我国科学家研发高稳健蛋白质组分析系统,可诊断早期胃癌标志物
12 月 23 日消息,中國科學院大連化學物理研究所近日發布公告,宣布開發出一種位點特異性糖型的高穩健蛋白質組分析系統,可以診斷早期胃癌標志物。
該項目由該研究所生物技術研究部生物分離分析新材料與新技術研究組(1809 組)葉明亮研究員團隊和空軍軍醫大學聶勇戰教授團隊等合作開發,規模化分析 278 例臨床樣本進行 N-糖基化蛋白質組,篩選并驗證了新型蛋白質糖基化類生物標志物,可用于診斷胃癌尤其是早期胃癌。
目前在臨床上使用的腫瘤標志物基本上都是糖蛋白質。蛋白質糖基化的異常與疾病的發生發展密切相關,但是還沒有在特定蛋白質、特定位點上的特定糖型(即位點特異性糖型)的疾病標志物。
研究人員開發出了一個高穩健的位點特異性糖型蛋白質組學分析系統。該系統采用自動化方法富集生物樣本中的 N-完整糖肽,然后采用微流 LC-MS / MS 系統檢測 N-完整糖肽,并利用團隊開發的 Glyco-Decipher 軟件鑒定和定量位點特異性糖型。
科研人員使用該系統分析了 200 多個樣品,發現其富集特異性保持在 88.1% 到 91.7% 之間,展現了穩定的糖肽富集性能。
在 10 個批內 / 批間的質量控制樣本中,N-完整糖肽、糖基化位點和糖蛋白的鑒定數目的相對標準偏差均低于 7%,并且定量 N-完整糖肽的 Pearson 相關系數平均值為 0.909。
經過長時間分析超過 200 份大隊列樣本后發現,每個質量控制樣本依然能穩定地鑒定到平均 1900 條完整的 N-完整糖肽。
因此,該系統具有高靈敏、高穩健的 N-完整糖肽鑒定性能,為 N-糖基化位點特異性糖型的規模化分析提供了一個有力的分析工具。
附上論文參考地址如下:https://doi.org/10.1002/advs.202306955。
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總結
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