每日一题:DNA序列
生活随笔
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每日一题:DNA序列
小編覺得挺不錯的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個參考.
一、題目描述
一個DNA序列由A/C/G/T四個字母的排列組合組成。G和C的比例(定義為GC-Ratio)是序列中G和C兩個字母的總的出現(xiàn)次數(shù)除以總的字母數(shù)目(也就是序列長度)。在基因工程中,這個比例非常重要。因為高的GC-Ratio可能是基因的起始點。
給定一個很長的DNA序列,以及要求的最小子序列長度,研究人員經(jīng)常會需要在其中找出GC-Ratio最高的子序列。
輸入描述:輸入一個string型基因序列,和int型子串的長度 n
輸出描述:找出GC比例最高的子串,如果有多個輸出第一個的子串
二、思路分析
從頭遍歷字符串,下標 i 位置到 (i + n) 為一組,計算出每一組中包含 “G” 和 “C” 的個數(shù),找出個數(shù)最多的一組,將這一組的第一個字符下標保存下來,此位置到該位置 + n 處表示的字符串就是 GC-Ratio 最高的子序列。
三,代碼
import java.util.*; public class Main {public static void main(String[] args) {Scanner input = new Scanner(System.in);while (input.hasNext()) {String str = input.next();int n = input.nextInt();int max = 0;int index = 0;for (int i = 0; i <= str.length()-n; i++) {int count = 0;for (int j = i; j < i+n; j++) {if (str.charAt(j)=='G'||str.charAt(j)=='C')count++;}if (count > max){index = i;max = count;}}System.out.println(str.substring(index, index+n));}} }總結(jié)
以上是生活随笔為你收集整理的每日一题:DNA序列的全部內(nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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