计算机辅助药物设计局限,计算机辅助药物设计高效低耗
德國(guó)研究人員近日發(fā)表一份報(bào)告聲稱,利用計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)正離我們?cè)絹?lái)越近。無(wú)需很久,包括癌癥、關(guān)節(jié)炎、艾滋病在內(nèi)的眾多疾病相關(guān)藥物將完全產(chǎn)生于計(jì)算機(jī),以往所依靠的經(jīng)驗(yàn)式重復(fù)篩選法將被拋棄。報(bào)告將發(fā)表在3月24日出版的《美國(guó)化學(xué)會(huì)志》(JACS)上。
盡管篩選并不是新藥開(kāi)發(fā)的唯一途徑,但卻是必不可少的手段,如何進(jìn)行低耗而高效的篩選、縮短藥物產(chǎn)生的時(shí)間,一直是制藥界不斷追求的目標(biāo)。
藥物設(shè)計(jì)是多種科學(xué)交叉綜合的產(chǎn)物,人類基因研究和蛋白組學(xué)的日新月異,已給藥物呈現(xiàn)了新的作用靶點(diǎn)和作用機(jī)制。現(xiàn)有的計(jì)算機(jī)資源也有足夠能力開(kāi)展藥物設(shè)計(jì),分析潛力藥物的化學(xué)結(jié)構(gòu)并給出最佳候選藥品。但影響吸收、分布、消除等參數(shù)的檢測(cè)范圍過(guò)于寬泛,現(xiàn)有程序在區(qū)分有潛力開(kāi)發(fā)成藥物的化合物和非藥物材料的過(guò)程中,尚無(wú)法在同一時(shí)間篩出藥物全部特征。這種局限使計(jì)算機(jī)新藥研發(fā)存在一定風(fēng)險(xiǎn)。
報(bào)告指出,研究員已建立一個(gè)既能體現(xiàn)漸進(jìn)性又能體現(xiàn)高效率的程序系統(tǒng),可在初步篩選出藥物化學(xué)特征后立即給出細(xì)節(jié)。實(shí)驗(yàn)證明,新方法可以在5000個(gè)分子中整理出92%的以往漏失的非藥物材料,提高速度的同時(shí)還避免了有潛力化合物的遺漏。
將設(shè)計(jì)工具和設(shè)計(jì)方法進(jìn)行集成是提高效率最有效途徑。表現(xiàn)在藥物研發(fā)領(lǐng)域即是創(chuàng)意問(wèn)題解決理論與計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)之間的結(jié)合。專家稱這使新藥開(kāi)發(fā)全速奔向一個(gè)新時(shí)代,而這一時(shí)代正是科學(xué)界期待已久的。
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