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编程问答

lammps后处理:ovito选择原子高级技巧讲解

發布時間:2023/12/31 编程问答 54 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 lammps后处理:ovito选择原子高级技巧讲解 小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.

大家好,我是小馬老師。
本文介紹如何在ovito中使用公式(Expression)選擇需要的原子。
用ovito查看lammps模擬結果時,可能會遇到選擇特定原子的情況,比如選擇坐標位于一定范圍內的原子,或者選擇結構為fcc的原子等等。
這時候,就需要用到expression selection功能。
Expression selection功能比較強大,下面分別介紹幾種選擇原子的方法。
在輸入公式前,先點擊“Add modification”->"Expression selection"選項,在Boolean expression輸入框內輸入選擇公式即可。

(1)按原子ID選擇
ParticleIndex表示原子ID,如選擇ID為10的原子:
ParticleIndex == 10
Expression支持布爾運算,配合邏輯與(&&)、邏輯或(||)等運算符可進行復雜條件的選擇。
如選擇ID為10-30的原子:
ParticleIndex > 10 && ParticleIndex < 30
被選擇的原子被標為紅色。

(2)按坐標選擇
Position.X|Y|Z分別表示xyz方向的坐標。
如選擇Z坐標值大于20的原子:
Position.Z > 20
X坐標大于5 并且 y坐標大于5的原子:
Position.X >5 && Position.Y>5

(3)按結構類型選擇

在使用結構類型之前,需要先進行計算,因此先添加"Common neighbor analysis"計算結構類型,然后添加“Expression selection”。
不同結構對應的類型如圖所示:

如選擇FCC(類型為1)的原子:
StructureType == 1

Expression selection功能比較強大,本文先介紹這三種用法,后續會繼續介紹其他選擇方式。

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總結

以上是生活随笔為你收集整理的lammps后处理:ovito选择原子高级技巧讲解的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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