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python spearman相关系数_Python spearman相关系数不匹配 .

發布時間:2024/9/3 python 70 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 python spearman相关系数_Python spearman相关系数不匹配 . 小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.

所以我有一個數據集,它是分子豐度作為物理參數的函數,我想確定兩者之間的相互關系 . 這兩個參數都跨越了幾個數量級 .

因為兩者不是線性相關的,所以我選擇使用 scipy.stats.spearmanr 中的Spearman等級相關系數 . 但我的問題是結果有時沒有意義,我無法弄清楚我做錯了什么 .

下圖是圖,其中豐度被繪制為三個不同的時間(顏色) . 但奇怪的是,雖然黑線顯示豐度下降,因此負相關系數,但另外兩條線顯示正相關,盡管它們與黑線沒有那么不同!

這是我使用的代碼,我排除了代碼的化妝品部分 .

for t in range(0, len(times)):

ax.loglog(parameter, abunds[t], color=colors[t])

corr_coeffs[t] = stats.spearmanr(np.log10(parameter),np.log10(abundances[t,:])

patches.append(mpatches.Patch(color=colors[t], label="r=" + str(("%.2f"%corr_coeffs[t,0])) + ", p=" + str(("%.2f"%corr_coeffs[t,1])) + " | " + time_label[t]))

legend = plt.legend(handles=patches, fontsize="large", loc='best')

plt.savefig('example.png')

如果有人能向我解釋這種奇怪的行為,我將非常感激 .

總結

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