四綜述四ＤＯＩ：１０．１２０９５／ｊ．ｉｓｓｎ．２０９５?６８９４．２０１８．０９．００７

計算機輔助藥物設計的研究進展

劉一軻，陳一曦，蔡如意，應沂岑，郭雪媛，趙清璇，初一明一(北京大學醫學部基礎醫學院，北京１００１９１)

收稿日期：２０１８－０７－２５；接受日期：２０１８－０８－１６

基金項目：北京市自然科學基金(７１６２０９９)；國家自然科學基金(８１６０３１１９)；北京市重點學科基礎醫學學科建設項目(ＢＭＵ２０１１０２５４)作者簡介：劉一軻三Ｅ?ｍａｉｌ：１５１０１１３１４４＠ｐｋｕ．ｅｄｕ．ｃｎ通訊作者：初一明三博士三Ｅ?ｍａｉｌ：ｆａｍｏｕｓ＠ｂｊｍｕ．ｅｄｕ．ｃｎ

Ａｄｖａｎｃｅｓｉｎｃｏｍｐｕｔｅｒａｉｄｅｄｄｒｕｇｄｅｓｉｇｎ

ＬＩＵＫｅ，ＣＨＥＮＸｉ，ＣＡＩＲｕ?Ｙｉ，ＹＩＮＧＹｉ?Ｃｅｎ，ＧＵＯＸｕｅ?Ｙｕａｎ，ＺＨＡＯＱｉｎｇ?Ｘｕａｎ，ＣＨＵＭｉｎｇＳｃｈｏｏｌｏｆＢａｓｉｃＭｅｄｉｃａｌＳｃｉｅｎｃｅｓ，ＰｅｋｉｎｇＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙＨｅａｌｔｈＳｃｉｅｎｃｅＣｅｎｔｅｒ，Ｂｅｉｊｉｎｇ１００１９１，Ｃｈｉｎａ

?Ａｂｓｔｒａｃｔ?Ｉｎｒｅｃｅｎｔｙｅａｒｓ，ｗｉｔｈｔｈｅｒａｐｉｄｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔｏｆｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓａｎｄｃｏｍｐｕｔｅｒｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，ｃｏｍｐｕｔｅｒａｉｄｅｄｄｒｕｇｄｅｓｉｇｎ(ＣＡＤＤ)

ｈａｓｍａｄｅｇｒｅａｔｐｒｏｇｒｅｓｓ．ＣＡＤＤ，ｗｈｉｃｈｉｎｃｌｕｄｅｓｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｂａｓｅｄｄｒｕｇｄｅｓｉｇｎ(ＳＢＤＤ)，ｆｒａｇｍｅｎｔ?ｂａｓｅｄｄｒｕｇｄｉｓｃｏｖｅｒｙ(ＦＢＤＤ)ａｎｄｌｉｇａｎｄ?ｂａｓｅｄｄｒｕｇｄｅｓｉｇｎ(ＬＢＤＤ)ｐｅｒｆｏｒｍｓｒａｔｉｏｎａｌｄｒｕｇｄｅｓｉｇｎｂｙｃａｌｃｕｌａｔｉｎｇｌｉｇａｎｄ?ｒｅｃｅｐｔｏｒｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓ．Ｔｈｉｓｐａｐｅｒｍａｉｎｌｙｆｏｃｕｓｅｄｏｎｔｈｅｒｅ?ｓｅａｒｃｈｐｒｏｇｒｅｓｓｏｆｔｈｅｓｅｔｈｒｅｅｄｒｕｇｄｅｓｉｇｎｍｅｔｈｏｄｓ．

?Ｋｅｙｗｏｒｄｓ?ｒａｔｉｏｎａｌｄｒｕｇｄｅｓｉｇｎ；ＣＡＤＤ；ＬＢＤＤ；ＳＢＤＤ；ＦＢＤＤ

?摘一要?近年來，隨著生物信息學和計算機技術的飛速發展，計算機輔助藥物設計(ＣＡＤＤ)取得了巨大的進展三ＣＡＤＤ是通過計算配體與受體的相互作用進行合理藥物設計，包括基于結構的藥物設計(ＳＢＤＤ)二基于片段的藥物設計(ＦＢＤＤ)和基于配體的藥物設計(ＬＢＤＤ)三本文對ＳＢＤＤ二ＦＢＤＤ和ＬＢＤＤ的研究進展進行綜述三

?關鍵詞?合理藥物設計；計算機輔助藥物設計；基于配體的藥物設計；基于結構的藥物設計；基于片段的藥物設計?中圖分類號?Ｒ３一一一?文獻標識碼?Ａ

０一引言

藥物上市是一個耗資巨大并且漫長的過程三在過去的十年中，開發和推向市場的藥物成本增加了近１５０％三但是進入臨床試驗的藥物有９０％最終未能獲得ＦＤＡ批準，其主要原因是合理藥物設計(ｒａｔｉｏｎａｌｄｒｕｇｄｅｓｉｇｎ)中所遇到的各種問題［１］三隨著生物信息學和計算機技術的飛速發展，計算機輔助藥物設計(ｃｏｍｐｕｔｅｒａｉｄｅｄｄｒｕｇｄｅｓｉｇｎ，ＣＡＤＤ)取得了巨大的進展三目前，ＣＡＤＤ可以實現對成千上萬個分子進行快速篩選，不僅降低了藥物研發的成本，而且大大縮短了藥物上市的時間，在藥物研發過程中發揮重要的作用三正因為如此，如何提高ＣＡＤＤ的準確性和靈敏性也成為研究的熱點三根據計算機藥物篩選原理的不同，人們提出了基于結構的藥物設計(ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｂａｓｅｄｄｒｕｇｄｅｓｉｇｎ，ＳＢＤＤ)二基于片段的藥物設計(ｆｒａｇｍｅｎｔ?ｂａｓｅｄｄｒｕｇｄｉｓｃｏｖｅｒｙ，ＦＢＤＤ)和基于配體的藥物設計(ｌｉｇａｎｄ?ｂａｓｅｄｄｒｕｇｄｅｓｉｇｎ，ＬＢＤＤ)三本文對這３種ＣＡＤＤ的研究進展進行綜述三

１一基于配體的藥物設計

在合理藥物設計中，在藥物靶點的蛋白質結構不明確的情況下，ＬＢＤＤ是目前最合理的藥物設計方法三ＬＢＤＤ是通過分析已知的與受體結合的配體結構來進行藥物設計，又稱為間接藥物設計，包括藥效團模型二定量結構?活性關系模型(ｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅｓｔｒｕｃ?ｔｕｒｅ?ａｃｔｉｖｉｔｙｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ，ＱＳＡＲ)［２］三藥效團是藥效特征元素的集合，保持化合物活性所需的結構特征，可以反映這些化合物在三維結構上的一些共同原子二基因或化學功能結構及空間取向，這些往往決定著配體的活性，以此分析已知的與受體結合的配體的共同藥效特征來篩選藥物［３］三ＱＳＡＲ是通過以配體和靶點的三維結構為基礎，根據分子內能變化和分子間相互作用的能量變化，將已知的一系列藥理的理化性質和三維結構參數擬合出定量關系，再進行優化改造，因此ＱＳＡＲ不僅可以模擬結合受體的配體的結構特征，還可以預測藥物的活性，自從ＣｏｒｗｉｎＨａｎｓｃｈ建立了ＱＳＡＲ的方法以來［４］，ＱＳＡＲ經過不斷的改進和優化，

１

３轉化醫學電子雜志(Ｅ?ＪＴｒａｎｓｌＭｅｄ)２０１８，５(９)

總結

以上是生活随笔為你收集整理的计算机辅助药物设计 fda,计算机辅助药物设计的研究进展的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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