全球疫情肆虐，各大科技公司都在竭盡全力抗擊疫情。3月13日，阿里云對外宣布，將向醫療科研機構、疾控中心等一線病毒研究機構免費開放基因計算服務，可大幅提升宏基因組測序、疫苗研發相關的處理效率，最快只需60秒即可完成新冠病毒的核酸對比工作。

實時熒光定量PCR（RT-PCR）和宏基因組測序（mNGS）是目前用于確診新型冠狀病毒感染的常見方法，PCR操作流程簡單、成本低，但準確率較低，mNGS雖然操作較為復雜，但準確率很高，兩者結合可進一步提升檢測結果的準確性，有效防止病毒變異產生的漏檢。

實驗數據顯示，?mNGS檢測新冠病毒準確率高達95%，但其中核酸序列比對非常耗時，以某患者為例，計算機需要對超過30億個堿基進行一一比對，相同片段超過額定數量，才可判定為確診，通常這一過程需要30分鐘或更久。

此次阿里云免費開放的基因計算服務AGS（Alibaba Genomics Service），基于GPU和容器技術，可大幅提升核酸比對的速度，疾控中心、各大高校、醫院、基因企業等一線病毒研究機可在阿里云上輕松實現包括新型冠狀病毒SARS-CoV-2和39種BetaCov RNA的病原體基因組的檢測，同時也支持科研人員上傳和比對自定義病毒庫。

以一組的宏基因組數據量為3.2Gbase（22M reads）的宏基因組測序數據為例，?科研人員只需在阿里云上通過命令行AGS rna-mapping API 啟動比對過程，隨即阿里云容器服務調度GPU云服務器啟動加速計算，60秒內即可得到高質量匹配reads的數據和初步質量報告，為多種病原體檢測，和進一步的新冠病毒蛋白質研究及變異研究提供快速準確的數據支撐。

此前，阿里云在疫情發生第一時間就宣布向新冠疫苗研發科研機構免費提供一切AI算力，目前已收到了包括浙江大學醫學院、GHDDI全球健康藥物研發中心、清華大學醫學院、北京大學醫學院等國內外數十家權威科研機構的申請，第一批申請的算力資源已部署上線，為疫苗研發提速加碼。

總結

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