文檔介紹：

計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì) ------ 基本方法原理概要與實(shí)踐詳解作者朱瑞新 2011 年 1 月目錄序前言第一章“計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)”與 M OE 概貌一、導(dǎo)言二、“計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)”概貌三、 MOE 概貌四、知識(shí)拓展五、本章小結(jié)六、復(fù)****思考題第二章虛擬組合庫(kù)設(shè)計(jì)一、虛擬組合庫(kù)設(shè)計(jì)的運(yùn)用二、組合化學(xué)與虛擬組合庫(kù)設(shè)計(jì)三、虛擬組合庫(kù)設(shè)計(jì)的方法原理四、虛擬組合庫(kù)設(shè)計(jì)的操作要領(lǐng)五、知識(shí)拓展六、本章小結(jié)七、復(fù)****思考題第三章生物大分子結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)一、生物大分子結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的運(yùn)用二、生物大分子結(jié)構(gòu)測(cè)定與生物大分子結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)三、生物大分子結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的方法原理四、生物大分子結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的操作要領(lǐng)五、知識(shí)拓展六、本章小結(jié)七、復(fù)****思考題第四章定量構(gòu)效關(guān)系 1 一、定量構(gòu)效關(guān)系的運(yùn)用二、構(gòu)效關(guān)系與定量構(gòu)效關(guān)系三、定量構(gòu)效關(guān)系的方法原理四、定量構(gòu)效關(guān)系的操作要領(lǐng)五、知識(shí)拓展六、本章小結(jié)七、復(fù)****思考題第五章藥效團(tuán)模型一、藥效團(tuán)模型的運(yùn)用二、活性特征基團(tuán)和藥效團(tuán)三、藥效團(tuán)模型的方法原理四、藥效團(tuán)模型的操作要領(lǐng)五、知識(shí)拓展六、本章小結(jié)七、復(fù)****思考題第六章分子對(duì)接一、分子對(duì)接的運(yùn)用二、分子(生化)水平的高通量篩選技術(shù)和分子對(duì)接三、分子對(duì)接的方法原理四、分子對(duì)接的操作要領(lǐng)五、知識(shí)拓展六、本章小結(jié)七、復(fù)****思考題第七章全新藥物設(shè)計(jì)一、全新藥物設(shè)計(jì)的運(yùn)用二、片段組學(xué)(基于片段的藥物設(shè)計(jì))和全新藥物設(shè)計(jì)三、全新藥物設(shè)計(jì)的方法原理四、全新藥物設(shè)計(jì)的操作要領(lǐng)五、知識(shí)拓展 23 六、本章小結(jié)七、復(fù)****思考題第八章分子動(dòng)力學(xué)、隨機(jī)動(dòng)力學(xué)和蒙特卡洛一、分子動(dòng)力學(xué)、隨機(jī)動(dòng)力學(xué)和蒙特卡洛的運(yùn)用二、體系全部性質(zhì)測(cè)定和分子動(dòng)力學(xué)/ 隨機(jī)動(dòng)力學(xué)/ 蒙特卡洛三、分子動(dòng)力學(xué)、隨機(jī)動(dòng)力學(xué)和蒙特卡洛的方法原理四、分子動(dòng)力學(xué)、隨機(jī)動(dòng)力學(xué)和蒙特卡洛的操作要領(lǐng)五、知識(shí)拓展六、本章小結(jié)七、復(fù)****思考題第九章 MO E 中其它實(shí)用模塊一、受體- 配體復(fù)合物指紋( PLIF ) 二、大分子質(zhì)子化( Protonate3D ) 三、抗體模建( Antibody Modeler ) 四、知識(shí)拓展五、本章小結(jié)六、復(fù)****思考題參考文獻(xiàn)致謝前言本書(shū)系作者在近年來(lái)為同濟(jì)大學(xué)本科生開(kāi)設(shè)的《計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)》課程所用講義基礎(chǔ)上,經(jīng)擴(kuò)展、補(bǔ)充和修改編寫(xiě)而成。本書(shū)內(nèi)容涵蓋了“計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)”七大研究方向: 1、虛擬小分子生成、 2、大分子結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)、 3、定量構(gòu)效關(guān)系、 4、藥效團(tuán)模型、 5分子對(duì)接、 6、全新藥物設(shè)計(jì)和 7、動(dòng)態(tài)模擬(分子動(dòng)力學(xué)/隨機(jī)動(dòng)力學(xué)/蒙特卡洛) 。并且第一次系統(tǒng)地對(duì)這些技術(shù)的操作進(jìn)行了講解。其中,本書(shū)第一章是對(duì)“計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)”和配合本書(shū)實(shí)例講解的國(guó)際著名軟件 MOE 的全貌進(jìn)行了介紹;第二章到第八章依次對(duì)“計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)”的七大研究方向進(jìn)行了理論和實(shí)踐操作的系統(tǒng)介紹;最后一章對(duì) MOE 中三個(gè)特色模塊進(jìn)行了單獨(dú)介紹。另外,本書(shū)每章還設(shè)有一個(gè)“知識(shí)拓展”,該部分主要是介紹一些更為前沿或熱門(mén)的知識(shí),希望能為讀者的相關(guān)研究或深入學(xué)****起到拋磚引玉的效果。“計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)”是門(mén)非常綜合且前沿的學(xué)科,對(duì)于本科生而言系統(tǒng)的理論學(xué)****將會(huì)嚴(yán)重打擊其學(xué)****的積極性;同樣如果只是科普性的介紹一些新概念或者介紹一些傳奇故事,而不進(jìn)行系統(tǒng)的實(shí)踐操作,那么學(xué)生們的動(dòng)手能力無(wú)法得到很好的訓(xùn)練,這點(diǎn)對(duì)于部分本科畢業(yè)即將要走上工作崗位的同學(xué)顯得尤為重要。因此本書(shū)對(duì)于理論部分的介紹盡量做到簡(jiǎn)明扼要,而對(duì)于實(shí)踐操作的講解盡量做到詳細(xì),以期能夠讓讀者一直保持著“強(qiáng)烈的掌握欲望”快速掌握“計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)”核心技術(shù)。本書(shū)是國(guó)內(nèi)第一本專門(mén)為本科生撰寫(xiě)的《計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)》教材,此外,本書(shū)也將是工業(yè)界相關(guān)人員和研究生的一本非常合適的參考書(shū)。鑒于作者學(xué)識(shí)淺薄,再加上時(shí)間緊迫,書(shū)中定有多處不足,甚至錯(cuò)誤之處,還請(qǐng)各位專家和讀者指出。朱瑞新同濟(jì)大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院 2011-01-05 第一章“計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)”與 MOE 概貌本章內(nèi)容目錄一、 導(dǎo)言二、 “計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)”概貌三、 MOE 概貌四、 知識(shí)拓展五、 本章小結(jié)六、 復(fù)****思考題一、導(dǎo)言“數(shù)學(xué)就是一門(mén)把不同的東西歸結(jié)為相同問(wèn)題的藝術(shù)?！薄狫ules Henri Poincaré (法國(guó)數(shù)學(xué)物理學(xué)家, “最后一位數(shù)學(xué)通才”) “用物理的火炬照亮化學(xué)的暗室?！薄狥riedrich Wilhelm Ostwald (1909 年 Nobel 化學(xué)獎(jiǎng)得主,物理化學(xué)學(xué)科奠基人) “計(jì)算化學(xué)家的時(shí)代即將到來(lái)。到時(shí),若不是成千也有上百的化學(xué)家,為了化學(xué)中日益增多的許多細(xì)節(jié)問(wèn)題將走向計(jì)算機(jī),而不是去實(shí)驗(yàn)室。”——Robert Sanderson Mulliken (1966 年獲諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng),分子軌道理論

內(nèi)容來(lái)自淘豆網(wǎng)www.taodocs.com轉(zhuǎn)載請(qǐng)標(biāo)明出處.

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的计算机辅助药物设计的一般原理,朱瑞新着--_计算机辅助药物设计(Ⅰ)--基本方法原理概要与实践详解.pdf...的全部?jī)?nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。

如果覺(jué)得生活随笔網(wǎng)站內(nèi)容還不錯(cuò)，歡迎將生活随笔推薦給好友。