SNOMED CT（Systematized Nomenclature of Medicine – Clinical Terms，醫(yī)學(xué)系統(tǒng)命名法－臨床術(shù)語，醫(yī)學(xué)術(shù)語系統(tǒng)命名法－臨床術(shù)語）

SNOMED CT包含四個(gè)主要核心組件：

SNOMED CT 中每個(gè)概念都存在唯一的標(biāo)識(shí)，可以存在多種描述；同一概念的所有描述有關(guān)聯(lián)。概念與概念之間通過層次關(guān)系彼此相連，同一概念可存在于多個(gè)層次中。關(guān)系還可應(yīng)用于編碼化的 SNOMED CT 數(shù)據(jù)的分組和歸類。概念、關(guān)系和描述是 SNOMED CT 最基本的組成單元。


SNOMED CT是世界上最全面、多語言的臨床醫(yī)學(xué)術(shù)語產(chǎn)品，包含19個(gè)臨床領(lǐng)域，超過32萬個(gè)概念，在超過50個(gè)國家使用。SNOMED CT可以靈活支持不同的應(yīng)用需求，SNOMED CT結(jié)構(gòu)框架如下：

舉個(gè)栗子：
概念有一個(gè)唯一的數(shù)字標(biāo)識(shí)符（Concept ID），完全指定名稱由概念名稱和概念語義類型組成。Tuberculosis(disorder)----肺結(jié)核（紊亂）
（查一下在別的地方的意思）
關(guān)系：通過屬性（關(guān)系）表達(dá)來源概念和目標(biāo)概念之間的的關(guān)聯(lián)關(guān)系。
主要講解定義屬性
（1）“|is a|關(guān)系”：174041007 | laparoscopic emergency appendectomy |：116680003 | is a | = 80146002 | appendectomy | （腹腔鏡闌尾緊急切除術(shù)是一種闌尾切除術(shù)）
（2）|概念模型屬性|（Concept model attribute） ：|偏側(cè)性|（Laterality） ，|操作部位|（Procedure site） ，|發(fā)現(xiàn)部位|（Finding site） ，|相關(guān)形態(tài)學(xué)|（Associated morphology）
“| Kidney disease | | is a | |Kidney finding| and | is a | |Disorder of abdomen | and | is a | |Disorder of body cavity | and | is a | |Disorder of kidney and/or ureter | and has | Finding site | |Kidney structure |” （腎疾病是一種腎臟臨床表現(xiàn)、腹部疾病、體腔疾病、腎和（/或）輸尿管疾病，其發(fā)生部位為腎臟）

每一種概念關(guān)系都通過特定的屬性來表達(dá)， 形成 “概念 A+屬性+概念 B” 的三元組結(jié)構(gòu)。三元組結(jié)構(gòu)不僅可以用來表達(dá)一個(gè)明確的臨床事物，而且能夠揭示出兩個(gè)概念間語義關(guān)系的具體含義，三元組結(jié)構(gòu)中的概念 B 實(shí)質(zhì)是對(duì)概念 A 的屬性進(jìn)行賦值。

深挖概念

概念是否真的像我們之前講的那樣
當(dāng)然是了，只不過概念內(nèi)部更加復(fù)雜，需要我們深入的的挖掘
***概念***分為兩個(gè)部分：先組概念和后組概念
為啥要那么復(fù)雜呢？？？？因?yàn)橐ＷC臨床事物能夠被正確的描述呀！！！

既然后組概念那么好，那么他有沒有什么表達(dá)規(guī)則？？
來了來了來了規(guī)則來了
具體表達(dá)規(guī)則如下：
（1）概念標(biāo)識(shí)符是概念表達(dá)規(guī)則的基本組成單元。
（2）概念也可以用概念標(biāo)識(shí)符聯(lián)合概念名稱的形式表達(dá)，概念名稱首尾用“|”進(jìn)行分隔。
（3）主體概念與關(guān)系概念之間用“： ”分隔。
（4）關(guān)系概念與客體概念之間用“=”分隔。
（5）主體概念可以來組配多個(gè)關(guān)系概念，關(guān)系概念與其他對(duì)應(yīng)概念形成一個(gè)組合，各組合之間用“， ”分隔。
（6）關(guān)系概念劃分為不同類型時(shí)，相同類型的關(guān)系概念以及其他對(duì)應(yīng)的客體概念通過大括號(hào)“{}”來分隔。
（7）客體概念本身可通過后組概念來表達(dá)嵌套結(jié)構(gòu)。
那么接下來來看看后組概念的具體作用吧~
1.表達(dá)相同含義的先組概念
例如“腹腔鏡闌尾緊急切除術(shù)” （174041007 | laparoscopic emergency appendectomy |）在 SNOMED CT 中為先組概
念，其包括闌尾切除、使用腹腔鏡、緊急處理等方面，可通過定義屬性描述其具體的含義：
174041007 | laparoscopic emergency appendectomy |：116680003 | is a | = 80146002 | appendectomy | （腹腔鏡闌尾緊急切除術(shù)是一種闌尾切除術(shù)）
174041007 | laparoscopic emergency appendectomy |：260870009 | priority | = 25876001 | emergency | （腹腔鏡闌尾緊急切除術(shù)適用于緊急情況）
174041007 | laparoscopic emergency appendectomy |：425391005 | using access device | = 86174004 | laparoscopic | （腹腔鏡闌尾緊急切除術(shù)使用腹腔鏡）
同時(shí)也可以通過其上位概念“闌尾切除術(shù)” （80146002 | appendectomy |）的后組合概念表達(dá)形式來等位表達(dá)：
80146002 | appendectomy | ：260870009 | priority | = 25876001 | emergency |， 425391005 | using access device | = 86174004 | laparoscopic | （緊急情況下進(jìn)行的闌尾切除術(shù)&使用腹腔鏡進(jìn)行的闌尾切除術(shù)）
2.表達(dá)新概念
后組概念表達(dá)最主要的用途是標(biāo)識(shí) SNOMED CT 先組概念中不存在的概念，通過后組概念表達(dá)方式，就可以利用先組概念精確地表達(dá)含義更為具體得我概念。
舉個(gè)栗子：SNOMED CT 沒有先組概念“腹部腹腔鏡拆除裝置” （laparoscopic removal of device from abdomen） ，可采取后組概念表達(dá)方式。
通過先組概念“腹部拆除裝置” （68526006 | removal of device from abdomen |）進(jìn)行等價(jià)表達(dá)：
68526006 | removal of device from abdomen | ：425391005 | using access device | = 6174004 | laparoscope | （腹部拆除裝置時(shí)使用腹腔鏡）

數(shù)據(jù)下載

因?yàn)槲覀儾皇浅蓡T國俺也沒有錢所以沒有從官網(wǎng)下載，從偉大的凌老師那里得到SNOMED CT的數(shù)據(jù)
數(shù)據(jù)里面有什么？？
1.“Concept”文件，包含一組概念相關(guān)的文件；
2.“Relationship”文件，包含表示一組概念定義的分布范式推斷視圖的關(guān)系；
3.“Description”文件，包含一組描述，描述類型為同義詞和完全指定的名稱，這兩種描述類型的最大字符長度都是 255 個(gè)字符；
4.“TextDefinition”文件，包含一組描述和描述類型，此描述類型的最大字符長度為 4096 個(gè)字符；
5.“StatedRelationship”文件，包含表示一組概念定義的聲明視圖的關(guān)系，這個(gè)文件很可能會(huì)被淘汰，取而代之的是一個(gè)包含更豐富的OWL 表示的概念定義的參考集；
6.“Identifier”文件，此文件不包含國際版中的任何數(shù)據(jù)行。

查看數(shù)據(jù)之前應(yīng)該知道的事情
1.所有元數(shù)據(jù)概念都是頂層概念 “900000000000441003 | SNOMED CT Mode |（SNOMED CT 模型組件） ”的子類型后代。
2.在發(fā)表的文件中， 每個(gè)組件都有一個(gè)相關(guān)的 active 字段， 該字段可以接受 true （1） 或 false（0）的值。

概念、描述和關(guān)系的文件規(guī)范及處理

1. Concept表
該概念文件包含構(gòu)成 SNOMED CT 的臨床概念。概念由其完全指定的名稱賦予含義，該名稱在描述中包含。一個(gè)概念可以通過與關(guān)系中的其他概念相關(guān)聯(lián)來區(qū)分或提煉。

SCTID：SNOMED CT Identifier，SNOMED CT 標(biāo)識(shí)符

2. Description 表
描述包含描述 SNOMED CT 概念的描述。描述是用來給一個(gè)概念賦予意義，并當(dāng)引用一個(gè)概念時(shí)，提供理解和標(biāo)準(zhǔn)的方式來。


3. Relationship 表
關(guān)系文件每行保存一個(gè)關(guān)系。每個(gè)關(guān)系都是特定類型的，并且有一個(gè)源概念和一個(gè)目標(biāo)概念。
舉個(gè)栗子：371883000 | Outpatient procedure | 116680003 | is a | 71388002 | Procedure |（門診流程是一個(gè)程序） ，其中，371883000 | Outpatient procedure |（門診流程）是源概念，116680003 | is a |是關(guān)系類型概念，71388002 | Procedure |是一個(gè)目標(biāo)概念。


SNOMED CT 的 international 版本與 US 版本進(jìn)行比較，可以發(fā)現(xiàn)，US 版本比international 版本多出了 7996 條概念和 19505 條術(shù)語。

4. 入庫處理
以SNOMED CT 的international版本為例
dms_id：根據(jù) concept表中的 effectiveTime 和 active 兩列，篩選出最新的更新時(shí)間和 active 為 true（1）的作為所需要的主鍵
dms_ids：“dms_id”與 description 表中的 conceptId 列進(jìn)行匹配，篩選出最新的更新時(shí)間和 active 為 true（1）description 的 id 列，將此 id 作為“dms_ids”中的除自身的 concept 外的另一 id 號(hào)
dms_name：在相同的 conceptId 號(hào)中，篩選 typeId 為 900000000000003001 | Fully specified name |（完全指定名稱）的 term 作為“dms_name”
dms_synonym：typeId 為 900000000000013009 | synonym |（同義詞）的 term 作“dms_synonym”
dms_ids_extend:“dms_ids_extend”與“dms_ids”一致
dms_synonym_extend:“dms_synonym_extend”與“dms_synonym”一致
relation:將 concept 與關(guān)系表中的 sourceId 列進(jìn)行匹配，同樣篩選出最新的更新時(shí)間和 active 為 true（1）的 destinationId 和 typeId。每一橫行表示一種關(guān)系，將每一橫行的這種關(guān)系分別列入“relation”中，標(biāo)清 sourceId、destinationId 和typeId。
此外，由于| Is a |關(guān)系比較重要，我們將其再單獨(dú)列出，存在“Is a”字段中。篩選出“relation”字段中 typeId 為 116680003 | is a |的 destinationId 存儲(chǔ)于“Is a”字段中

鑒于“dms_ids”中存儲(chǔ)的除“conceptId”外還包含有“descriptionId”，所以，將descriptionId 也作為一個(gè)“dms_id”進(jìn)行錄入。在“dms_ids”中把自身和對(duì)應(yīng)的“conceptId”放進(jìn)去，“dms_ids_extend”與“dms_ids”中內(nèi)容一致。將此“descriptionId”對(duì)應(yīng)的 term 存儲(chǔ)在“dms_name”，“dms_synonym”和“dms_synonym_extend”中。
為了便于查看，在最后添加“concept”字段，將與錄入的“descriptionId”對(duì)應(yīng)的“conceptId”錄入。

SNOMED CT應(yīng)用領(lǐng)域

SNOMED CT通過提供語義豐富的臨床術(shù)語來滿足各種應(yīng)用需求。
電子病歷：SNOMED CT作為術(shù)語詞典支持電子病歷后結(jié)構(gòu)化處理和存儲(chǔ)、輔助醫(yī)生醫(yī)囑錄入、語義檢索。
臨床決策支持：輔助生成診斷方案、創(chuàng)建醫(yī)療警報(bào)，如藥物過敏等供醫(yī)生臨床診斷。
醫(yī)療數(shù)據(jù)互操作：SNOMED CT作為編碼系統(tǒng)應(yīng)用于各醫(yī)療機(jī)構(gòu)，促進(jìn)醫(yī)療數(shù)據(jù)互操作。
統(tǒng)計(jì)分析：基于SNOMED CT語義豐富的臨床概念及多層級(jí)結(jié)構(gòu)提供更準(zhǔn)確的統(tǒng)計(jì)分析報(bào)告。

SNOMED CT的受益對(duì)象

SNOMED CT在醫(yī)療領(lǐng)域的不同應(yīng)用，醫(yī)療領(lǐng)域的各個(gè)參與者都是受益者。
患者：標(biāo)準(zhǔn)化并共享個(gè)人健康檔案及電子病歷，減少重復(fù)檢查和治療，提高個(gè)人診療效果。
民眾：通過數(shù)據(jù)共享提高民眾疾病監(jiān)測(cè)水平及疾病預(yù)防能力。
臨床醫(yī)生：輔助醫(yī)生臨床診斷，減少誤診情況。
醫(yī)療機(jī)構(gòu)：優(yōu)化醫(yī)療機(jī)構(gòu)資源分配。
政府及研究機(jī)構(gòu)：基于SNOMED CT提供更精確統(tǒng)計(jì)分析報(bào)告及研究報(bào)告。

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的snomed ct的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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