TalkingData的Spark On Kubernetes实践
眾所周知,Spark是一個快速、通用的大規(guī)模數(shù)據(jù)處理平臺,和Hadoop的MapReduce計算框架類似。但是相對于MapReduce,Spark憑借其可伸縮、基于內(nèi)存計算等特點,以及可以直接讀寫Hadoop上任何格式數(shù)據(jù)的優(yōu)勢,使批處理更加高效,并有更低的延遲。實際上,Spark已經(jīng)成為輕量級大數(shù)據(jù)快速處理的統(tǒng)一平臺。
Spark作為一個數(shù)據(jù)計算平臺和框架,更多的是關(guān)注Spark Application的管理,而底層實際的資源調(diào)度和管理更多的是依靠外部平臺的支持:
Spark官方支持四種Cluster Manager:Spark standalone cluster manager、Mesos、YARN和Kubernetes。由于我們TalkingData是使用Kubernetes作為資源的調(diào)度和管理平臺,所以Spark On Kubernetes對于我們是最好的解決方案。
如何搭建生產(chǎn)可用的Kubernetes集群
部署
目前市面上有很多搭建Kubernetes的方法,比如Scratch、Kubeadm、Minikube或者各種托管方案。因為我們需要簡單快速地搭建功能驗證集群,所以選擇了Kubeadm作為集群的部署工具。部署步驟很簡單,在master上執(zhí)行:
kubeadm init在node上執(zhí)行:
kubeadm join --token : --discovery-token-ca-cert-hash sha256:具體配置可見官方文檔:https://kubernetes.io/docs/setup/independent/create-cluster-kubeadm/。
需要注意的是由于國內(nèi)網(wǎng)絡(luò)限制,很多鏡像無法從k8s.gcr.io獲取,我們需要將之替換為第三方提供的鏡像,比如:https://hub.docker.com/u/mirrorgooglecontainers/。
網(wǎng)絡(luò)
Kubernetes網(wǎng)絡(luò)默認是通過CNI實現(xiàn),主流的CNI plugin有:Linux Bridge、MACVLAN、Flannel、Calico、Kube-router、Weave Net等。Flannel主要是使用VXLAN tunnel來解決pod間的網(wǎng)絡(luò)通信,Calico和Kube-router則是使用BGP。由于軟VXLAN對宿主機的性能和網(wǎng)絡(luò)有不小的損耗,BGP則對硬件交換機有一定的要求,且我們的基礎(chǔ)網(wǎng)絡(luò)是VXLAN實現(xiàn)的大二層,所以我們最終選擇了MACVLAN。
CNI MACVLAN的配置示例如下:
Pod subnet是10.0.0.0/17,實際pod ip pool是10.0.64.0/20。cluster cidr是10.0.80.0/24。我們使用的IPAM是host-local,規(guī)則是在每個Kubernetes node上建立/25的子網(wǎng),可以提供126個IP。我們還配置了一條到cluster cidr的靜態(tài)路由10.0.80.0/24,網(wǎng)關(guān)是宿主機。這是因為容器在macvlan配置下egress并不會通過宿主機的iptables,這點和Linux Bridge有較大區(qū)別。在Linux Bridge模式下,只要指定內(nèi)核參數(shù)net.bridge.bridge-nf-call-iptables = 1,所有進入bridge的流量都會通過宿主機的iptables。經(jīng)過分析kube-proxy,我們發(fā)現(xiàn)可以使用KUBE-FORWARD這個chain來進行pod到service的網(wǎng)絡(luò)轉(zhuǎn)發(fā):
-A FORWARD -m comment --comment "kubernetes forward rules" -j KUBE-FORWARD -A KUBE-FORWARD -m comment --comment "kubernetes forwarding rules" -m mark --mark 0x4000/0x4000 -j ACCEPT -A KUBE-FORWARD -s 10.0.0.0/17 -m comment --comment "kubernetes forwarding conntrack pod source rule" -m conntrack --ctstate RELATED,ESTABLISHED -j ACCEPT -A KUBE-FORWARD -d 10.0.0.0/17 -m comment --comment "kubernetes forwarding conntrack pod destination rule" -m conntrack --ctstate RELATED,ESTABLISHED -j ACCEPT最后通過KUBE-SERVICES使用DNAT到后端的pod。pod訪問其他網(wǎng)段的話,就通過物理網(wǎng)關(guān)10.0.127.254。
還有一個需要注意的地方是出于kernel security的考慮,link物理接口的macvlan是無法直接和物理接口通信的,這就導(dǎo)致容器并不能將宿主機作為網(wǎng)關(guān)。我們采用了一個小技巧,避開了這個限制。我們從物理接口又創(chuàng)建了一個macvlan,將物理IP移到了這個接口上,物理接口只作為網(wǎng)絡(luò)入口:
這樣兩個macvlan是可以互相通信的。
Kube-dns
默認配置下,Kubernetes使用kube-dns進行DNS解析和服務(wù)發(fā)現(xiàn)。但在實際使用時,我們發(fā)現(xiàn)在pod上通過service domain訪問service總是有5秒的延遲。使用tcpdump抓包,發(fā)現(xiàn)延遲出現(xiàn)在DNS AAAA。進一步排查,發(fā)現(xiàn)問題是由于netfilter在conntrack和SNAT時的Race Condition導(dǎo)致。簡言之,DNS A和AAAA記錄請求報文是并行發(fā)出的,這會導(dǎo)致netfilter在_nf_conntrack_confirm時認為第二個包是重復(fù)的(因為有相同的五元組),從而丟包。具體可看我提的issue:https://github.com/kubernetes/kubernetes/issues/62628。一個簡單的解決方案是在/etc/resolv.conf中增加options single-request-reopen,使DNS A和AAAA記錄請求報文使用不同的源端口。我提的PR在:https://github.com/kubernetes/kubernetes/issues/62628,大家可以參考。我們的解決方法是不使用Kubernetes service,設(shè)置hostNetwork=true使用宿主機網(wǎng)絡(luò)提供DNS服務(wù)。因為我們的基礎(chǔ)網(wǎng)絡(luò)是大二層,所以pod和node可以直接通信,這就避免了conntrack和SNAT。
Spark與Kubernetes集成
由于Spark的抽象設(shè)計,我們可以使用第三方資源管理平臺調(diào)度和管理Spark作業(yè),比如Yarn、Mesos和Kubernetes。目前官方有一個experimental項目,可以將Spark運行在Kubernetes之上:https://spark.apache.org/docs/latest/running-on-kubernetes.html。
基本原理
當(dāng)我們通過spark-submit將Spark作業(yè)提交到Kubernetes集群時,會執(zhí)行以下流程:
- Spark在Kubernetes pod中創(chuàng)建Spark driver
- Driver調(diào)用Kubernetes API創(chuàng)建executor pods,executor pods執(zhí)行作業(yè)代碼
- 計算作業(yè)結(jié)束,executor pods回收并清理
- driver pod處于completed狀態(tài),保留日志,直到Kubernetes GC或者手動清理
先決條件
- Spark 2.3+
- Kubernetes 1.6+
- 具有Kubernetes pods的list, create, edit和delete權(quán)限
- Kubernetes集群必須正確配置Kubernetes DNS[1]
如何集成
Docker鏡像
由于Spark driver和executor都運行在Kubernetes pod中,并且我們使用Docker作為container runtime enviroment,所以首先我們需要建立Spark的Docker鏡像。
在Spark distribution中已包含相應(yīng)腳本和Dockerfile,可以通過以下命令構(gòu)建鏡像:
提交作業(yè)
在構(gòu)建Spark鏡像后,我們可以通過以下命令提交作業(yè):
$ bin/spark-submit \--master k8s://https://: \--deploy-mode cluster \--name spark-pi \--class org.apache.spark.examples.SparkPi \--jars https://path/to/dependency1.jar,https://path/to/dependency2.jar--files hdfs://host:port/path/to/file1,hdfs://host:port/path/to/file2--conf spark.executor.instances=5 \--conf spark.kubernetes.container.image= \https://path/to/examples.jar其中,Spark master是Kubernetes api server的地址,可以通過以下命令獲取:
$ kubectl cluster-info Kubernetes master is running at http://127.0.0.1:6443Spark的作業(yè)代碼和依賴,我們可以在--jars、--files和最后位置指定,協(xié)議支持http、https和HDFS。
執(zhí)行提交命令后,會有以下輸出:
任務(wù)結(jié)束,會輸出:
訪問Spark Driver UI
我們可以在本地使用kubectl port-forward訪問Driver UI:
$ kubectl port-forward <driver-pod-name> 4040:4040執(zhí)行完后通過http://localhost:4040訪問。
訪問日志
Spark的所有日志都可以通過Kubernetes API和kubectl CLI進行訪問:
$ kubectl -n=<namespace> logs -f <driver-pod-name>如何實現(xiàn)租戶和資源隔離
Kubernetes Namespace
在Kubernetes中,我們可以使用namespace在多用戶間實現(xiàn)資源分配、隔離和配額。Spark On Kubernetes同樣支持配置namespace創(chuàng)建Spark作業(yè)。
首先,創(chuàng)建一個Kubernetes namespace:
由于我們的Kubernetes集群使用了RBAC,所以還需創(chuàng)建serviceaccount和綁定role:
$ kubectl create serviceaccount spark -n spark $ kubectl create clusterrolebinding spark-role --clusterrole=edit --serviceaccount=spark:spark --namespace=spark并在spark-submit中新增以下配置:
$ bin/spark-submit \--conf spark.kubernetes.authenticate.driver.serviceAccountName=spark \--conf spark.kubernetes.namespace=spark \...資源隔離
考慮到我們Spark作業(yè)的一些特點和計算資源隔離,前期我們還是選擇了較穩(wěn)妥的物理隔離方案。具體做法是為每個組提供單獨的Kubernetes namespace,計算任務(wù)都在各自namespace里提交。計算資源以物理機為單位,折算成cpu和內(nèi)存,納入Kubernetes統(tǒng)一管理。在Kubernetes集群里,通過node label和PodNodeSelector將計算資源和namespace關(guān)聯(lián)。從而實現(xiàn)在提交Spark作業(yè)時,計算資源總是選擇namespace關(guān)聯(lián)的node。
具體做法如下:
1、創(chuàng)建node label
2、開啟Kubernetes admission controller?
我們是使用kubeadm安裝Kubernetes集群,所以修改/etc/kubernetes/manifests/kube-apiserver.yaml,在--admission-control后添加PodNodeSelector。
3、配置PodNodeSelector
在namespace的annotations中添加scheduler.alpha.kubernetes.io/node-selector: spark=spark。
完成以上配置后,可以通過spark-submit測試結(jié)果:
$ spark-submit --conf spark.kubernetes.authenticate.driver.serviceAccountName=spark --conf spark.kubernetes.namespace=spark --master k8s://https://xxxx:6443 --deploy-mode cluster --name spark-pi --class org.apache.spark.examples.SparkPi --conf spark.executor.instances=5 --conf spark.kubernetes.container.image=xxxx/library/spark:v2.3 http://xxxx:81/spark-2.3.0-bin-hadoop2.7/examples/jars/spark-examples_2.11-2.3.0.jar我們可以看到,Spark作業(yè)全分配到了關(guān)聯(lián)的hadooptest-001到003三個node上。
待解決問題
Kubernetes HA
Kubernetes的集群狀態(tài)基本都保存在etcd中,所以etcd是HA的關(guān)鍵所在。由于我們目前還處在半生產(chǎn)狀態(tài),HA這方面未過多考慮。有興趣的同學(xué)可以查看:https://kubernetes.io/docs/setup/independent/high-availability/。
日志
在Spark On Yarn下,可以開啟yarn.log-aggregation-enable將日志收集聚合到HDFS中,以供查看。但是在Spark On Kubernetes中,則缺少這種日志收集機制,我們只能通過Kubernetes pod的日志輸出,來查看Spark的日志:
$ kubectl -n=<namespace> logs -f <driver-pod-name>收集和聚合日志,我們后面會和ES結(jié)合。
監(jiān)控
我們TalkingData內(nèi)部有自己的監(jiān)控平臺OWL[2](已開源),未來我們計劃編寫metric plugin,將Kubernetes接入OWL中。
混合部署
為了保證Spark作業(yè)時刻有可用的計算資源,我們前期采用了物理隔離的方案。顯而易見,這種方式大幅降低了物理資源的使用率。下一步我們計劃采用混部方案,通過以下三種方式實現(xiàn):
- 將HDFS和Kubernetes混合部署
- 為Spark作業(yè)和Kubernetes node劃分優(yōu)先級,在低優(yōu)先級的node上同時運行一些無狀態(tài)的其他生產(chǎn)服務(wù)
- 利用云實現(xiàn)資源水平擴展,以防止資源突增
資源擴展
在采用以下兩種方法增加資源使用率時,集群可能會面臨資源短缺和可用性的問題:
- 混合部署
- 資源超賣
這會導(dǎo)致運行資源大于實際物理資源的情況(我稱之為資源擠兌)。一種做法是給資源劃分等級,優(yōu)先保證部分等級的資源供給。另一種做法是實現(xiàn)資源的水平擴展,動態(tài)補充可用資源,并在峰值過后自動釋放。
原文鏈接
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總結(jié)
以上是生活随笔為你收集整理的TalkingData的Spark On Kubernetes实践的全部內(nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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