最近因?yàn)轫?xiàng)目任務(wù)要分析心電圖數(shù)據(jù)，采用的是MIT-BIH開放數(shù)據(jù)庫(或稱PhysioBank數(shù)據(jù)庫)。這個數(shù)據(jù)庫不僅提供了經(jīng)過篩選的各方面的生理數(shù)據(jù)集PhysioBank，而且也提供了開源的數(shù)據(jù)處理和可視化工具PhysioToolkit。對我這樣的非醫(yī)學(xué)類學(xué)生而言，光是看見那些醫(yī)學(xué)術(shù)語就夠頭痛的了，還要掌握這樣一套專門的基于Linux的工具，確實(shí)是個不小的挑戰(zhàn)。好在我要完成的部分不需要很深入，所以馬馬虎虎也摸著些門道。不敢說會用，但是起碼碰到問題方向在哪我已經(jīng)清楚了，這里把這個數(shù)據(jù)庫的使用簡單介紹一下，方便新來的同學(xué)快速上手。當(dāng)然如果你英語好的話，大可以自己慢慢翻文檔，這也是要深入了解的惟一途徑。

首先說說數(shù)據(jù)庫。你可以到分類頁面查找有沒有自己感興趣的數(shù)據(jù)集，上面都有比較詳細(xì)的介紹。找到合適的數(shù)據(jù)后在對應(yīng)頁面直接將文件另存為就可以下載，當(dāng)然這是比較笨的辦法。推薦使用wget或者rsync來下載。wget可以用于下載單獨(dú)的數(shù)據(jù)集，這樣速度較快也比較快捷。例如下載mitdb：

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wget -r -np http://physionet.org/physiobank/database/mitdb/

中間的physionet.org可以替換成離你最近的鏡像地址(好像西交的掛了，直接用原鏡像吧)，mitdb替換成你要下載的數(shù)據(jù)集縮寫名稱(可以用PhysioBank

ATM查看數(shù)據(jù)集對應(yīng)縮寫)。rsync用來下載所有數(shù)據(jù)也是非常方便的，方法看這里，當(dāng)然這樣做似乎沒多大必要。

對應(yīng)這套數(shù)據(jù)集維護(hù)人員也開發(fā)了相應(yīng)的工具包WFDB,包括三個部分：WFDB庫、WFDB命令行工具和WAVE，主要用于讀取、分析和可視化數(shù)據(jù)，一些常用的算法如FFT和熵都已經(jīng)實(shí)現(xiàn)。WFDB庫用于在C、C++或者Fortran中讀寫WFDB兼容格式文件，命令行用于直接處理數(shù)據(jù)，WAVE可以看做其圖形化前端，需要xview支持。軟件應(yīng)該是C語言編寫，Linux原生支持，Windows需要Cygwin支持，安裝文檔都寫得很詳細(xì)了。這套工具很強(qiáng)大，同時也很復(fù)雜，文檔在這里，當(dāng)然需要你對命令行和研究對象都比較熟悉。如果要快速找到自己需要的命令或工具，可以看看這個工具目錄，很有幫助。

如果沒有那么高的要求或者不想碰命令行，那么它提供的MATLAB軟件包還是可以一用，不過功能就差點(diǎn)意思了，只能做基本的數(shù)據(jù)I/O，后續(xù)的算法都要自己實(shí)現(xiàn)，只能將就著用。這個頁面除了官方發(fā)布的工具其實(shí)還有一些第三方編寫的程序?qū)崿F(xiàn)附加的功能，因?yàn)槎际情_源的，所以可以一看，對自己動手的朋友會有幫助。

這套數(shù)據(jù)庫確實(shí)組織得非常好，甚至還開發(fā)了在線數(shù)據(jù)導(dǎo)出工具。如果你被前面各種軟件名詞嚇到，那么下面這個東東估計(jì)就是你所需要的：PhysioBank

ATM，它的作用就是用瀏覽器可視化地預(yù)覽或者導(dǎo)出數(shù)據(jù)，如圖示，左邊選擇數(shù)據(jù)設(shè)置參數(shù)，右邊微調(diào)選擇輸出模式。利用它，你就可以遠(yuǎn)離那些繁瑣工具的困擾，點(diǎn)幾下鼠標(biāo)就可以方便地查看數(shù)據(jù)，然后將理想的數(shù)據(jù)段導(dǎo)出即可。這個方法適合新手使用，直觀、快速才不會拒人于千里之外，哈哈。

如果你使用了該數(shù)據(jù)庫，并且準(zhǔn)備要發(fā)文章，那么出于版權(quán)考慮，應(yīng)當(dāng)注意按照網(wǎng)站的要求進(jìn)行引用，引用格式見這里。另外如果某些地方有特別注明，那么也應(yīng)該按照要求進(jìn)行引用。因?yàn)檫@個數(shù)據(jù)庫有很強(qiáng)的研究背景，所以有許多論文基于該數(shù)據(jù)庫發(fā)表，不妨看看他人的成果。

如果你在使用過程中還有什么問題，那么我推薦你先看FAQ，大部分問題在這都能找到答案，此外還有一些教程，涉及到方方面面，也可以看看。

關(guān)于該數(shù)據(jù)庫中文的論文還是比較少，但不是沒有，參考文獻(xiàn)已經(jīng)注明。網(wǎng)絡(luò)上討論的也不多，但這兩篇文章不可不看：《MIT-BIH

ECG 心電數(shù)據(jù)的下載和讀取圖解》、《MIT-BIH

ECG 信號的數(shù)據(jù)讀取方法和Matlab程序》，對于文件數(shù)據(jù)格式有較詳細(xì)的分析。

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總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的mit数据库 matlab,[zz]MIT-BIH开放数据库使用指南的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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