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编程问答

sklearn实战之降维算法PCA与SVD

發布時間:2023/12/29 编程问答 34 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 sklearn实战之降维算法PCA与SVD 小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.

sklearn實戰系列
(1) sklearn實戰之決策樹
(2) sklearn實戰之隨機森林
(3) sklearn實戰之數據預處理與特征工程
(4) sklearn實戰之降維算法PCA與SVD
(5) sklearn實戰之邏輯回歸與制作評分卡
(6) sklearn實戰之聚類算法

四、sklearn中的降維算法PCA和SVD

1、sklearn中的降維算法

sklearn中降維算法都被包括在模塊decomposition中,這個模塊本質是一個矩陣分解模塊。在過去的十年中,如果要討論算法進步的先鋒,矩陣分解可以說是獨樹一幟。矩陣分解可以用在降維,深度學習,聚類分析,數據預處理,低緯度特征學習,推薦系統,大數據分析風領域中。在2006年,Netflix舉辦了一個獎金為100萬美元的推薦系統算法的比賽,最后的獲獎者就使用了矩陣分解中的明星:SVD分解(奇異值分解)。

類說明
主成分分析
decomposition.PCA主成分分析(PCA)
decomposition.IncrementalPCA增量主成分分析(IPCA)
decomposition.KernelPCA核主成分分析(KPCA)
decomposition.MiniBatchSparserPCA小批量系數主成分分析
decomposition.SparserPCA系數主成分分析(SparserPCA)
decomposition.TruncatedSVD截斷的SVD(aka LSA)
因子分析
decomposition.FactorAnalysis因子分析(FA)
獨立成分分析
decomposition.FastICA獨立成分分析的快速算法
字典學習
decomposition.DictionaryLearning字典學習
decomposition.MiniBatchDictionaryLearning小批量字典學習
decomposition.dict_learning字典學習用于矩陣分解
decomposition.dict_learning_online在線字典學習用于矩陣分解
高級矩陣分解
decomposition.LatentDirichletAllocation具有在線變貝葉斯算法的隱含迪利克雷分布
decomposition.NMF非負矩陣分解(NMF)
其他矩陣分解
decomposition.SparerCoder稀疏編碼

SVD和主成分分析PAce都屬于矩陣分解算法中斷的入門算法,都是通過分解特征矩陣來進行降維,他們也是我們要學習的重點!

2、PCA與SVD

在降維過程中,我們會減少特征的數量,這意味著刪除數據,數據亮變少則表示模型可以獲取的信息就會變少,模型的表現可能因此受影響。同時,在高維數據中,必然有一些特征是不帶有效信息的(比如噪聲),或者,有些特征帶有的信息和其他一些特征是重讀的(比如一些特征可能會線性相關)。我們希望能夠找出一種辦法來幫助我們衡量特特征上所帶的信息量,讓我們在降維的過程中,能夠既減少特征的數量,又保留大部分有效信息——將那些帶有重復信息的特征合并,并刪除那些無效信息的特征等等——組件創造出能夠代表原特征矩陣大部分信息的,特征更少的,新特征矩陣。

上周的特征工程課中,我們提到過一種重要的特征選擇方法:方差過濾。如果一個特征的方差很小,則意味這這個特征可能很大程度上有大量取值都相同(比如90%是1,甚至100%是1),那這個特征的取值對樣本而言就沒有區分度,這種特征就不帶有有效信息。從方差的這種應用就可以推斷出,如果一個特征的方差很大,則說明這個特征上帶大量的信息。因此,在降維中,PCA使用的信息量衡量指標就是樣本方差,又可稱為可解釋性方差,方差越大,特征所帶的信息也就越多
Var=1n?1∑i=1n(xi?xhat)2Var=\frac{1}{n-1}\sum_{i=1}^n(x_i-x^{hat})^2 Var=n?11?i=1n?(xi??xhat)2
Var代表一個特征大方差,n代表樣本量,xi代表一個特征中的每一個樣本取值,xhatx^{hat}xhat代表這一列樣本的均值。

面試高危問題

方差計算公式中為什么除數是n-1?

這是為了得到樣本的無偏估計,更多的大家自己去探索吧~

2.1 降維究竟是怎樣實現?

2.2 重要參數n_components

n_components是我們降維后需要的維度,即降維后需要保留的特征數量,降維流程中第二步里需要確認的K值,一般輸入[0,min(X.shape)]范圍中的證書。一說到K,大家可能都會想到,類似于KNN中的K和隨機森林中的n_estimators。這是一個需要我們認為去確定的超參數,并且我們設定的數字會影響到模型的表現。如果留下的特征太多,就達不到降維的效果,如果留下的特征太小,那新特征可能無法容納原始數據集中的大部分信息,因此,n_components既不能太大也不能太小。那應該怎么選擇呢?

可以先從我們的降維目標開始說起:如果我們希望可視化一組數據來觀察數據分布,我們往往將數據降到三維以下,很多時候是二維,即n_components的取值是2。

2.2.1 迷你案例:高維數據的可視化

1、調用庫和模塊

import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.datasets import load_iris from sklearn.decomposition import PCA

2、提取數據集

iris = load_iris() y = iris.target X = iris.data #作為數組,X是幾維? X.shape #作為數據表或特征矩陣,X是幾維? import pandas as pd pd.DataFrame(X)

3、建模

#調用PCA pca = PCA(n_components=2) #實例化 pca = pca.fit(X) #擬合模型 X_dr = pca.transform(X) #獲取新矩陣 X_dr #也可以fit_transform一步到位 #X_dr = PCA(2).fit_transform(X)

4、可視化

#要將三種鳶尾花的數據分布顯示在二維平面坐標系中,對應的兩個坐標(兩個特征向量)應該是三種鳶尾花降維后的 x1和x2,怎樣才能取出三種鳶尾花下不同的x1和x2呢? X_dr[y == 0, 0] #這里是布爾索引,看出來了么? #要展示三中分類的分布,需要對三種鳶尾花分別繪圖 #可以寫成三行代碼,也可以寫成for循環 """ plt.figure() plt.scatter(X_dr[y==0, 0], X_dr[y==0, 1], c="red", label=iris.target_names[0]) plt.scatter(X_dr[y==1, 0], X_dr[y==1, 1], c="black", label=iris.target_names[1]) plt.scatter(X_dr[y==2, 0], X_dr[y==2, 1], c="orange", label=iris.target_names[2]) plt.legend() plt.title('PCA of IRIS dataset') plt.show() """ colors = ['red', 'black', 'orange'] iris.target_names plt.figure() for i in [0, 1, 2]:plt.scatter(X_dr[y == i, 0],X_dr[y == i, 1],alpha=.7,c=colors[i],label=iris.target_names[i]) plt.legend() plt.title('PCA of IRIS dataset') plt.show()

鳶尾花的分布被展現在我們眼前了,明顯這是一個分簇的分布,并且每個簇之間的分布相對比較明顯,也許 versicolor和virginia這兩種花之間會有一些分類錯誤,但setosa肯定不會被分錯。這樣的數據很容易分類,可以遇 見,KNN,隨機森林,神經網絡,樸素貝葉斯,Adaboost這些分類器在鳶尾花數據集上,未調整的時候都可以有 95%上下的準確率。

6、探索降維后的數據

#屬性explained_variance_,查看降維后每個新特征向量上所帶的信息量大小(可解釋性方差的大小) pca.explained_variance_ #屬性explained_variance_ratio,查看降維后每個新特征向量所占的信息量占原始數據總信息量的百分比 #又叫做可解釋方差貢獻率 pca.explained_variance_ratio_ #大部分信息都被有效地集中在了第一個特征上 pca.explained_variance_ratio_.sum()

7、選擇最好的n_components:積累可解釋方差貢獻率曲線

當參數n_components中不填寫任何值,則默認返回min(X.shape)個特征,一般來說,樣本量都會大于特征數目,所以什么都不填就相當于轉換了新特征孔家,但沒有減少特征的個數。一般來說,不會使用這種輸入方式。但我們卻可以使用這種輸入方式畫出累計可解釋方差貢獻率曲線,以此選擇最好的n_components的整數取值。

累計可解釋方差貢獻曲線是一條以降維后新特征矩陣捕捉到的可解釋方差貢獻率為縱坐標,能夠幫助我們解決n_components最好的取值。

import numpy as np pca_line = PCA().fit(X) plt.plot([1,2,3,4],np.cumsum(pca_line.explained_variance_ratio_)) plt.xticks([1,2,3,4]) #這是為了限制坐標軸顯示為整數 plt.xlabel("number of components after dimension reduction") plt.ylabel("cumulative explained variance ratio") plt.show()
2.2.2 最大似然估計自選超參數

除了輸入證書,n_components還有哪些選擇呢?矩陣分解的理論發展在業界獨樹一幟,勤奮智 慧的數學大神Minka, T.P.在麻省理工學院媒體實驗室做研究時找出了讓PCA用最大似然估計(maximum likelihood estimation)自選超參數的方法,輸入“mle”作為n_components的參數輸入,就可以調用這種方法。

pca_mle = PCA(n_components="mle") pca_mle = pca_mle.fit(X) X_mle = pca_mle.transform(X) X_mle #可以發現,mle為我們自動選擇了3個特征 pca_mle.explained_variance_ratio_.sum() #得到了比設定2個特征時更高的信息含量,對于鳶尾花這個很小的數據集來說,3個特征對應這么高的信息含量,并不 需要去糾結于只保留2個特征,畢竟三個特征也可以可視化
2.2.3 按信息量占比選超參數

輸入[0,1]之間的浮點數,并且讓參數svd_slover==“full”,表示希望降維后的總解釋性方差占比大于n_components指定的百分比,即是說,希望保留百分之多少的信息量。比如說,如果我們希望暴力流97%的信息量,就可以輸入n_components=0.97,PCA就會自動選出能夠讓保留的信息量超過97%的特征數量。

pca_f = PCA(n_components=0.97,svd_solver="full") pca_f = pca_f.fit(X) X_f = pca_f.transform(X) pca_f.explained_variance_ratio_

2.3 PCA中的SVD

2.3.1 PCA中的SCD哪里來的?

細心的同學可能注意到了,svd_solver是奇異值分解器的意思,為什么PCA算法下面會有關奇異值分解的參數?不是兩種算法嗎?我們之前曾經提及過,PCA和SVD設計了大量的矩陣計算,兩者都是計算量很大的模型,但是其實,SVD有一種驚人的數學性質,即是它可以跳過數學神秘的宇宙,不計算協方差矩陣,直接找出一個新特征向量組成的n維空間,而這個n維空間就是奇異值分解后的右矩陣VTV^TVT(所以一開始講解降維過程中,我們說到的“生成新特征向量組成的空間V“,并非巧合,而是指奇異值分解后的矩陣VTV^TVT)。

右奇異值矩陣VTV^TVT有著如下性質:
Xdr=X?V[:k]TX^{dr}=X*V[:k]^T Xdr=X?V[:k]T
k就是n_components,是我們降維后希望得到的維度,弱X是(m,n)的特征矩陣,VTV^TVT就是結構為(n,n)的矩陣,取這個矩陣的前k行(進行切片),即將V轉換為結構為(k,n)的矩陣。而V(k,n)TV_{(k,n)}^TV(k,n)T?與原特征矩陣X相乘,即可得到降維后的特征矩陣X_dr。這就是說,奇異值分解可以不計算協方差矩陣等等結構復雜計算冗長的矩陣,就直接求出新特征空間和降維后的特征矩陣

簡而言之,SVD在矩陣分解中的過程比PCA簡單快速,雖然兩個算法都走一樣的分解流程,但SVD可以作弊耍賴直接算出V。但遺憾的是,SVD的信息量衡量指標比較復雜,要理解”奇異值”比理解方差來的容易,因此sklearn將降維流程拆成了兩部分:一部分似乎計算特征空間V,由于奇異值分解完成,另一部分是映射數據和求解新特征矩陣,有主成分分析完成,實現了有用SVD的性質減少計算量,卻讓信息量的評估指標是方差,具體流程如下圖:

講到這里,相信大家就能理解,為什么PCA的類里會包含控制SVD分解器的參數了。通過SVD和PCA的合作,sklearn實現了一種計算更快更簡單,但效果卻很好的“合作降維”。很多人理解SVD,是把SVD當作是PCA的一種求解方法,但在sklearn中,矩陣U和Σ雖然會被計算出來(童顏也是一種比起PCA來說簡化非常多的數學過程,不產生協方差矩陣),但完全不會被用到,也無法調取查看或者使用,因此我們可以認為,U和Σ在fit過后就被遺棄了。奇異值分解追求的僅僅是V,只要有了V,就可以計算出降維后的特征矩陣。在transform過程之后,fit中奇異值分解的結果除了V(k,n)以外,都會被舍棄,而V(k,n)會被保留在屬性components_當中,可以調用查看。

PCA(2).fit(X).components_ PCA(2).fit(X).components_.shape

輸出:

(2, 4)
2.3.2 重要參數svd_solver與random_state

參數svd_solver是在降維過程中,用來控制矩陣分解的一些細節的參數。有四種模式可以選:“auto”,“full”,“arapck”,“randomized”,默認"auto"。

  • ”auto“:基于X.shape和n_components的默認策略來選擇分解器。如果輸入的數據的尺寸大于500×500且要提取的特征數小于數據最小維度min(X.shape)的80%,就啟用效率更的”randomized“方法。否則,精確完整 的SVD將被計算,截斷將會在矩陣被分解完成后有選擇地發生。
  • ”full“:從scipy.linalg.svd中調用標準的LAPACK分解器來生成精確完整的SVD,適合數據量比較適中,計算時 間充足的情況,生成的精確完整的SVD的結構為:

U(m,m),Σ(m,n),V(n,n)TU_{(m,m)},Σ_{(m,n)},V_{(n,n)}^T U(m,m)?,Σ(m,n)?,V(n,n)T?

  • "arpack":從scipy.sparse.linalg.svds調用ARPACK分解器來運行截斷奇異值分解(SVD truncated),分解時就 將特征數量降到n_components中輸入的數值k,可以加快運算速度,適合特征矩陣很大的時候,但一般用于 特征矩陣為稀疏矩陣的情況,此過程包含一定的隨機性。截斷后的SVD分解出的結構為:

U(m,k),Σ(k,k),V(n,n)TU_{(m,k)},Σ_{(k,k)},V_{(n,n)}^T U(m,k)?,Σ(k,k)?,V(n,n)T?

  • "randomized":通過Halko等人的隨機方法進行隨機SVD。在"full"方法中,分解器會根據原始數據和輸入的 n_components值去計算和尋找符合需求的新特征向量,但是在"randomized"方法中,分解器會先生成多個 隨機向量,然后一一去檢測這些隨機向量中是否有任何一個符合我們的分解需求,如果符合,就保留這個隨 機向量,并基于這個隨機向量來構建后續的向量空間。這個方法已經被Halko等人證明,比"full"模式下計算快很多,并且還能夠保證模型運行效果。適合特征矩陣巨大,計算量龐大的情況

而參數random_state在參數svd_solver的值為"arpack" or "randomized"的時候生效,可以控制這兩種SVD模式中 的隨機模式。通常我們就選用”auto“,不必對這個參數糾結太多

2.3.3 重要屬性components_

現在我們了解了,V(k,n)是新特征空間,是我們要將原始數據進行映射的那些新特征向量組成的矩陣,我們用它來計算新的特征矩陣,但我們希望獲取的是X_dr,為什么我們要把V(k,n)這個矩陣保存在n_components這個屬性當中來讓大家調取查看呢?

我們之前談過PCA和特征選擇的區別,即特征選擇后的特征矩陣是可解讀的,而PC啊降維后的特征矩陣是不可解讀的:PCA是將已經存在的特征進行壓縮,降維完畢后的特征已經不是原本特征矩陣中的任何一個特征,而是通過某些方式組合起來的新特征,通常來說,在新的特征矩陣生成之前,我們都無法知曉PCA都建立了怎樣的新特征向量,新特征矩陣生成之后也不具有可讀性,我們就無法判斷新特征矩陣的特征是從原數據中的什么特征組合而來的,新特征雖然帶有原始數據的信息,卻已經不是原數據上代表的含義了。

但是其實,在矩陣分解時,PCA時有目標的:在原特征的基礎上,找出能夠讓信息盡量聚集的新特征向量。在 sklearn使用的PCA和SVD聯合的降維方法中,這些新特征向量組成的新特征空間其實就是V(k,n)。當V(k,n)是數字 時,我們無法判斷V(k,n)和原有的特征究竟有著怎樣千絲萬縷的數學聯系。但是,如果原特征矩陣是圖像,V(k,n)這 個空間矩陣也可以被可視化的話,我們就可以通過兩張圖來比較,就可以看出新特征空間究竟從原始數據里提取了 什么重要的信息。

讓我們來看一個,人臉識別中屬性components_的運用。

1、導入需要的庫和模塊

from sklearn.datasets import fetch_lfw_people from sklearn.decomposition import PCA import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np

2、實例化數據集,探索數據

faces = fetch_lfw_people(min_faces_per_person=60) faces.images.shape #怎樣理解這個數據的維度? faces.data.shape #換成特征矩陣之后,這個矩陣是什么樣? X = faces.data

3、看看圖像什么樣?將原特征矩陣進行可視化

#數據本身是圖像,和數據本身只是數字,使用的可視化方法不同 #創建畫布和子圖對象 fig, axes = plt.subplots(4,5,figsize=(8,4),subplot_kw = {"xticks":[],"yticks":[]} #不要顯示坐標軸) fig axes #不難發現,axes中的一個對象對應fig中的一個空格 #我們希望,在每一個子圖對象中填充圖像(共24張圖),因此我們需要寫一個在子圖對象中遍歷的循環 axes.shape #二維結構,可以有兩種循環方式,一種是使用索引,循環一次同時生成一列上的三個圖 #另一種是把數據拉成一維,循環一次只生成一個圖 #在這里,究竟使用哪一種循環方式,是要看我們要畫的圖的信息,儲存在一個怎樣的結構里 #我們使用 子圖對象.imshow 來將圖像填充到空白畫布上 #而imshow要求的數據格式必須是一個(m,n)格式的矩陣,即每個數據都是一張單獨的圖 #因此我們需要遍歷的是faces.images,其結構是(1277, 62, 47) #要從一個數據集中取出24個圖,明顯是一次性的循環切片[i,:,:]來得便利 #因此我們要把axes的結構拉成一維來循環 axes.flat enumerate(axes.flat) #填充圖像 for i, ax in enumerate(axes.flat):ax.imshow(faces.images[i,:,:] ,cmap="gray") #選擇色彩的模式#https://matplotlib.org/tutorials/colors/colormaps.html

輸出:

4、建模降維,提取新特征空間矩陣

#原本有2900維,我們現在來降到150維 pca = PCA(150).fit(X) V = pca.components_ V.shape

輸出(150,2914)

5、將新特征空間矩陣可視化

fig, axes = plt.subplots(3,8,figsize=(8,4),subplot_kw = {"xticks":[],"yticks":[]}) for i, ax in enumerate(axes.flat):ax.imshow(V[i,:].reshape(62,47),cmap="gray")

輸出:

這張圖稍稍有一些恐怖,但可以看出,比起降維前的數據,新特征空間可視化后的人臉非常模糊,這是因為原始數據還沒有被映射到特征空間中。但可以看出,整體比較亮的圖片,獲取的信息較多,整體較暗的圖片,卻智能看到漆黑的一片。在比較亮的圖片中,眼睛,鼻子,嘴巴等五官都相對清晰,臉的輪廓,頭發之類的比較模糊。

這說明,新特征空間里的特征向量們,大部分是”五官“和”亮度“相關的向量,所以新特征向量上的信息肯定大部分是由原數據中的”五官“和”亮度“相關的特征中提取出來的。到這里,我們通過可視化新特征空間X,解釋了一部分降維后的特征:雖然顯示出來的數字看著不知所云,但畫出來的圖表示,這些特征是和”無關“以及”亮度“相關的。這也再次證明了,PCA能夠啊將原始數據集中重要的數據進行聚集。

2.4 重要接口inverse_transform

在上篇的特征工程中,我們學到了神奇的接口inverse_transform,可以將我們歸一化,標準化,甚至做過啞變量的特征矩陣還原回原始數據中的特征矩陣,這幾乎向我們暗示,任何有inverse_transform這個接口的過儲層都是可逆的。PCA應該也是如此。在sklearn中,我們通過讓原特征矩陣X右乘新特征空間矩陣V(k,n)來生成新特征矩陣X_dr,那理論上來說,讓新特征矩陣X_dr右乘V(k,n)的逆矩陣V(k,n)?1V_{(k,n)}^{-1}V(k,n)?1?,就可以將新特征矩陣X_dr還原為X。那sklearn是否這樣做了呢?讓我們來看看下面的案例。

2.4.1 迷你案例:用人臉識別看PCA降維后的信息保存量

人臉識別是容易的,用來探索inverse_transform功能的數據。我們先調用一組人臉數據X(m,n),對人臉圖像進行繪制,然后我們對人臉數據進行降維得到X_dr,zhi后再使用inverse_transform(X_dr)返回一個X_transform(m,n),并對這個新矩陣中的人臉圖像也進行繪制。如果PCA的降維過程是可逆的,我們應當期待X(m,n)和X_transform(m,n)返回一摸一樣的圖像,即攜帶一摸一樣的信息。

1、導入需要的模塊和庫

from sklearn.datasets import fetch_lfw_people from sklearn.decomposition import PCA import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np

2、導入數據并探索

faces = fetch_lfw_people(min_faces_per_person=60) faces.images.shape #怎樣理解這個數據的維度? faces.data.shape #換成特征矩陣之后,這個矩陣是什么樣? X = faces.data

3、漸濃降維,獲取降維后的新特征矩陣X_dr

pca = PCA(150) X_dr = pca.fit_transform(X) X_dr.shape

4、將降維后的矩陣用inverse_transform返回原空間

X_inverse = pca.inverse_transform(X_dr) X_inverse.shape

5、將特征矩陣X和X_inverse可視化

fig, ax = plt.subplots(2,10,figsize=(10,2.5),subplot_kw={"xticks":[],"yticks":[]}) #和2.3.3節中的案例一樣,我們需要對子圖對象進行遍歷的循環,來將圖像填入子圖中 #那在這里,我們使用怎樣的循環? #現在我們的ax中是2行10列,第一行是原數據,第二行是inverse_transform后返回的數據 #所以我們需要同時循環兩份數據,即一次循環畫一列上的兩張圖,而不是把ax拉平 for i in range(10):ax[0,i].imshow(face.image[i,:,:],cmap="binary_r")ax[1,i].imshow(X_inverse[i].reshape(62,47),cmap="binary_r")

可以明顯看出,這兩組數據可視化后,由降維后再通過inverse_transform轉換回原維度的數據畫出的圖像和原數 據畫的圖像大致相似,但原數據的圖像明顯更加清晰。這說明,inverse_transform并沒有實現數據的完全逆轉。 這是因為,在降維的時候,部分信息已經被舍棄了,X_dr中往往不會包含原數據100%的信息,所以在逆轉的時 候,即便維度升高,原數據中已經被舍棄的信息也不可能再回來了。所以,降維不是完全可逆的。 Inverse_transform的功能,是基于X_dr中的數據進行升維,將數據重新映射到原數據所在的特征空間中,而并非 恢復所有原有的數據。但同時,我們也可以看出,降維到300以后的數據,的確保留了原數據的大部分信息,所以 圖像看起來,才會和原數據高度相似,只是稍稍模糊罷了。

2.4.2 迷你案例:用PCA做噪音過濾

降維的目的之一就是希望拋棄掉對模型帶來負面影響的特征,而我們相信,帶有效信息的特征的方差應該是遠大于 噪音的,所以相比噪音,有效的特征所帶的信息應該不會在PCA過程中被大量拋棄。inverse_transform能夠在不 恢復原始數據的情況下,將降維后的數據返回到原本的高維空間,即是說能夠實現”保證維度,但去掉方差很小特 征所帶的信息“。利用inverse_transform的這個性質,我們能夠實現噪音過濾。

1、導入所需要的庫和模塊

from sklearn.datasets import load_digits from sklearn.decomposition import PCA import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np

2、導入數據,探索數據

digits = load_digits() digits.data.shape

3、自定義畫圖函數

def plot_digits(data):fig, axes = plt.subplots(4,10,figsize=(10,4),subplot_kw = {"xticks":[],"yticks":[]})for i, ax in enumerate(axes.flat):ax.imshow(data[i].reshape(8,8),cmap="binary")plot_digits(digits.data)

[外鏈圖片轉存失敗,源站可能有防盜鏈機制,建議將圖片保存下來直接上傳(img-fys0hIpY-1629554113021)(D:typora/picture/噪聲前.jpg)]

4、為數據加上噪音

np.random.RandomState(42) #在指定的數據集中,隨機抽取服從正態分布的數據 #兩個參數,分別是指定的數據集,和抽取出來的正太分布的方差 noisy = np.random.normal(digits.data,2) plot_digits(noisy)

5、降維

pca = PCA(0.5).fit(noisy) X_dr = pca.transform(noisy) X_dr.shape

6、逆轉降維結果,實現降噪

without_noise = pca.inverse_transform(X_dr) plot_digits(without_noise)

2.5 重要接口,參數和屬性總結

到現在,我們已經完成了對PCA的講解。我們講解了重要參數參數n_components,svd_solver,random_state, 講解了三個重要屬性:components_, explained_variance_以及explained_variance_ratio_,無數次用到了接口 fit,transform,fit_transform,還講解了與眾不同的重要接口inverse_transform。所有的這些內容都可以被總結 在這張圖中:

3、案例:PCA對手寫數字數據集的降維

還記得我們上次在介紹特征工程時,使用的手寫數字的數據集嗎?數據集結構為(42000, 784),用KNN跑一次半小 時,得到準確率在96.6%上下,用隨機森林跑一次12秒,準確率在93.8%,雖然KNN效果好,但由于數據量太大, KNN計算太緩慢,所以我們不得不選用隨機森林。我們使用了各種技術對手寫數據集進行特征選擇,最后使用嵌入 法SelectFromModel選出了324個特征,將隨機森林的效果也調到了96%以上。但是,因為數據量依然巨大,還是 有300多個特征。今天,我們就來試著用PCA處理一下這個數據,看看效果如何。

1、導模塊和庫

from sklearn.decomposition import PCA from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier as RFC from sklearn.model_selection import cross_val_score import matplotlib.pyplot as plt import pandas as pd import numpy as np

2、導入數據

data = pd.read_csv(r"C:\work\learnbetter\micro-class\week 3 Preprocessing\digit recognizor.csv") X = data.iloc[:,1:] y = data.iloc[:,0]

3、畫累計方差貢獻曲線,找最佳降維后維度的范圍

pca_line = PCA().fit(X) plt.figure(figsize=[20,5]) plt.plot(np.cumsum(pca_line.explained_variance_ratio_)) plt.xlabel("number of components after dimension reduction") plt.ylabel("cumulative explained variance ratio") plt.show()

4、降維后的學習曲線,繼續縮小最佳的范圍

#======【TIME WARNING:2mins 30s】======# score = [] for i in range(1,101,10):X_dr = PCA(i).fit_transform(X)once = cross_val_score(RFC(n_estimators=10,random_state=0),X_dr,y,cv=5).mean()score.append(once) plt.figure(figsize=[20,5]) plt.plot(range(1,101,10),score) plt.show()

5、細化學習曲線,找出降維后的最佳維度

#======【TIME WARNING:2mins 30s】======# score = [] for i in range(10,25):X_dr = PCA(i).fit_transform(X)once = cross_val_score(RFC(n_estimators=10,random_state=0),X_dr,y,cv=5).mean()score.append(once) plt.figure(figsize=[20,5]) plt.plot(range(10,25),score) plt.show()

6、導入找出最佳的維度進行降維,并查看模型效果

X_dr = PCA(23).fit_transform(X) #======【TIME WARNING:1mins 30s】======# cross_val_score(RFC(n_estimators=100,random_state=0),X_dr,y,cv=5).mean()

模型效果還好,跑出了94.49%的水平,但還是沒有我們使用嵌入法特征選擇過后的96%高,有沒有什么辦法能夠 提高模型的表現呢?

7、 突發奇想,特征數量已經不足原來的3%,換模型怎么樣?

在之前的建模過程中,因為計算量太大,所以我們一直使用隨機森林,但事實上,我們知道KNN的效果比隨機森林 更好,KNN在未調參的狀況下已經達到96%的準確率,而隨機森林在未調參前只能達到93%,這是模型本身的限制 帶來的,這個數據使用KNN效果就是會更好。現在我們的特征數量已經降到不足原來的3%,可以使用KNN了嗎?

from sklearn.neighbors import KNeighborsClassifier as KNN cross_val_score(KNN(),X_dr,y,cv=5).mean()

8、KNN的K值得學習曲線

#======【TIME WARNING: 】======# score = [] for i in range(10):X_dr = PCA(23).fit_transform(X)once = cross_val_score(KNN(i+1),X_dr,y,cv=5).mean()score.append(once) plt.figure(figsize=[20,5]) plt.plot(range(10),score) plt.show()

9、定下超參數后,模型效果如何,模型運行時間如何?

cross_val_score(KNN(4),X_dr,y,cv=5).mean() #=======【TIME WARNING: 3mins】======# %%timeit cross_val_score(KNN(4),X_dr,y,cv=5).mean()

可以發現,原本785列的特征被我們縮減到23列之后,用KNN跑出了目前位置這個數據集上最好的結果。再進行更 細致的調整,我們也許可以將KNN的效果調整到98%以上。PCA為我們提供了無限的可能,終于不用再因為數據量 太龐大而被迫選擇更加復雜的模型了!

總結

以上是生活随笔為你收集整理的sklearn实战之降维算法PCA与SVD的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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