rdkit 會在KeKulize的時候清除鍵上的芳香環信息，但是輸出smiles重新導入后會恢復該信息

mol = Chem.MolFromSmiles('c1ccccc1')Chem.Kekulize(mol,False) print(mol.GetBondWithIdx(0).GetIsAromatic()) # True print(Chem.MolToSmiles(mol)) # c1ccccc1Chem.Kekulize(mol,True) print(mol.GetBondWithIdx(0).GetIsAromatic()) # False new_smiles = Chem.MolToSmiles(mol) print(new_smiles ) # C1=CC=CC=C1mol = Chem.MolFromSmiles(new_smiles) print(mol.GetBondWithIdx(0).GetIsAromatic()) # True print(Chem.MolToSmiles(mol)) # c1ccccc1

附錄：

We need to talk about Kekulization, Aromaticity and SMILES

總結

以上是生活随笔為你收集整理的rdkit Kekulize的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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