摘要：

中藥是基于系統(tǒng)生物學(xué)的多組分天然藥物.中藥中的生物活性分子是中藥作用的分子基礎(chǔ).運(yùn)用計算機(jī)輔助藥物設(shè)計方法研究中藥中的活性分子作用的機(jī)理,對于基于中藥的多組分多靶點(diǎn)藥物的開發(fā),對于中藥作用機(jī)理的闡明,對于中藥的現(xiàn)代化有重要的意義.作者在博士期間,做了一些計算機(jī)輔助藥物設(shè)計方法在中藥體系中的應(yīng)用.主要包括以下內(nèi)容: 1.研究中藥復(fù)方血府逐瘀湯中分子在心血管疾病靶標(biāo)-配體空間的分布,得到了血府逐瘀湯中分子在腎素,血管緊張素轉(zhuǎn)化酶Ⅰ,3-羥基-3-甲基戊二酰輔酶A還原酶和P-糖蛋白的靶標(biāo)-配體空間的分布圖,進(jìn)一步探討了血府逐瘀湯中可能存在的混雜藥物機(jī)理. 2.利用計算機(jī)輔助藥物虛擬篩選方法從中草藥三維結(jié)構(gòu),性質(zhì)數(shù)據(jù)庫虛擬篩選得到具有抗血小板聚集的gpⅡb/Ⅲa受體抑制劑,和可能具有抗癌效果的G-四鏈體穩(wěn)定劑并進(jìn)一步經(jīng)過實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證. 3.用分子動力學(xué)和結(jié)合自由能計算方法研究了HCVNS3絲氨酸蛋白酶與一類多酚類抑制劑之間的結(jié)合模式,預(yù)測了它們之間的結(jié)合自由能,為進(jìn)一步設(shè)計和改造:HCVNS3絲氨酸蛋白酶抑制劑提供了結(jié)構(gòu)信息. 4.對14種常見的分子對接打分函數(shù)進(jìn)行了比較,討論了各種打分函數(shù)的優(yōu)缺點(diǎn),為分子對接具體應(yīng)用中打分函數(shù)的選擇提供了參考. 5.用分子動力學(xué)和結(jié)合自由能計算方法研究了兩類選擇性抑制劑與雌性激素受體之間的結(jié)合模式,進(jìn)一步探討了配體在兩個子類型雌性激素受體之間選擇性結(jié)合的機(jī)理. 此外,在第一章中對中藥是基于系統(tǒng)生物學(xué)的多組分多靶點(diǎn)藥物進(jìn)行了綜述,包括多組分多靶點(diǎn)藥物開發(fā)的現(xiàn)狀,系統(tǒng)生物學(xué)的發(fā)展,利用系統(tǒng)生物學(xué)確定中藥活性分子與靶標(biāo)之間的協(xié)同作用是中藥研究的主要方向.在第二章綜述了計算機(jī)輔助藥物設(shè)計虛擬篩選方法,包括分子對接,藥效團(tuán)模型以及相似性比較方法.最后是作者在攻讀博士期間發(fā)表的論文及致謝.

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總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的计算机辅助药物设计 中药,计算机辅助药物设计在中药研究中的应用的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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