计算机辅助药物设计局限,计算机辅助药物设计高效低耗
德國研究人員近日發(fā)表一份報告聲稱,利用計算機(jī)輔助藥物設(shè)計正離我們越來越近。無需很久,包括癌癥、關(guān)節(jié)炎、艾滋病在內(nèi)的眾多疾病相關(guān)藥物將完全產(chǎn)生于計算機(jī),以往所依靠的經(jīng)驗式重復(fù)篩選法將被拋棄。報告將發(fā)表在3月24日出版的《美國化學(xué)會志》(JACS)上。
盡管篩選并不是新藥開發(fā)的唯一途徑,但卻是必不可少的手段,如何進(jìn)行低耗而高效的篩選、縮短藥物產(chǎn)生的時間,一直是制藥界不斷追求的目標(biāo)。
藥物設(shè)計是多種科學(xué)交叉綜合的產(chǎn)物,人類基因研究和蛋白組學(xué)的日新月異,已給藥物呈現(xiàn)了新的作用靶點和作用機(jī)制。現(xiàn)有的計算機(jī)資源也有足夠能力開展藥物設(shè)計,分析潛力藥物的化學(xué)結(jié)構(gòu)并給出最佳候選藥品。但影響吸收、分布、消除等參數(shù)的檢測范圍過于寬泛,現(xiàn)有程序在區(qū)分有潛力開發(fā)成藥物的化合物和非藥物材料的過程中,尚無法在同一時間篩出藥物全部特征。這種局限使計算機(jī)新藥研發(fā)存在一定風(fēng)險。
報告指出,研究員已建立一個既能體現(xiàn)漸進(jìn)性又能體現(xiàn)高效率的程序系統(tǒng),可在初步篩選出藥物化學(xué)特征后立即給出細(xì)節(jié)。實驗證明,新方法可以在5000個分子中整理出92%的以往漏失的非藥物材料,提高速度的同時還避免了有潛力化合物的遺漏。
將設(shè)計工具和設(shè)計方法進(jìn)行集成是提高效率最有效途徑。表現(xiàn)在藥物研發(fā)領(lǐng)域即是創(chuàng)意問題解決理論與計算機(jī)輔助藥物設(shè)計之間的結(jié)合。專家稱這使新藥開發(fā)全速奔向一個新時代,而這一時代正是科學(xué)界期待已久的。
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