英特尔至强融核助力国家海洋局探索超算应用
海洋本身就是一座幾乎未開發(fā)寶藏,今天我們也只是在用高性能計(jì)算探索出了它們中很小部分的秘密。
據(jù)國家海洋局第一海洋研究所的劉海行主任介紹:國家物理海洋科研手段之一是海洋環(huán)境數(shù)據(jù)模擬,比如海洋數(shù)值模式:根據(jù)海洋中的基本物理定律,確定海洋系統(tǒng)中各個(gè)成份的性狀及其演變的數(shù)學(xué)方程組,并將其在計(jì)算機(jī)上實(shí)現(xiàn)程序化,它使得海洋科學(xué)“可實(shí)驗(yàn)”,同時(shí),它也是研究海洋和進(jìn)行預(yù)報(bào)預(yù)測(cè)的核心手段。
上圖為:據(jù)國家海洋局第一海洋研究所的劉海行主任
海洋數(shù)值模式探索的意義
海洋數(shù)據(jù)模式探索的意義在于:
從理論研究來言,體現(xiàn)了對(duì)物理過程認(rèn)識(shí)及應(yīng)用的水平;
通過觀測(cè)檢測(cè):體現(xiàn)了一個(gè)國家的經(jīng)濟(jì)發(fā)展水平;
數(shù)值模式:體現(xiàn)了一個(gè)國家的海洋的科學(xué)研究能力。
因此,很多國家都高度重視海洋環(huán)境數(shù)據(jù)模擬,國家海洋局第一海洋研究所研發(fā)了自身的高效并行海浪數(shù)據(jù)模式,其具體實(shí)現(xiàn)方式為:
非規(guī)則類矩形分區(qū)方案(二次曲線填充),降低相鄰距離,提高Cache效率,減少鄰居數(shù)和交換點(diǎn)數(shù);
空間格式序列化內(nèi)存存儲(chǔ)方案,避免計(jì)算過程對(duì)計(jì)算點(diǎn)的判斷;
負(fù)載接近絕對(duì)均衡,各分區(qū)計(jì)算點(diǎn)數(shù)相差。
海洋研究的高標(biāo)準(zhǔn)需求
由于上述高性能計(jì)算的復(fù)雜性,對(duì)計(jì)算、存儲(chǔ)及科研能力均提出了很高的需求,在計(jì)算能力方面,需要:
模式計(jì)算:要求8000核,1天可積分3年,1年可積分 1000年;
同化計(jì)算:集合調(diào)整卡曼濾波,10個(gè)集合成員7680核,1天可積分16天;
達(dá)到1/32度:計(jì)算量至少提高30倍。
在存儲(chǔ)需求方面:
模式輸出(IO壓力):每次IO壓力最少20GB,
達(dá)到1/32度。
而在研發(fā)能力方面,更是對(duì)復(fù)合型人才提出了很高的需求:
在模式擴(kuò)展方面:針對(duì)大規(guī)模并行計(jì)算設(shè)計(jì),改進(jìn)模式代碼;
并行方案:針對(duì)應(yīng)用設(shè)計(jì) ,改進(jìn)網(wǎng)格方案;
工具軟件:性能分析,計(jì)算優(yōu)化。
利用英特爾融核架構(gòu)海洋環(huán)境數(shù)值模擬系統(tǒng)
當(dāng)然,辦法總比困難多,國家海洋局最終建立起三維、動(dòng)態(tài)、實(shí)時(shí)、精準(zhǔn)的海洋環(huán)境數(shù)值模擬系統(tǒng),以創(chuàng)新的數(shù)字化技術(shù)加速海洋研究和海洋資源的開發(fā)利用。借助于基于英特爾的高性能計(jì)算平臺(tái)所提供的領(lǐng)先性能和統(tǒng)一編程模型,將英特爾至強(qiáng)融核處理器的領(lǐng)先性能和通用x86結(jié)構(gòu)體系進(jìn)行了完美整合。
據(jù)了解,英特爾至強(qiáng)融核處理器是英特爾首款專門針對(duì)高度并行工作負(fù)載而設(shè)計(jì)的、可獨(dú)立自啟動(dòng)的主處理器,且首次實(shí)現(xiàn)了高帶寬內(nèi)存與高速互聯(lián)技術(shù)的集成。憑借多達(dá)72個(gè)高效內(nèi)核可提供超過3TFLOPs(每秒浮點(diǎn)運(yùn)算次數(shù))的雙精度峰值的計(jì)算能力,消除對(duì)PCIe總線依賴而提供的高可擴(kuò)展性,可集成雙端口英特爾? Omni-Path架構(gòu)(英特爾? OPA)帶來進(jìn)一步降低解決方案成本、能耗和空間占用率的優(yōu)勢(shì),以及與至強(qiáng)處理器相通用的編程模型可保證的軟件與應(yīng)用的兼容性,該處理器為更快速的數(shù)據(jù)分析提供了強(qiáng)勁的計(jì)算引擎與堅(jiān)實(shí)的創(chuàng)新基石。
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總結(jié)
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