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编程问答

RDKit | 处理RDKit分子Mol对象

發布時間:2023/12/31 编程问答 28 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 RDKit | 处理RDKit分子Mol对象 小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.

Mol對象的組成

由于Mol對象是分子,因此它們自然是由原子組成的。分子是通過原子間鍵的形成而形成的。

 

導入庫

from rdkit import rdBase, Chem from rdkit.Chem import AllChem, Draw print('rdkit version: {}'.format(rdBase.rdkitVersion))

rdkit version: 2019.09.3

載入數據

suppl = Chem.SDMolSupplier('sdf_20200114172835.sdf') mols = [x for x in suppl if x is not None] len(mols)

 

Atom對象

Mol.GetAtoms()
Mol.GetAtomWithIdx(idx) 

 

for mol in

總結

以上是生活随笔為你收集整理的RDKit | 处理RDKit分子Mol对象的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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