為什么使用命令行？

大多數計算機用戶只熟悉圖形用戶界面(GUI：graphical user interface)，并且產品供應商和此領域的學者會灌輸給永華這樣的思想，命令行界面(CLI：command line interface)是過去使用的一種很恐怖的東西。

一個好的命令行界面，是用來和計算機進行交流溝通的非常有效的方式，“圖形用戶界面讓簡單的任務更容易完成，而命令行界面使完成復雜的任務成為可能”。

生物信息領域，能高效處理大量的數據。生物信息的軟件大多為開源軟件，LINUX版本。它是一個多用戶的操作系統，充分利用購置的硬件資源和軟件資源。

什么是shell？

shell就是一個程序，它接受從鍵盤輸入的命令，然后把命令傳遞給操作系統去執行。

bash(Bourne Again SHell)，最初Unix上有Steve Bourne寫成shell程序sh的增強版。

終端仿真器

當使用圖形用戶界面時，我們需要另一個和shell交互的叫做終端仿真器的程序。

** 在Mac里就是Terminal **

第一個按鍵

qiyindeMacBook-Pro:~ qiyin$

這叫做shell提示符，通常包括你的用戶名和主機名，緊接著是當前工作目錄和一個美元符號。

輸入6789，這個命令沒有意義，shell會提示錯誤信息。

命令歷史

iyindeMacBook-Pro:~ qiyin$ 6789

-bash: 6789: command not found

qiyindeMacBook-Pro:~ qiyin$ 6789

如果按下上箭頭，會看到剛才輸入的命令，這就叫做命令歷史。一般保存最后輸入的500個命令，按下下箭頭按鍵，先前輸入的命令消失。

輸入簡單的命令行

qiyindeMacBook-Pro:~ qiyin$ date

2018年 1月19日 星期五 10時15分22秒 CST

qiyindeMacBook-Pro:~ qiyin$ cal

一月 2018

日 一 二 三 四 五 六

1 2 3 4 5 6

7 8 9 10 11 12 13

14 15 16 17 18 19 20

21 22 23 24 25 26 27

28 29 30 31

結束終端會話

輸入exit命令來終止一個終端會話。

文件系統中的跳轉

pwd-print name of current working directory (打印當前工作目錄名)

cd-change direttory(更改目錄)

ls-list directory contents(列出目錄內容)

理解文件系統樹

所有文件組成一棵樹型目錄，這個目錄樹可能包含文件和其他目錄。文件系統中的第一級目錄稱為根目錄，根目錄包含文件和子目錄，子目錄包含更多的文件和子目錄，以此類推。

qiyindeMacBook-Pro:~ qiyin$ pwd

/Users/qiyin

這是我的家目錄，家目錄是唯一允許用戶對文件進行寫入的地方

絕對路徑

絕對路徑開始于根目錄，緊跟著目錄樹的一個個分支，一直到達所期望的目錄或文件。

相對路徑

相對路徑開始于工作目錄。

特殊的符號表示相對位置

“.”指的是工作目錄

“..”指的是工作目錄和父目錄

絕對

相對

from /Users/qiyin to /Users

cd /Users

cd ..

from /Users to /Users/qiyin

cd /Users/qiyin

cd ./qiyin

qiyindeMacBook-Pro:~ qiyin$

qiyindeMacBook-Pro:~ qiyin$ pwd

/Users/qiyin

qiyindeMacBook-Pro:~ qiyin$ cd /Users

qiyindeMacBook-Pro:Users qiyin$ pwd

/Users

qiyindeMacBook-Pro:Users qiyin$ cd /Users/qiyin

qiyindeMacBook-Pro:~ qiyin$ pwd

/Users/qiyin

qiyindeMacBook-Pro:~ qiyin$ cd ..

qiyindeMacBook-Pro:Users qiyin$ pwd

/Users

qiyindeMacBook-Pro:Users qiyin$ cd ./qiyin

qiyindeMacBook-Pro:~ qiyin$ pwd

/Users/qiyin

tip:"./"可以省略

ls樂趣

通過ls,我們可以知道目錄的內容，以及各種各樣重要文件和目錄的屬性。

選項和參數

命令名經常會帶有一個或多個用來更正命令行為的選項，選項后面會帶有一個或多個參數，這些參數是命令作用的對象。

大多數命令使用的選項，是由一個中劃線加上一個字符組成，例如“-l”.

ls命令選項

表

確定文件類型

用file命令來確定文件的類型，形式為“file filename”

瀏覽文件內容

用less命令來瀏覽文本文件的程序，形式為“less filename”

例如，要查看一個定義了系統中全部用戶身份的文件，輸入“less /etc/passwd”

表

操作文件和目錄

cp - 復制文件和目錄

mv - 移動/重命名文件和目錄

mkdir - 創建目錄

rm - 刪除文件和目錄

ln - 創建硬鏈接和符號鏈接

通配符

shell頻繁的使用文件名，shell提供了特殊字符來幫助你快速指定一組文件名。這些特殊字符叫做通配符，使用它允許你依據字符類型來選擇文件名。

rm命令用到通配符，用ls命令來測試，看到要刪除的文件列表。

硬鏈接與符號鏈接

每個文件默認會有一個硬鏈接，這個硬鏈接給予文件名字。我們每創建一個硬鏈接，就為一個文件創建了一個額外的目錄項。

創建符號鏈接是為了克服硬鏈接的兩個缺點：硬鏈接不能跨越物理設備，硬鏈接不能關聯目錄，只能是文件。符號鏈接生效，是通過創建一個特殊類型的文件，這個文件包含一個關聯文件或目錄的文本指針。

什么是鏈接？

鏈接簡單說是一種文件共享的方式，是POSIX中的概念，主流文件系統都支持鏈接文件。可以理解為windows中常見的快捷方式。

不是很明白？

跳轉大佬的科普文，看完后，再通過練習感受一下吧！

練習

1、創建目錄playground

2、在playground的目錄下創建dir1、dir2

3、復制文件

從/etc目錄復制passwd到當前目錄，使用cp命令，再執行ls命令看到文件

qiyindeMacBook-Pro:playground qiyin$ cp /etc/passwd .

qiyindeMacBook-Pro:playground qiyin$ ls -l

total 16

drwxr-xr-x 2 qiyin staff 68 1 20 17:12 dir1

drwxr-xr-x 3 qiyin staff 102 1 20 17:12 dir2

-rw-r--r-- 1 qiyin staff 5925 1 22 23:08 passwd

注意 在命令末尾加個“ .”，就是將passwd復制快捷方式到當前目錄

4、移動和重命名文件

將passwd重命名為fun，用到mv命令。將fun移動到dir1。再把fun從dir1移動到目錄dir2,最后把fun文件帶回到當前目錄。

tips:這里移動和重命名都是mv命令，所以在同一個文件夾下面，就執行重命名。在不同文件夾，并且那個文件夾沒有的文件，就是移動。

qiyindeMacBook-Pro:playground qiyin$ mv passwd fun

qiyindeMacBook-Pro:playground qiyin$ mv fun dir1

qiyindeMacBook-Pro:playground qiyin$ mv dir1/fun dir2

qiyindeMacBook-Pro:playground qiyin$ mv dir2/fun .

qiyindeMacBook-Pro:playground qiyin$ ls

dir1 dir2 fun

5、創建硬鏈接

"ls -li"可以展示文件索引節點的信息，第一字段中，fun和fun-hard共享一樣的索引節點號，證實這兩個文件是一樣的文件。

qiyindeMacBook-Pro:playground qiyin$ ln fun fun-hard

qiyindeMacBook-Pro:playground qiyin$ ln fun dir1/fun-hard

qiyindeMacBook-Pro:playground qiyin$ ln fun dir2/fun-hard

qiyindeMacBook-Pro:playground qiyin$ ls -li

total 32

9860853 drwxr-xr-x 3 qiyin staff 102 1 22 23:45 dir1

9860854 drwxr-xr-x 3 qiyin staff 102 1 22 23:46 dir2

9990311 -rw-r--r-- 4 qiyin staff 5925 1 22 23:08 fun-hard

9990311 -rw-r--r-- 4 qiyin staff 5925 1 22 23:08 fun

6、創建符號鏈接(軟連接)

這里使用了相對路徑，也可以使用絕對路徑：

“ln -s /Users/qiyin/playground/fun dir1/fun-sym”

可以看到創建的符號鏈接中文件索引節點和原來的是不一樣的。

qiyindeMacBook-Pro:playground qiyin$ ln -s ../fun dir/fun-sym

qiyindeMacBook-Pro:playground qiyin$ ln -s ../fun dir1/fun-sym

qiyindeMacBook-Pro:playground qiyin$ ln -s ../fun dir2/fun-sym

qiyindeMacBook-Pro:playground qiyin$ ls -l dir1

total 24

-rw-r--r-- 4 qiyin staff 5925 1 22 23:08 fun-hard

lrwxr-xr-x 1 qiyin staff 6 1 23 00:07 fun-sym -> ../fun

qiyindeMacBook-Pro:playground qiyin$ ls -li

total 40

9860853 drwxr-xr-x 4 qiyin staff 136 1 23 00:07 dir1

9860854 drwxr-xr-x 4 qiyin staff 136 1 23 00:07 dir2

9990311 -rw-r--r-- 4 qiyin staff 5925 1 22 23:08 fun-hard

9990311 -rw-r--r-- 4 qiyin staff 5925 1 22 23:08 fun

9993619 lrwxr-xr-x 1 qiyin staff 3 1 23 00:05 fun-sym -> fun

總結

以上是生活随笔為你收集整理的关于linux命令的书,关于LINUX命令行（一）的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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