centOS6.5下openfoam-2.4.0安装及并行实现
生活随笔
收集整理的這篇文章主要介紹了
centOS6.5下openfoam-2.4.0安装及并行实现
小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.
在華為云進行openfoam并行測試,采用nfs共享進行openfoam-2.4.0的安裝并行。
系統為centOS6.5,只支持openfoam-2.4.0以下版本的源代碼編譯。
參考:
https://blog.csdn.net/ztq157677114/article/details/49819925
所需程序安裝包包括
Openfoam-2.4.0、Thirdparty-2.4.0
依賴庫安裝包包括:
gcc-4.8.5,gmp-5.1.2,mpfr-3.1.2,mpc-1.0.1,boost-1.55.0,llvm-3.4.src.tar.gz, qt-everywhere-opensource-src-4.7.3.tar.gz
并行安裝包
Mpich-3.3或openmpi-1.8.5,openfoam第三方庫中的openmpi-1.8.5有問題,需要重新下載。采用mpich并行需要修改openfoam-2.4.0/etc/config下的setting.sh文件以及openfoam-2.4.0/etc/bashrc文件。
a)?創建路徑,解壓縮。安裝目錄/opt/OpenFOAM。
??? /opt/OpenFOAM為安裝包默認安裝路徑,嘗試過修改為其他路徑,但總是出現腳本路徑報錯。腳本中路徑邏輯關系太煩了,就用的默認路徑。
??? mkdir /opt/OpenFOAM
??? tar -zxf OpenFOAM-2.4.0.tgz -C /opt/OpenFOAM/
??? tar -zxf ThirdParty-2.4.0.tgz -C /opt/OpenFOAM/
??? cd /opt/OpenFOAM
b)?修改配置文件
??? 需要修改的文件有兩個,分別是位于/opt/OpenFOAM/OpenFOAM-2.4.0/etc/bashrc和/opt/OpenFOAM/OpenFOAM-2.4.0/etc/config/settings.sh。
foamInstall 修改文件安裝目錄
foamCompiler 選擇編譯器,ThirdParty表示采用ThirdParty中的第三方編譯器及其他庫來進行編譯。Openfoam不支持混合編譯,如gcc用系統自帶,cgal用thirdParty中的軟件,這種不支持。需要全部用系統自帶或者全部為第三方庫。
雖然我安裝服務器為centOS中gcc為4.8.5,但依然選用ThirdParty
WM_MPLIB=MPICH,選擇并行軟件,默認systemOpenMPI。選擇openmpi,默認版本為1.8.5。我在安裝時openmpi-1.8.5不能實現并行,無論是采用thirdParty自帶openmpi或者官方下載的openmpi。根據官方論壇所述,系統自帶openmpi存在問題,在2.4.5后續版本已經修復。
選擇MPICH,系統默認版本為mpich2-1.1.1p1,需要在setting.sh中修改為mpich3.3。安裝時要保持文件夾名稱一致。
setting.sh
?
注意:嚴格按照settings.sh文件中規定的版本下載相應的包并解壓到ThirdParty目錄下,解壓后的名字和圖片中的一致。需要下載的包有gcc-4.8.2,mpfr-3.1.2, gmp-5.1.2, mpc-1.0.1, boost-1.55.0,llvm-3.4.src.tar.gz,qt-everywhere-opensource-src-4.7.3.tar.gz
加入環境變量:
vim ~/.bashrc
source /opt/OpenFOAM/OpenFOAM-2.4.0/etc/bashrc
export PLATFORM=/opt/OpenFOAM/ThirdParty-2.4.0/platforms
關閉.bashrc
生效source ~/.bashrc
配置完成 開始編譯
cd /opt/OpenFOAM/ThirdParty-2.4.0
tar -jxvf gcc-4.8.5.tar.bz2
mkdir gcc-4.8.5
進入安裝目錄
./configure –prefix=/opt/OpenFOAM/ ThirdParty-2.4.0/ gcc-4.8.5
make
make install
gcc –v???? ###正確后將編譯后文件拷貝到$PLATFORM/linux64/gcc-4.8.5/目錄
vim /root/.bashrc??? //加入環境變量
export PATH=$PLATFORM/linux64/gcc-4.8.5/bin:$PATH
LD_LIBRARY_PATH=$PLATFORM/linux64/gcc4.8.5/lib:$PLATFORM/lnux64/gcc4.8.2/lib64:$PLATFORM/linux64/mpc1.0.1/lib:$PLATFORM/linux64/mpfr-3.1.2/lib:$PLATFORM/linux64/gmp5.1.2/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export LD_LIBRAYR_PATH
###保存退出
source /root/.bashrc
安裝完成查看版本gcc –version,若為4.8.5則安裝成功
./makeCmake
編譯成功后,添加環境變量
export PATH=$PLATFORM/linux64Gcc/cmake-2.8.12.1/bin:$PATH
若自帶腳本編譯不成功,可獨立編譯。參考gcc編譯過程
makeCGAL的軟件安裝包名稱需要修改。
./makeCGAL
export PATH=$PLATFORM/linux64Gcc/CGAL-4.6/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=$PLATFORM/linux64Gcc/CGAL4.6/lib:$LD_LIBRARY_PATH
./makeLLVM
export PATH=$PLATFORM/linux64/llvm-3.4/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=$PLATFORM/linux64/llvm-3.4/lib:$LD_LIBRARY_PATH
./makeQt
export PATH=$PLATFORM/linux64Gcc/qt-4.7.3/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=$PLATFORM/linux64Gcc/qt-4.7.3/lib:$LD_LIBRARY_PATH
cd /opt/OpenFOAM/ThirdParty-2.4.0/scotch_6.0.3/src
make
make install
完成后將編譯后文件夾拷貝到$PLATFORM/linux64/ scotch_6.0.3/目錄
或者./Allwmake 編譯
進入安裝文件夾
./configure? --prefix=/opt/OpenFOAM/ ThirdParty-2.4.0/ mpich-3.3
make
make install
export PATH=$PLATFORM/linux64Gcc/mpich2-1.1.1p1/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=$PLATFORM/linux64Gcc/mpich2-1.1.1p1/include: $LD_LIBRARY_PATH
測試是否成功: whereis mpirun 顯示安裝目錄則成功
cd /opt/OpenFOAM/OpenFOAM-2.4.0
./Allwmake
編譯成功,若需日志,可采用./Allwmake >allmake.log? 2>&1 &
?
總結
以上是生活随笔為你收集整理的centOS6.5下openfoam-2.4.0安装及并行实现的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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