基于Python和RDKit對化合物數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理。

 

環(huán)境

MolVS是專門用于化合物預(yù)處理的庫。

• rdkit 2020.03
• molvs 0.1.1

 

化合物（Compound）預(yù)處理

RDKit：SanitizeMol

Kekure的形成，化合價(jià)的確認(rèn)，芳香性的設(shè)定，結(jié)合等。

參考：http://rdkit.org/docs/source/rdkit.Chem.rdmolops.html

 

MolVS : Normarize

參考：https://molvs.readthedocs.io/en/latest/guide/standardize.html

進(jìn)行了一系列轉(zhuǎn)換，以修復(fù)常見錯(cuò)誤并標(biāo)準(zhǔn)化特征組。

from rdkit import

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的RDKit | 基于RDKit 的化合物预处理的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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