如何用mega11進行進化樹分析

1.安裝mega11

這個比較簡單，我就不細說了

2.使用步驟

2.1：打開mega11后，如果你要做進化樹分析，切記，右下角選擇ANALYZE

2.2
選擇Edit 菜單下的Insert Sequence From File
**
2.3
Creat a new alignment

2.4
根據(jù)實際情況選擇DNA或者protein，這里我們選擇protein

2.5
可以把一些對的不整齊的刪除掉

2.6
序列比對，選擇Ailgn by ClustalW

2.7
序列比對，參數(shù)按照默認就行

2.8
導(dǎo)出為Mega Format，然后將當(dāng)前的頁面關(guān)閉

2.9
選擇data菜單中的open a File/Session

2.10
總共有三種方法，分別是鄰接法，最大似然法，最小進化法，這里我選擇鄰接法

2.11
bootstrap replicaitons設(shè)置為1000
number of threads自己根據(jù)實際情況自己設(shè)置

2.12
導(dǎo)出為nwk格式

2.13

2.14
另存為nwk格式

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的mega11进化树分析的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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