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编程问答

论文笔记目录(ver2.0)

發(fā)布時(shí)間:2024/3/13 编程问答 35 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 论文笔记目录(ver2.0) 小編覺得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.

1 時(shí)間序列

?

1.1 時(shí)間序列預(yù)測(cè)

論文名稱來源主要內(nèi)容
論文筆記:DCRNN (Diffusion Convolutional Recurrent Neural Network: Data-Driven Traffic Forecasting)_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客iclr 2017使用雙向擴(kuò)散卷積+GRU,建??臻g和時(shí)間依賴性
論文筆記:Learning Traffic as Images: A Deep Convolutional Neural Network for Large-Scale Transportation_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2017 sensor將交通數(shù)據(jù)視作image,使用CNN預(yù)測(cè)
機(jī)器學(xué)習(xí)筆記 soft-DTW(論文筆記 A differentiable loss function for time-series)_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2017 icml

soft-dtw,可微分版本的dtw

PYTORCH 筆記 DILATE 代碼解讀_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客

論文筆記:Forecasting at Scale(Prophet)_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2017 facebook時(shí)間序列分解成趨勢(shì),季節(jié)性和特定節(jié)假日的影響這三類
交通預(yù)測(cè)論文筆記:Spatio-Temporal Graph Convolutional Networks: A Deep Learning Frameworkfor Traffic Forecast_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客IJCAI 2018
論文筆記:Modeling Long- and Short-Term Temporal Patterns with Deep Neural Networks_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2018 SIGIR

CNN+RNN

CNN捕獲變量之間的局部依賴關(guān)系+短期模式

GRU捕獲時(shí)序特征

skip-GRU捕獲長(zhǎng)期時(shí)序特征

將輸出分成線性部分和非線性部分,線性部分用于預(yù)測(cè)局部突變等屬性(自回歸模型),非線性部分是GRU和skip-GRU線性組合得到的,用于預(yù)測(cè)長(zhǎng)期全局特征

交通預(yù)測(cè)論文筆記《Attention Based Spatial-Temporal Graph Convolutional Networks for Traffic Flow Forecasting》_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客AAAI2019

ASTGCN:

1)使用空間注意力機(jī)制來建??臻g層面復(fù)雜的相關(guān)性

2)使用時(shí)間注意力機(jī)制來捕獲不同時(shí)間之間的動(dòng)態(tài)時(shí)間相關(guān)性

3)使用圖卷積來捕獲交通圖中的空間特征;以及不同時(shí)間篇之間的依賴關(guān)系?

論文筆記: Modeling Extreme Events in Time Series Prediction_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2019 KDD

使用記憶網(wǎng)絡(luò)來記憶歷史記錄中的極端事件

開發(fā)了一種新的損失函數(shù),稱為極值損失(EVL)【約束異常事件的分布】

?

?論文筆記 Enhancing the Locality and Breaking the MemoryBottleneck of Transformer on Time Series Forecas_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客NIPS 2019

transformer 用于時(shí)間序列

1,使用因果卷積使得Q,K計(jì)算過程中可以看到一定的局部性

2,提出LogSparse Transformer,將空間復(fù)雜度降至

論文筆記:N-BEATS: NEURAL BASIS EXPANSION ANALYSIS FORINTERPRETABLE TIME SERIES FORECASTING_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客
ICLR 2020

利用深度學(xué)習(xí)解決單變量時(shí)間序列點(diǎn)預(yù)測(cè)問題

提出了一種基于后向和前向殘留鏈路和一個(gè)非常深的全連接層堆棧的深度神經(jīng)結(jié)構(gòu)。該模型具有可解釋性

論文筆記:Unsteady Multi-Element Time Series Analysis and Prediction Based on Spatial-Temporal Attention_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2020 MDPI

時(shí)空注意力機(jī)制

論文筆記 A Spatial-Temporal Decomposition Based Deep Neural Network for TimeSeries Forecasting_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客

時(shí)空數(shù)據(jù)分解+ Conv LSTM

論文筆記:Connecting the Dots: Multivariate Time Series Forecasting with Graph Neural Networks_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2020KDD

自適應(yīng)學(xué)習(xí)鄰接矩陣+時(shí)間卷積+圖卷積

交通預(yù)測(cè)論文翻譯:Deep Learning on Traffic Prediction: Methods,Analysis and Future Directions_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客IEEE Transactions on Intelligent Transportation Systems 2021綜述性質(zhì)論文,同時(shí)給出了一些公共數(shù)據(jù)集
論文筆記:Informer: Beyond Efficient Transformer for Long Sequence Time-Series Forecasting_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客

2021 aaai best paper

定義第i個(gè)query的稀疏性測(cè)量值

選取最大的個(gè)Q,以計(jì)算attention 權(quán)重

計(jì)算M時(shí),選取個(gè) qi,kj對(duì),其他qikj=0

——>對(duì)于self-attention來說,時(shí)間復(fù)雜度為O(LlogL)

論文筆記:Autoformer: Decomposition Transformers with Auto-Correlation for Long-Term Series Forecasting_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2021 NIPS
  • 將趨勢(shì)-周期性分解從數(shù)據(jù)預(yù)處理挪到模型架構(gòu)中;encoder逐步將趨勢(shì)項(xiàng)剝離,decoder再逐步將趨勢(shì)項(xiàng)加上
  • 復(fù)雜度是O(nlogn),但是考慮了所有點(diǎn)(而并不像之前的Transformer一樣進(jìn)行稀疏attention)
  • 同時(shí)用autoCorrelation代替逐點(diǎn)Transformer,通過序列相似度而不是點(diǎn)相似度得到attention
?論文筆記:PYRAFORMER: LOW-COMPLEXITY PYRAMIDAL ATTENTION FOR LONG-RANGE TIME SERIES MODELING AND FORECAST_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2022 ICLR oral

也是金字塔結(jié)構(gòu)的Transformer,和TriFormer的區(qū)別是,這里金字塔不同尺度的點(diǎn),都是由原始時(shí)間序列經(jīng)過卷積操作轉(zhuǎn)化得來的

時(shí)間復(fù)雜度O(L)

論文筆記:FEDformer: Frequency Enhanced Decomposed Transformer for Long-term Series Forecasting_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2022ICML
  • 和AutoFormer類似,也是趨勢(shì)-周期性分解再模型框架中
  • 理論證明了隨機(jī)選擇m個(gè)DFT的譜域元素,可以很好的保留時(shí)間序列的信息
  • 在譜域上進(jìn)行attention
  • 復(fù)雜度是O(n)
論文筆記:COST: CONTRASTIVE LEARNING OF DISENTANGLEDSEASONAL-TREND REPRESENTATIONS FORTIME SERIES FOREC_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客? ? ICLR 2022將時(shí)間序列解耦成趨勢(shì)表征和周期表征,同時(shí)使用了對(duì)比學(xué)習(xí)
?論文筆記 Triformer: Triangular, Variable-Specific Attentions for Long SequenceMultivariate Time Series_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2022 IJCAI使用attention進(jìn)行長(zhǎng)期時(shí)間序列分解。通過patch attention,使得復(fù)雜度維O(n)
論文筆記:TIMESNET: TEMPORAL 2D-VARIATION MODELINGFOR GENERAL TIME SERIES ANALYSIS_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2023 ICLR

將一維時(shí)間序列轉(zhuǎn)換成譜域上的二維時(shí)間序列張量,利用CNN變體模型捕獲周期內(nèi)和周期間時(shí)間序列特征,在短期時(shí)間序列預(yù)測(cè)、長(zhǎng)期時(shí)間序列預(yù)測(cè)、時(shí)間序列補(bǔ)全、時(shí)間序列異常檢測(cè)、時(shí)間序列分類任務(wù)中都表現(xiàn)不俗

論文筆記:Are Transformers Effective for Time Series Forecasting?_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客AAAI2023 oral

一個(gè)簡(jiǎn)單的線性模型,在時(shí)間預(yù)測(cè)上效果比基于Transformer的模型都要好——>作者質(zhì)疑Transformer是否可以很好地適用于時(shí)間序列預(yù)測(cè)問題中

Transformer模型建模時(shí)間序列依賴性,是不是主要依靠podition embedding和temporal embedding?

論文筆記:A Time Series is Worth 64 Words: Long-term Forecasting with Transformers_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2023 ICLR

將相鄰時(shí)間序列的點(diǎn)合成一個(gè)patch,進(jìn)行patch級(jí)別的Transformer

?1.2 時(shí)間序列補(bǔ)全

論文名稱來源主要內(nèi)容
論文筆記 Spectral Regularization Algorithms for Learning Large IncompleteMatrices (soft-impute)_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2010 JMLR

基于迭代SVD的矩陣補(bǔ)全(軟閾值+硬閾值)

對(duì)MF有很多理論的證明和說明(寫論文的時(shí)候可以用來參考)

論文筆記:Temporal Regularized Matrix Factorization forHigh-dimensional Time Series Prediction_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客
NIPS 2016

TRMF 輔助論文:最小二乘法復(fù)現(xiàn)TRMF_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客

提出了一個(gè)新的時(shí)間正則化矩陣分解框架(TRMF)用于高維時(shí)間序列分析。

論文筆記 & R 筆記:imputeTS: Time Series Missing ValueImputation in R_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客R語言包,進(jìn)行單變量時(shí)間序列補(bǔ)全
論文筆記:Autoregressive Tensor Factorizationfor Spatio-temporal Predictions_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客ICDM 2017

在TRMF的基礎(chǔ)上,添加了空間自回歸DAR的正則項(xiàng)

論文筆記: BRITS: Bidirectional Recurrent Imputation for Time Series_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2018NIPS雙向LSTM進(jìn)行補(bǔ)全&時(shí)間序列分類/回歸
論文筆記:Hankel Matrix Factorization for Tagged Time Series to Recover Missing Values during Blackouts_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2019 ICDE?對(duì)于連續(xù)數(shù)據(jù)缺失的補(bǔ)全(單變量時(shí)間序列)
論文筆記:NAOMI: Non-Autoregressive MultiresolutionSequence Imputation_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2019NIPS使用雙向RNN+分治(對(duì)抗學(xué)習(xí))的方式進(jìn)行補(bǔ)全
論文筆記:Matrix Completion in the Unit Hypercube via Structured Matrix Factorization_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客
2019IJCAI

EMF,SMF 用于 0~1的打分矩陣補(bǔ)全

論文筆記:Stochastic Weight Completion for Road Networks using Graph Convolutional Networks_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客
ICDE2019graph-autoencoder
論文筆記 Traffic Data Reconstruction via Adaptive Spatial-Temporal Correlations_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客part-c 2019

TAS-LR 論文輔助筆記 & 圖拉普拉斯正則項(xiàng)推導(dǎo)_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客

MF+時(shí)間序列約束自適應(yīng)拉普拉斯正則化空間約束

論文筆記:Time Series Data Imputation: A Survey on Deep Learning Approaches_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客20年(attention之前)的time series 補(bǔ)全論文綜述
論文筆記:Learning Disentangled Representations of Video with Missing Data_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2020 NIPS

帶缺失數(shù)據(jù)的視頻補(bǔ)全、預(yù)測(cè)

使用VAE架構(gòu),將視頻每個(gè)object的每一幀分解成appearance、pose和missingness

論文筆記:Mind the Gap An Experimental Evaluation of Imputation ofMissing Values Techniques in TimeSeries_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客PVLDB 202012種方法的比較
?論文筆記:SAITS: SELF-ATTENTION-BASED IMPUTATION FOR TIMESERIES_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2021?將self-attention運(yùn)用到time-series中
論文筆記:Missing Value Imputation for Multi-view UrbanStatistical Data via Spatial Correlation Learning_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客TKDE 2021
  • ?空間關(guān)聯(lián)性的挖掘
  • ?多維度屬性關(guān)聯(lián)性的問題
  • 時(shí)間信息的缺失
  • 設(shè)計(jì)了一種空間相關(guān)的多核 K 均值 (S-MKKM) 方法來識(shí)別多視圖之間的潛在關(guān)系并捕獲區(qū)域相似性。
  • 提出了一種自適應(yīng)權(quán)重非負(fù)矩陣分解方法,以利用上面學(xué)到的信息來解決多視圖缺失數(shù)據(jù)插補(bǔ)問題。 此外,所提出的方法還考慮了單視圖信息補(bǔ)全模型的特點(diǎn),同時(shí)考慮了 KNN 策略來利用真實(shí)地理信息。
論文筆記:HKMF-T: Recover From Blackouts in TaggedTime Series With Hankel Matrix Factorization_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2021 TKDE?對(duì)于連續(xù)數(shù)據(jù)缺失的補(bǔ)全(延伸到多變量時(shí)間序列)
論文筆記:FILLING THE G AP S: MULTIVARIATE TIME SERIES IMPUTATION BY GRAPH NEURAL NETWORKS_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2022 ICLR

空間encoder時(shí)message passing network

時(shí)空encoder是將message passing network應(yīng)用到GRU里面

論文筆記:Spatial Data Imputation with Landmarks_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客非負(fù)矩陣分解+拉普拉斯約束+landmark(landmark細(xì)節(jié)后續(xù)補(bǔ)充)
論文筆記:Multivariate Time-series Imputation with Disentangled Temporal Representations_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客ICLR2023

使用MF的框架+解耦時(shí)間特征表征,進(jìn)行時(shí)間序列補(bǔ)全

1.3 next-location?

論文名稱來源主要內(nèi)容
論文閱讀筆記:STAN: Spatio-Temporal Attention Network for Next Location Recommendation_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客
提出一種基于注意力機(jī)制的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)架構(gòu),考慮用戶訪問軌跡中每個(gè)訪問點(diǎn)相較于整個(gè)過往訪問軌跡的時(shí)空關(guān)系,以此對(duì)不相鄰非連續(xù)但功能相近的訪問點(diǎn)進(jìn)行關(guān)聯(lián),打破以往僅僅關(guān)聯(lián)連續(xù)、相鄰訪問點(diǎn)的限制。

?1.4 region representation

論文名稱來源主要內(nèi)容
論文筆記:Region Representation Learning via Mobility Flow_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2017 CIKM

使用了flow?graph和spatial graph來學(xué)習(xí)region 向量表征

每一個(gè)點(diǎn)表示(地理空間上的點(diǎn)+時(shí)刻)

1?

1.5 OD prediction

論文名稱來源主要內(nèi)容
?論文筆記:Short-term origin-destination demand prediction in urban rail transit systems: A channel-wise a_交通 inflow outflow_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客

使用歷史OD對(duì),實(shí)時(shí)流入流出信息,預(yù)測(cè)地鐵通行的OD

論文筆記:Contextualized Spatial–Temporal Network for Taxi rigin-Destination Demand Prediction_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2019 IEEE Transactions on Intelligent Transportation Systems

捕獲源區(qū)域和目標(biāo)區(qū)域的局部空間特征,融合氣象數(shù)據(jù)捕獲時(shí)間演化特征,捕獲全局空間特征

release了一個(gè)紐約的OD公開數(shù)據(jù)集

?論文筆記:Stochastic Origin-Destination Matrix Forecasting Using Dual-Stage Graph Convolutional, Recurren_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2020 ICDE張量分解+Ses2Ses GRU+張量乘法,計(jì)算OD隨機(jī)矩陣
論文筆記:Inferring Origin-Destination Flows FromPopulation Distribution_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客TKDE 2022

attention-STGCN捕捉時(shí)空信息+POI分布輔助,作為源區(qū)域和目標(biāo)區(qū)域embedding的權(quán)重

1.6 其他

論文名稱來源主要內(nèi)容
論文筆記:A Comprehensive Survey of Regression Based LossFunctions for Time Series Forecasting_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客時(shí)間序列中常用的12種損失函數(shù)
論文筆記:Constructing spatiotemporal speed contour diagrams: usingrectangular or non-rectangular paralle_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2019 Transportmetrica B使用平行四邊形繪制交通柵格圖

1.7 時(shí)間序列異常檢測(cè)?

論文名稱來源

主要內(nèi)容

論文筆記:Deep Learning for Anomaly Detection inTime-Series Data: Review, Analysis,and Guidelines_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客20年時(shí)間序列異常檢測(cè)綜述

1.8 手機(jī)信令數(shù)據(jù)

論文名稱來源

主要內(nèi)容

論文筆記:基于手機(jī)基站數(shù)據(jù)的混合地圖匹配算法研究_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2014 交通運(yùn)輸系統(tǒng)工程與信息根據(jù)基站切換數(shù)據(jù),還原車輛路段軌跡數(shù)據(jù)
?論文筆記:Enhancing spatial accuracy of mobile phone data usingmulti-temporal dasymetric interpolation_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客INTERNATIONAL JOURNAL OF GEOGRAPHICAL INFORMATION SCIENCE, 2017使用手機(jī)信令數(shù)據(jù)+區(qū)域樓房高度+區(qū)域人口活動(dòng)數(shù)據(jù),精細(xì)化區(qū)域人口分布于情況

?1.9 軌跡相似

論文名稱來源

主要內(nèi)容

論文筆記:Effective and Efficient Sports Play Retrieval with Deep Representation Learning_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客19 KDD

比較體育比賽中兩個(gè)play的相似程度

使用帶負(fù)采樣的skipgram建模play中每一子軌跡段的vector,然后使用

論文筆記:High-performance spatiotemporal trajectory matching across heterogeneous data sources_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2019?Future Generation Computer Systems提出時(shí)空相似度+利用SPark 來進(jìn)行異質(zhì)時(shí)空軌跡相似度計(jì)算
論文筆記:Spatial-Temporal Similarity for Trajectories with Location Noise and Sporadic Sampling_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客21 ICDE

判斷兩個(gè)軌跡相似于否,就是看在某些時(shí)刻(兩個(gè)軌跡采樣時(shí)間的并集),兩個(gè)軌跡都在某一個(gè)網(wǎng)格的概率

軌跡數(shù)據(jù)是有定位誤差和零星采樣問題

?論文筆記:PyTrack: A Map-Matching-Based Python Toolbox for Vehicle Trajectory Reconstruction_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客

python包,用于將GPS軌跡和openstreetmap對(duì)應(yīng)



python 筆記:PyTrack(將GPS數(shù)據(jù)和OpenStreetMap數(shù)據(jù)進(jìn)行整合)【官網(wǎng)例子解讀】_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客

1.10 軌跡匹配

論文名稱來源

主要內(nèi)容

論文筆記:Map-Matching for low-sampling-rate GPS trajectories(ST-matching)_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客ACM-GIS 2009拓?fù)潢P(guān)系+速度,基于HMM的路徑匹配
論文筆記:Hidden Markov Map MatchingThrough Noise and Sparseness_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客09 sigspatial和ST-MATCHING很接近
論文筆記:An Interactive-Voting Based Map Matching Algorithm_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2010 MDM在ST-MATCHING的基礎(chǔ)上,加入了投票的機(jī)制
論文筆記:基于手機(jī)位置信息的地圖匹配算法_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2015 計(jì)算應(yīng)用基本上就是HMMM,多了一個(gè)高采樣率 VS 低采樣率的匹配結(jié)果對(duì)比
論文筆記:路網(wǎng)匹配算法綜述_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客17路網(wǎng)匹配綜述,主要是基于HMM的
?論文筆記:From driving trajectories to driving paths: a survey on map?matching Algorithms_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2022新的路網(wǎng)匹配方法
?論文筆記:L2MM: Learning to Map Matching with Deep Models for Low-Quality GPS Trajectory Data_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2023 TKDD

本質(zhì)上是一種encoder-decoder模型,只不過encoder的輸出這里加上了學(xué)習(xí)pattern這個(gè)限制

?

2 datamining

論文名稱來源主要內(nèi)容
論文筆記:Integrating Classification and Association Rule Mining (CBA算法)_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客1998 KDD
  • 生成類關(guān)聯(lián)規(guī)則的完整集合,這個(gè)集合滿足最小支持度以及最小置信度
  • 建立一個(gè)基于類關(guān)聯(lián)規(guī)則的分類器
Data Mining 論文翻譯:Deep Learning for Spatio-Temporal Data Mining: A Survey_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客

3 其他?

論文名稱來源主要內(nèi)容
論文筆記 Bayesian Probabilistic Matrix Factorizationusing Markov Chain Monte Carlo (ICML 2008)_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客ICML 2008

BPMF論文輔助筆記: 固定U,更新θU 部分推導(dǎo)_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客

https://blog.csdn.net/qq_40206371/article/details/120865455

在模型中使用了馬爾可夫鏈蒙特卡羅(MCMC)方法進(jìn)行近似推理

為超參數(shù)引入先驗(yàn),并在參數(shù)和超參數(shù)上最大化模型的對(duì)數(shù)后驗(yàn),從而允許基于訓(xùn)練數(shù)據(jù)自動(dòng)控制模型的復(fù)雜性?。

論文筆記:[ICLR 2020] Tips for prospective and early-stage PhD students_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客
ICLR 2020
?論文筆記:Honor of Kings Arena: an Environment forGeneralization in Competitive Reinforcement Learning_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客NIPS2022王者榮耀開悟平臺(tái)
論文筆記:A survey of deep nonnegative matrix factorization_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2022DNMF綜述

4 生物

論文名稱來源主要內(nèi)容
生物計(jì)算論文筆記1:The construction of next-generationmatrices for compartmentalepidemic models_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客SEIR模型中基本再生數(shù)R0和下一世代矩陣NGM之間的關(guān)系
論文筆記:Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold (AlphaFold 2 & appendix)_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客

利用Transformer變體,物理和生物知識(shí),預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)3D結(jié)構(gòu)

原子級(jí)別的誤差

論文筆記:BridgeDPI: a novel Graph Neural Network for predicting drug–protein interactions_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2022 bioinformatics在GNN中引入橋節(jié)點(diǎn),以更好地描述蛋白質(zhì)和藥物之間的關(guān)系

?5 圖

5.1 圖聚類

論文名稱來源主要內(nèi)容
論文筆記:Weighted Graph Cuts without Eigenvectors:A Multilevel Approach_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客TPAMI 2007圖中點(diǎn)聚類<——>kernel k-means
機(jī)器學(xué)習(xí)筆記: 聚類 模糊聚類與模糊層次聚類(論文筆記 Fuzzy Agglomerative Clustering :ICAISC 2015)_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客
ICAISC 2015模糊聚類 + 分層聚類
算法/論文筆記 Fluid Communities: A Competitive, Scalable and Diverse Community Detection Algorithm (2017)_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客
2017graph點(diǎn)cluster 算法

5.2 GNN?

論文名稱來源主要內(nèi)容
論文筆記:SEMI-SUPERVISED CLASSIFICATION WITH GRAPH CONVOLUTIONAL NETWORKS_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客ICLR 2017

Kipf GNN

使用一階近似切比雪夫作為卷積核

論文筆記:Graph WaveNet for Deep Spatial-Temporal Graph Modeling_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2019 IJCAI

首次提出自適應(yīng)鄰接矩陣的概念

時(shí)間依賴性:空洞卷積

空間依賴性:擴(kuò)散圖卷積(DCRNN的思路)+自適應(yīng)鄰接矩陣

論文筆記:Adaptive Graph Convolutional Recurrent Network for Traffic Forecasting_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2020 NIPS
  • 圖卷積中每個(gè)節(jié)點(diǎn)一套參數(shù)(為避免節(jié)點(diǎn)過多時(shí)參數(shù)量爆炸,使用了矩陣分解)
  • 自適應(yīng)鄰接矩陣
  • 用上面兩個(gè)模塊替代GRU中的MLP
論文筆記:E(n) Equivariant Graph Neural Networks_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2021ICML

在傳統(tǒng)GNN的基礎(chǔ)上,每個(gè)點(diǎn)不僅有標(biāo)量信息,還有矢量信息,EGNN可以保證矢量經(jīng)過EGNN之后平移、旋轉(zhuǎn)、排列等變性

?論文筆記:GraphSleepNet: Adaptive Spatial-Temporal Graph Convolutional Networks for Sleep Stage Classific_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客
IJCAI自適應(yīng)鄰接矩陣+STGCN+時(shí)空注意力,用于睡眠階段分類
?論文筆記:DropMessage: Unifying Random Dropping for Graph Neural Networks_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2023 AAAI

1 提出了一種新的GNN上的隨即丟棄方法,可以緩解GNN訓(xùn)練時(shí)的過擬合、過渡平滑、不魯棒

2 整合之前的random drop 方法,他們是本文提出的DropMessage的特例

3 從理論上說明了,GNN上的random drop,等價(jià)于在損失函數(shù)上加了正則項(xiàng)

5.3 圖對(duì)比學(xué)習(xí)

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論文筆記:LightGCL: Simple Yet Effective Graph Contrastive Learning for Recommendation_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客ICLR 2023

使用近似奇異值分解以獲得增強(qiáng)圖信息

6 機(jī)器學(xué)習(xí)類

論文名稱來源主要內(nèi)容
論文筆記:On Large-Batch Training for Deep Learning: Generalization Gap and Sharp Minima_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客ICLR 2017大batch size會(huì)導(dǎo)致在測(cè)試集上泛化效果不行,原因在于大batch學(xué)到的local minima太sharp
當(dāng)分布 非正態(tài)分布時(shí),能否使用Pearson Correlation?_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客大部分情況下,Pearson correlation是很robust的,除非數(shù)據(jù)很不正態(tài)分布,且數(shù)據(jù)量不足。論文中比較了12種處理方法,并提出建議
論文筆記:Positive-incentive Noise_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2022 TNNLS噪聲也不都是壞處——>引入任務(wù)熵,判斷噪聲是正激勵(lì)噪聲還是純?cè)肼?/td>

7 強(qiáng)化學(xué)習(xí)

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論文筆記 Hierarchical Reinforcement Learning for Scarce Medical Resource Allocation_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客KDD 2021

使用GRU來求解未知疾病狀態(tài)

使用DQN來或者各區(qū)域重要性排序

使用actor-critic來求解各區(qū)域口罩病床分配情況

論文代碼解讀 Hierarchical Reinforcement Learning for Scarce Medical Resource Allocation_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客

論文筆記:STMARL: A Spatio-Temporal Multi-AgentReinforcement Learning Approach for Cooperative Traffic_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客

使用attention和LSTM進(jìn)行空間和時(shí)間建模,然后對(duì)每個(gè)紅綠燈分別進(jìn)行強(qiáng)化學(xué)習(xí),計(jì)算紅綠燈控制方式

7.1 分層強(qiáng)化學(xué)習(xí)?

論文名稱來源主要內(nèi)容
論文筆記: Feudal Reinforcement Learning_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客用Q-table實(shí)現(xiàn)的最早的層次強(qiáng)化學(xué)習(xí)
分層強(qiáng)化學(xué)習(xí):基于選項(xiàng)(option)的強(qiáng)化學(xué)習(xí)/論文筆記 The Option-Critic Architecture 2017 AAAI_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客AAAI 2017兩層決策,option可以視作一組action的時(shí)域抽象。上層策略現(xiàn)決定選擇哪個(gè)option。然后option再選擇執(zhí)行哪些action,每個(gè)option有自己的策略函數(shù)和終止函數(shù)
論文筆記:When Waiting Is Not an Option:Learning Options with a Deliberation Cost AAAI 2018_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客AAAI 2018在上一篇option-critic的基礎(chǔ)上,認(rèn)為切換option的時(shí)候是有開銷的,不能很頻繁地切換option
論文筆記:Hierarchical Deep Reinforcement Learning:Integrating Temporal Abstraction and Intrinsic_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客

上層函數(shù)mata-controller根據(jù)state,從實(shí)現(xiàn)給定的目標(biāo)集中選擇一個(gè)目標(biāo)傳給底層函數(shù)controller,controller 根據(jù)狀態(tài)s和目標(biāo)g選擇動(dòng)作。

goal作為一個(gè)輸入,所以不同的goal共享相同的Q函數(shù)

論文筆記:FeUdal Networks for Hierarchical Reinforcement Learning_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客

也是上層制定goal,下層實(shí)現(xiàn)。

不過和上一個(gè)H-DQN不同,這里并沒有一個(gè)goal集合,這邊學(xué)習(xí)的goal可以看成是一個(gè)direction,也就是狀態(tài)S 變化的方向。如果下層學(xué)到的策略使得實(shí)際的狀態(tài)按照goal的方向變化,那么reward會(huì)比較大

論文筆記:Universal Value Function Approximators_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客

求解V(s,g)。 由于(s,g)對(duì)很少,所以將s-g對(duì)組成的矩陣進(jìn)行矩陣分解(行state,列g(shù)oal)

8 CV

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論文/機(jī)器學(xué)習(xí)筆記:SENet (Squeeze-and-Excitation Networks)_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2017 ImageNet冠軍學(xué)習(xí)各個(gè)channel重要性權(quán)重,對(duì)channel進(jìn)行重新加權(quán)
論文筆記:Spatial-Temporal Map Vehicle Trajectory Detection Using Dynamic Mode Decomposition and Res-UNe_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客軌跡提取
論文筆記:CTSpine1K: A Large-Scale Dataset for Spinal Vertebrae Segmentation in Computed Tomography_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客一個(gè)大規(guī)模脊柱分割/識(shí)別的數(shù)據(jù)集
論文筆記:nnU-Net: Self-adapting Frameworkfor U-Net-Based Medical Image Segmentation_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客

在經(jīng)典U-Net的基礎(chǔ)上,沒有對(duì)模型架構(gòu)進(jìn)行修改,而是根據(jù)數(shù)據(jù)集自動(dòng)進(jìn)行數(shù)據(jù)預(yù)處理、模型架構(gòu)參數(shù)選擇、訓(xùn)練、inference等

醫(yī)學(xué)影像分割

論文筆記:nnU-Net: a self-configuring method for deep learning-based biomedical image segmentation_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客
論文筆記: Masked Autoencoders Are Scalable Vision Learners_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客
cvpr2021類似于BERT的MLM
論文筆記:Swin-Unet: Unet-like Pure Transformer for MedicalImage Segmentation_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客CVPR 2021swin transformer+u-net
論文筆記:Swin Transformer: Hierarchical Vision Transformer using Shifted Windows_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客ICCV 2021 best paper

基于窗口的transformer,具有多尺度信息,同時(shí)計(jì)算復(fù)雜度和圖像的尺寸呈線性關(guān)系

pytorch 筆記: Swin-Transformer 代碼_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客

論文筆記 TransUNet: Transformers Make Strong Encoders for Medical Image Segmentation_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客
CNN+transformer 作為 Unet的encoder,進(jìn)行醫(yī)學(xué)圖像分割
?論文筆記:Unsupervised Night Image Enhancement: When Layer Decomposition Meets Light-Effects Suppression_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2022 ECCV夜間圖像增強(qiáng)——抑制過曝,增強(qiáng)暗光
論文筆記:Hierarchical Contrast for Unsupervised Skeleton-based Action Representation Learning_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客AAAI 2023 oral

3D骨架姿勢(shì)識(shí)別

使用對(duì)比學(xué)習(xí)

不同于傳統(tǒng)的對(duì)比學(xué)習(xí),論文使用了層次化的對(duì)比學(xué)習(xí)loss,通過時(shí)間域和空間域不同粒度的對(duì)比學(xué)習(xí)loss,共同進(jìn)行優(yōu)化

9 知識(shí)蒸餾

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論文筆記:Asymmetric Temperature Scaling Makes Larger Networks Teach Well Again_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客Nuerips 2022

很多學(xué)者認(rèn)為大的教師網(wǎng)絡(luò),并不能使得小的學(xué)生網(wǎng)絡(luò)學(xué)習(xí)效果好

——>temperature 過大的時(shí)候,導(dǎo)致教師網(wǎng)絡(luò)輸出像uniform-label,類別之間的差異性就沒有了,僅僅起到了一個(gè) label smoothing 的作用

——>temperature 過小的時(shí)候,教師的輸出結(jié)果像 hard-label,導(dǎo)致和正常分類損失相比沒有什么額外的信息

本文通過將知識(shí)蒸餾損失函數(shù)分解,同時(shí)盡心理論分析,提出教師網(wǎng)絡(luò)中正確的logit和錯(cuò)誤的logit,使用的temperature應(yīng)該不一樣:正確的logit對(duì)應(yīng)的τ應(yīng)該大一些,錯(cuò)誤的logit對(duì)應(yīng)的tau應(yīng)該小一些

?論文筆記:Curriculum Temperature for Knowledge Distillation_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客AAAI 2022

temperature自適應(yīng)學(xué):學(xué)生網(wǎng)絡(luò)目標(biāo)是減少KD loss,temperature 目標(biāo)是增大KD loss

同時(shí)學(xué)的過程中增大temperature的權(quán)重,使得學(xué)生網(wǎng)絡(luò)越來越難學(xué)

10 多模態(tài)

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論文筆記:Learning Transferable Visual Models From Natural Language Supervision(CLIP)_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客

CLIP

文本-圖像對(duì)進(jìn)行預(yù)訓(xùn)練,?

11 地震學(xué)

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論文筆記:PhaseNet: a deep-neural-network-based seismic arrival-time pickingmethod_UQI-LIUWJ的博客-CSDN博客2018 Geophysical Journal InternationalUnet+地震預(yù)測(cè)(檢測(cè)P波S波到達(dá)時(shí)間)

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的论文笔记目录(ver2.0)的全部?jī)?nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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