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编程问答

RDKit新手入门

發布時間:2023/12/31 编程问答 36 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 RDKit新手入门 小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.

RDKit新手入門

一、RDKit是什么?

開源的化學信息工具包

  • 采用了商業友好的BSD協議
  • 核心數據結構和算法用C++實現
  • 通過Boost.Python技術對RDKit進行封裝,提供Python2/Python3的接口
  • 通過SWIG技術提供Java 和C# 接口
  • 提供了大量對化學分子2D/3D的計算操作
  • 生成用于機器學習的分子描述符
  • 基于PostgreSQL搭建分子數據庫
  • KNIME中的化學信息計算支持(https://www.knime.com/rdkit)

二、安裝

打開anaconda promt,直接在base環境下安裝rdkit,當然也可以換一個環境。

conda install -c rdkit rdkit

或者

pip install rdkit

在anaconda promt 中測試是否安裝成功。在cmd中輸入

python >import rdkit >rdkit.__version

總結

以上是生活随笔為你收集整理的RDKit新手入门的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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