兩個原因,行業逐步達成了共識。人才往這方面培養,軟件往這方面開發。

    人才方面,生信專業從考研開始,就要考 Linux 基礎知識。

    軟件方面,很多生信軟件優先開發 Linux 版本,甚至只有 Linux 版本。

    服務器運維方面的需求

    愉快的大學生活就要結束了,你反復考慮,決定要讀研。經過一段時間的挑燈夜戰,終于考上生物信息研究生。進入實驗室后。。。

    你:老板,搞數據分析需要服務器啊。

    老板:這是 5 萬塊。

    然后你去電腦城,弄了臺 5 萬塊的服務器,開始搞分析。第二年,師弟師妹來了。。。

    師弟師妹:老板,服務器不夠用。

    老板:這里還有 5 萬塊。

    然后你和師弟師妹一起又去電腦城搞了臺服務器。幾年下來,已經有 4、5 臺服務器了,總不能為每一位同學都配一臺吧。

    于是如何充分利用現有的計算資源,就成為了當務之急。

    大家上網苦苦搜索,發現一個叫做 SGE (Sun Grid Engine)的東西,可以把幾臺零散的服務器組成一個集群,用戶使用這個集群的所有計算機,就像使用一臺一樣。

    這個光榮而艱巨的任務,當然由你來干。集群弄好了,加個賬戶、添塊硬盤、排下錯誤,于是你久病成良醫,硬把自己折騰成了一個運維人員,要轉行也是分分鐘的事。

    (以上故事純屬虛構,如有雷同,實屬巧合。)

    說完了實驗室的情況,再聊一聊企業。一般大型的生物信息公司,都有自己的計算集群,有專門的服務提供商(比如榮之聯)。此外,如果用阿里、華為這樣的云服務器,則運維的事情會少很多。

    寫在最后

    Linux 對于生信來說,運維不是剛需,但使用是剛需。生物信息學如何快速入門 Linux,請移步到下面這篇文章。

    生信人的自我修養:Linux 命令速查手冊


    喜歡文章請點個“贊”吧!或者點擊“在看”讓更多朋友看到,點擊“閱讀原文”可以在知乎專欄上給我留言,博客地址:https://jianzuoyi.github.io

    總結

    以上是生活随笔為你收集整理的科普任重而道远:生物信息为什么要学 Linux?的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

    如果覺得生活随笔網站內容還不錯,歡迎將生活随笔推薦給好友。