常用的MEG/EEG工具包

• MNE-python:?http://mne.tools
  基于python開發的開源軟件包，用于探索，可視化和分析諸如MEG，EEG，sEEG，ECoG等人類神經生理學數據。它包括用于數據輸入/輸出，預處理，可視化，源估計，時頻分析，連接性分析，機器學習和統計的模塊。

• Brainstorm:https://neuroimage.usc.edu/brainstorm/Introduction
  Brainstorm是一款基于MATLAB開發的協作式開源應用程序，致力于分析腦部記錄：MEG，EEG，fNIRS，ECoG，深度電極和動物電生理學。包含常用的數據預處理、時頻分析、溯源分析等。

• Fieldtrip:http://www.fieldtriptoolbox.org/
  FieldTrip是用于MEG，EEG，iEEG和NIRS分析的MATLAB軟件工具箱。它提供了預處理和高級分析方法，例如時頻分析，使用偶極子進行源重構，分布式源和波束形成器以及非參數統計測試。它支持所有主要MEG系統以及最受歡迎的EEG，iEEG和NIRS系統的數據格式。可以輕松添加新的數據格式。 FieldTrip包含高級功能，您可以使用這些功能將自己的分析協議構建為MATLAB腳本。（個人感覺難度稍大，適合已經熟悉MATLAB編程的同學。）

• SPM:https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/
  SPM基于Matlab的用于分析腦成像數據序列的軟件包。序列可以是來自不同隊列的一系列圖像，也可以是來自同一受試者的時間序列。旨在分析fMRI，PET，SPECT，EEG和MEG。

• EEGLAB:https://sccn.ucsd.edu/eeglab/index.php
  EEGLAB是一個交互式Matlab工具箱，用于處理連續的和事件相關的EEG，MEG和其他電生理數據，并結合了獨立成分分析（ICA），時間/頻率分析，偽像排除，事件相關的統計數據以及幾種有用的平均值可視化模式和單次試驗數據。 EEGLAB在Linux，Unix，Windows和Mac OS X下運行。

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分析和可視化復雜的網絡

• Brain Connectivity Toolbox (BCT) [31]
• BrainNet Viewer [32]
• the GCCA toolbox [33] www.anilseth.com,格蘭杰因果分析（Granger）
• the connectome mapper [34]
• Gephi [35]
• the connectome Viewer [36]
• the eConnectome [37]
• the Connectome Visualization Utility (CVU) [38]
• GraphVar [39].

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其他的一些相關工具包

• FastICA: （www.cis.hut.fi/projects/ica/fastica）用于執行ICA分解，在去除偽跡成分后，剩下的功能網絡就可以進行因果連接和源定位分析。

• GIFT 空間ICA分解，成分個數可以通過GIFT工具包的最小描述長度函數加以估計。

• biosig:?http://biosig.sourceforge.net/? BCI 特征提取,數據的預處理（去基線，去眼電肌電偽跡等），特征提取ERD/ERS和CSP等方法，分類器包括LDA和KNN.

• Letswave :免費?letswave.cn,https://www.letswave.org/
  Letswave是一個免費的開源Matlab工具箱，用于分析EEG / MEG和其他神經生理信號。該工具箱位于Github上。與其他信號處理工具箱相比，重點放在直觀且簡化的處理和可視化EEG數據。新版本提供了高級腳本編寫可能性。

• Psychotoolbox 3: 刺激呈現和行為數據記錄

• cartool：https://sites.google.com/site/cartoolcommunity/
  基于C++實現的高效多通道腦電圖的時空分析（只在windows平臺運行），詳細文獻解釋如下：
  https://www.researchgate.net/publication/49772884_Spatiotemporal_analysis_of_multichannel_EEG_CARTOOL

• BrainWave（java）http://home.kpn.nl/stam7883/brainwave.html

• Harvard Automated Processing Pipeline for EEG (HAPPE)：數據預處理、偽跡去除和數據質量評估在實現。(https://github.com/lcnhappe/happe)

• batch electroencephalography automated processing platform (BEAPP) software實現：批處理。(https://github.com/lcnbeapp/beapp)

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總結

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