字符串最长公共子序列python_求解两个字符串的最长公共子序列
一,問題描述
給定兩個字符串,求解這兩個字符串的最長公共子序列(Longest Common Sequence)。比如字符串1:BDCABA;字符串2:ABCBDAB
則這兩個字符串的最長公共子序列長度為4,最長公共子序列是:BCBA
二,算法求解
這是一個動態規劃的題目。對于可用動態規劃求解的問題,一般有兩個特征:①最優子結構;②重疊子問題
①最優子結構
設 X=(x1,x2,.....xn) 和 Y={y1,y2,.....ym} 是兩個序列,將 X 和 Y 的最長公共子序列記為LCS(X,Y)
找出LCS(X,Y)就是一個最優化問題。因為,我們需要找到X 和 Y中最長的那個公共子序列。而要找X 和 Y的LCS,首先考慮X的最后一個元素和Y的最后一個元素。
1)如果 xn=ym,即X的最后一個元素與Y的最后一個元素相同,這說明該元素一定位于公共子序列中。因此,現在只需要找:LCS(Xn-1,Ym-1)
LCS(Xn-1,Ym-1)就是原問題的一個子問題。為什么叫子問題?因為它的規模比原問題小。(小一個元素也是小嘛....)
為什么是最優的子問題?因為我們要找的是Xn-1和 Ym-1?的最長公共子序列啊。。。最長的!!!換句話說,就是最優的那個。(這里的最優就是最長的意思)
2)如果xn != ym,這下要麻煩一點,因為它產生了兩個子問題:LCS(Xn-1,Ym) 和 LCS(Xn,Ym-1)
因為序列X 和 序列Y 的最后一個元素不相等嘛,那說明最后一個元素不可能是最長公共子序列中的元素嘛。(都不相等了,怎么公共嘛)。
LCS(Xn-1,Ym)表示:最長公共序列可以在(x1,x2,....x(n-1)) 和 (y1,y2,...yn)中找。
LCS(Xn,Ym-1)表示:最長公共序列可以在(x1,x2,....xn) 和 (y1,y2,...y(n-1))中找。
求解上面兩個子問題,得到的公共子序列誰最長,那誰就是 LCS(X,Y)。用數學表示就是:
LCS=max{LCS(Xn-1,Ym),LCS(Xn,Ym-1)}
由于條件 1)? 和? 2)? 考慮到了所有可能的情況。因此,我們成功地把原問題 轉化 成了 三個規模更小的子問題。
②重疊子問題
重疊子問題是啥?就是說原問題 轉化 成子問題后,? 子問題中有相同的問題。咦?我怎么沒有發現上面的三個子問題中有相同的啊????
OK,來看看,原問題是:LCS(X,Y)。子問題有 ?LCS(Xn-1,Ym-1)??? ?LCS(Xn-1,Ym) ?? ?LCS(Xn,Ym-1)
初一看,這三個子問題是不重疊的。可本質上它們是重疊的,因為它們只重疊了一大部分。舉例:
第二個子問題:LCS(Xn-1,Ym) 就包含了:問題?LCS(Xn-1,Ym-1),為什么?
因為,當Xn-1?和 Ym?的最后一個元素不相同時,我們又需要將LCS(Xn-1,Ym)進行分解:分解成:LCS(Xn-1,Ym-1)?和 LCS(Xn-2,Ym)
也就是說:在子問題的繼續分解中,有些問題是重疊的。
由于像LCS這樣的問題,它具有重疊子問題的性質,因此:用遞歸來求解就太不劃算了。因為采用遞歸,它重復地求解了子問題啊。而且注意哦,所有子問題加起來的個數 可是指數級的哦。。。。
這篇文章中就演示了一個遞歸求解重疊子問題的示例。
那么問題來了,你說用遞歸求解,有指數級個子問題,故時間復雜度是指數級。這指數級個子問題,難道用了動態規劃,就變成多項式時間了??
呵呵噠。。。。
關鍵是采用動態規劃時,并不需要去一 一 計算那些重疊了的子問題。或者說:用了動態規劃之后,有些子問題 是通過 “查表“ 直接得到的,而不是重新又計算一遍得到的。廢話少說:舉個例子吧!比如求Fib數列。關于Fib數列,可參考:
求fib(5),分解成了兩個子問題:fib(4) 和 fib(3),求解fib(4) 和 fib(3)時,又分解了一系列的小問題....
從圖中可以看出:根的左右子樹:fib(4) 和 fib(3)下,是有很多重疊的!!!比如,對于 fib(2),它就一共出現了三次。如果用遞歸來求解,fib(2)就會被計算三次,而用DP(Dynamic Programming)動態規劃,則fib(2)只會計算一次,其他兩次則是通過”查表“直接求得。而且,更關鍵的是:查找求得該問題的解之后,就不需要再繼續去分解該問題了。而對于遞歸,是不斷地將問題分解,直到分解為 基準問題(fib(1) 或者 fib(0))
說了這么多,還是要寫下最長公共子序列的遞歸式才完整。借用網友的一張圖吧:)
c[i,j]表示:(x1,x2....xi) 和 (y1,y2...yj) 的最長公共子序列的長度。(是長度哦,就是一個整數嘛)。公式的具體解釋可參考《算法導論》動態規劃章節
三,LCS python實現
1 defLCS(str1, str2):2 c = [[0 for i in range(len(str2)+1)] for j in range(len(str1)+1)]3 for i in range(1, len(str1)+1):4 for j in range(1, len(str2)+1):5 if str1[i-1] == str2[j-1]:6 c[i][j] = c[i-1][j-1] + 1
7 else:8 c[i][j] = max(c[i][j-1], c[i-1][j])9 printc10 return c[-1][-1]11
12 if __name__ == '__main__':13 str1 = 'BDCABA'
14 str2 = 'ABCBDAB'
15 print LCS(str1, str2)
感覺整個代碼就是直接根據上面的那個遞歸表達式寫的。
①第1行定義一個數組來保存最長公共子序列的長度
②第7,8行,就是遞歸表達式的程序表示。就是:? c[i,j] = max{c[i][j-1], c[i-1][j]}
③第10行返回最終結果。
總結
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