目錄1. 注冊(cè)2. 去枝長(zhǎng)3. 加圖例4. 無(wú)根樹顏色5. 導(dǎo)出圖片
iTOL基本用法已經(jīng)會(huì)了，之前記錄過一點(diǎn)：系統(tǒng)發(fā)育（進(jìn)化）樹繪制小結(jié)。最近重用，調(diào)圖時(shí)又發(fā)現(xiàn)了些細(xì)節(jié)，記錄下備忘。

1. 注冊(cè)

不注冊(cè)也可用，但注冊(cè)登錄可保存樹在itol網(wǎng)站上。

2. 去枝長(zhǎng)

進(jìn)化樹能展示枝長(zhǎng)是最好的，能用來判斷材料和群體間的特殊性。但現(xiàn)在大部分文章中的進(jìn)化樹都是去掉了枝長(zhǎng)的，也可以理解，樣本太多，展示不好看。

處理前：

處理后：

3. 加圖例

對(duì)進(jìn)化樹添加分類后的注釋，圖片的圖例是需要自己設(shè)置的。不然就只能導(dǎo)出，用其他軟件添加，或用文字說明。

比如這里我注釋三圈，最內(nèi)圈用range，外兩圈用strip（不懂的看之前文章或看itol示例注釋）。兩部分設(shè)置有點(diǎn)不同。

range的注釋圖例可點(diǎn)開legend即可。可以用鼠標(biāo)自由移動(dòng)圖例的相對(duì)距離。

strip的注釋圖例，需要自定義，如果有多重注釋，注意看選擇的是哪個(gè)數(shù)據(jù)集就對(duì)該數(shù)據(jù)集進(jìn)行設(shè)置。最后同樣的，圖例位置可自由移動(dòng)。

4. 無(wú)根樹顏色

材料過多時(shí)，我們常用無(wú)根樹來展示，這時(shí)一般展示枝長(zhǎng)。很簡(jiǎn)單，去標(biāo)簽，注釋上色即可。

直接拖拽注釋文件上色。

但是由于樹枝太多密集，顏色顯示不是很明顯。需要做一點(diǎn)調(diào)整：將線型調(diào)小一點(diǎn)。

此外，還可以嘗試做一些高級(jí)調(diào)整，如去掉標(biāo)尺、旋轉(zhuǎn)圖片角度等。

但因?yàn)闊o(wú)根樹去掉了標(biāo)簽（樣本名稱），所以沒有range注釋，只有strip類型，需要手動(dòng)設(shè)置圖例（見上）。或者不用圖例，直接在圖片備注中說明即可。

5. 導(dǎo)出圖片

當(dāng)你要導(dǎo)出pdf、png等有長(zhǎng)寬位置信息類型圖片時(shí)，最好選擇Full image，它會(huì)自動(dòng)設(shè)置配置合適你的圖片大小。如果用screen，那么在網(wǎng)頁(yè)上是什么樣，導(dǎo)出就是什么樣，你不好把握尺寸。

另外，如果是png，分辨率也有必要設(shè)置一下，盡量大點(diǎn)。

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的iTOL进化树调图细节记录的全部?jī)?nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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