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roc曲线怎么绘制_利用ROC曲线寻找最佳cutoff值(连续型变量组成的riskscore)

發(fā)布時(shí)間:2024/9/19 编程问答 41 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 roc曲线怎么绘制_利用ROC曲线寻找最佳cutoff值(连续型变量组成的riskscore) 小編覺(jué)得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.

我們?cè)诳磁R床模型類文獻(xiàn)的時(shí)候,雖然??吹接?X-tile 尋找變量的最佳cutoff值,但是有時(shí)候也會(huì)看到有的文章是用ROC曲線來(lái)尋找最佳cutoff值的,下面我們一探究竟吧,注本期所用的連續(xù)型變量為riskscore,而構(gòu)建riskscore的基因表達(dá)量也是連續(xù)型變量。

knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)knitr::opts_chunk$set(warning = F)knitr::opts_chunk$set(message = F)

載入必要的R包

rm(list=ls())library(tibble)library(dplyr)library(tidyr)library(survivalROC)

載入數(shù)據(jù)

clinicalhead(clinical)[1:5,1:5]## 將第一列變成行名clinical % column_to_rownames("sample")

處理時(shí)間

### 將生存時(shí)間轉(zhuǎn)化成年(之前已經(jīng)為年了,所以除以1。如果為天則除以365。月則除以12) clinical$futime=clinical$futime/1 predict_time1=3predict_time2=5

總結(jié)

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