PyMol入门1
PyMol和Chimera的功能類似,據(jù)說Chimera難學(xué)一點(diǎn),那就先從PyMol開始吧!
1. Wizard--demo
先了解PyMol可以展示什么。Wizard--demo--representations。線型,棒狀,球體,表面,網(wǎng),點(diǎn),帶型和卡通。右邊偏下的Demonstrations工具欄里,可以一次點(diǎn)擊認(rèn)識(shí)一下。
2. 導(dǎo)入PDB文件
三種打開PDB的方法:File--open 已經(jīng)下載好的PDB文件;File--Get PDB,輸入4字母PDB code,下載PDB文件;在命令框里輸入fetch PDB的4字母。
PDB文件儲(chǔ)存的地方。雙擊PDB文件打開PyMol,工作路徑為該P(yáng)DB文件所在文件夾。直接打開PyMol,工作路徑為PyMol的安裝文件夾。File--Working Directory可查看當(dāng)前工作路徑。?
3. 對(duì)象展示
右側(cè)中部對(duì)象工具欄,A--Action,S--Show,H--Hide,L--Label,C--Color。可以對(duì)object進(jìn)行非常多操作,自己試試看。點(diǎn)擊object名字,灰色展示,黑色隱藏,跟PS有些類似。
4. 鼠標(biāo)操作
按住左鍵拖拽--旋轉(zhuǎn)調(diào)整object展示角度。
按住滾輪拖拽--移動(dòng)object在視野中的位置。
滑動(dòng)滾輪--切割object,展示不同景深的層。
按住右鍵拖拽--調(diào)整object大小。
總結(jié)
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