原文見：

Rjava的安裝和介紹?www.bioinfo.online

官方文檔：https://www.rforge.net/rJava/

一、介紹

rjava是一個簡單的R-to-Java的接口。rjava通過JNI在R和java之間建立了橋梁。從而可以在R中創(chuàng)建java對象，調(diào)用java方法。目前，rJava用作JGR，iPlots和JavaGD軟件/軟件包的一部分。

二、安裝Rjava

install.packages('rJava')

三、Rjava的簡單使用

調(diào)用java計(jì)算字符串長度

library(rJava) .jinit() # this starts the JVM s <- .jnew("java/lang/String", "Hello World!") .jcall(s,"I","length") # [1] 12

創(chuàng)建Jframe窗口

library(rJava) .jinit() # this starts the JVM f <- .jnew("java/awt/Frame", "Hello") b <- .jnew("java/awt/Button", "OK") .jcall(f, "Ljava/awt/Component;", "add", .jcast(b, "java/awt/Component")) .jcall(f,, "pack") .jcall(f,, "setVisible", TRUE)

四、安裝可能存在的問題

問題

*** Cannot find any Java interpreter *** Please make sure 'java' is on your PATH or set JAVA_HOME correspondingly

原因：在ubuntu root用戶沒有JAVA_HOME, 創(chuàng)建腳本, 使用root用戶運(yùn)行

#!/bin/bash export JAVA_HOME="<path to jdk>" R CMD javareconf

運(yùn)行結(jié)果

Java interpreter : /home/wy/softwere/jdk1.8.0_231//jre/bin/java Java version : 1.8.0_231 Java home path : /home/wy/softwere/jdk1.8.0_231/ Java compiler : /home/wy/softwere/jdk1.8.0_231//bin/javac Java headers gen.: /home/wy/softwere/jdk1.8.0_231//bin/javah Java archive tool: /home/wy/softwere/jdk1.8.0_231//bin/jar ? trying to compile and link a JNI program detected JNI cpp flags : -I$(JAVA_HOME)/include -I$(JAVA_HOME)/include/linux detected JNI linker flags : -L$(JAVA_HOME)/jre/lib/amd64/server -ljvm gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I/home/wy/softwere/jdk1.8.0_231//include -I/home/wy/softwere/jdk1.8.0_231//include/linux -fpic -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-AitvI6/r-base-3.4.4=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c conftest.c -o conftest.o g++ -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro -o conftest.so conftest.o -L/home/wy/softwere/jdk1.8.0_231//jre/lib/amd64/server -ljvm -L/usr/lib/R/lib -lR ? ? JAVA_HOME : /home/wy/softwere/jdk1.8.0_231/ Java library path: $(JAVA_HOME)/jre/lib/amd64/server JNI cpp flags : -I$(JAVA_HOME)/include -I$(JAVA_HOME)/include/linux JNI linker flags : -L$(JAVA_HOME)/jre/lib/amd64/server -ljvm Updating Java configuration in /usr/lib/R Done.

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的fortify安装_Rjava的安装的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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