簡介
微陣列和其他高通量篩選技術(shù)的興起無疑將成為本世紀的主流。 微陣列芯片的主要優(yōu)勢在于它可以同時大規(guī)模，全面地檢測成千上萬個基因的表達。 例如，通過基因微陣列，可以在短時間內(nèi)發(fā)現(xiàn)可能受疾病影響的基因，并且作為早期診斷的生物標記。

微陣列數(shù)據(jù)分析是用于高通量基因分型和表達分析的序列分析方法。 微陣列可以生成高質(zhì)量的數(shù)據(jù)，并使學術(shù)和研究機構(gòu)能夠快速完成大規(guī)模的PoP研究，從而可以更好地滿足研究項目的持續(xù)發(fā)展要求。 由于微陣列分析可以一次處理大規(guī)模樣品，并且較短的分析周期使研究人員可以快速進行數(shù)據(jù)分析，從而縮短了項目的完成時間，以及快速發(fā)表相關(guān)文章。 目前，市場上常見的商用微陣列平臺包括Affymetrix，Illumina和Nimblegen等。

Microarray 數(shù)據(jù)分析領(lǐng)域：

• 基因表達譜分析。
• miRNA分析。
• 比較基因組雜交（CGH，CGH + SNP）。
• 目標標記，雜交，信號檢測和數(shù)據(jù)分析（CGH）。
• DNA甲基化分析。
• 自定義SNP分析。
• 用于NGS數(shù)據(jù)驗證的定制微陣列。

一般分析流程

主要分析內(nèi)容
微陣列數(shù)據(jù)分析解決方案，包括質(zhì)量控制，差異表達，富集峰檢測，甲基化區(qū)域，插入缺失和SNP調(diào)用，可幫助研究人員從其微陣列數(shù)據(jù)中得出有意義的結(jié)論。

數(shù)據(jù)預處理：數(shù)據(jù)預處理數(shù)據(jù)質(zhì)量控制和數(shù)據(jù)規(guī)范化，數(shù)據(jù)統(tǒng)計。

基因表達分析差異基因表達分析：通過方差分析和倍數(shù)變化確定差異基因表達，繪制火山圖，基因表達熱圖。

聚類分析：K-means聚類分析，層次聚類分析。

基因功能分析：差異表達基因的GO富集分析，差異表達基因的KEGG途徑富集分析。

MetaCorenetwork分析。

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的微阵列数据分析（Microarray data analysis)的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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