[Bash shell] 純文本查看 復(fù)制代碼#! /bin/bash

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#part1:defile your job（第一部分，定義單核任務(wù)，需要根據(jù)你的實(shí)用任務(wù)改動(dòng)）

date >>time

Nproc=40 #prcocess used here （要用的線程數(shù)）

ls *ligand.mol2 >list #list of jobs （所有的任務(wù)放到一個(gè)list里面）

Njob=$(echo $(cat list|wc -l)+1|bc) #total jobs+1 （統(tǒng)計(jì)總?cè)蝿?wù)數(shù)目）

function jobrun #define your job （定義一個(gè)函數(shù)任務(wù)）

{

j=$(cat list|sed -n "$1"p|cut -c 1-4) #$1 is a parameter for jobid ($1作為函數(shù)輸入 即任務(wù)號(hào) 這里首先要找到任務(wù)號(hào)對(duì)應(yīng)的分子)

prepare_dpf42.py -l $j"_ligand.pdbqt" -r $j"_receptor.pdbqt" -o tmp2 #（為了簡(jiǎn)單期間這里沒(méi)有寫(xiě)如何計(jì)算格子 如何計(jì)算格點(diǎn)文件 這里是從準(zhǔn)備dpf文件開(kāi)始）

autodock4 -p $j.dpf -l $j.dlg #（對(duì)接）

}

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#part2:mutiple process framwork （第二部分，多線程框架，可以不用懂不用改動(dòng)）

PID=() #PID is an array to store the pid of your job (PID 用于儲(chǔ)存每個(gè)線程的pid)

for ((i=1;i

do

for ((Ijob=0; Ijob

do

if [[ $i -ge $Njob ]]; #（如果任務(wù)都完成了就退出循環(huán)）

then

break;

fi

if [[ ! "${PID[Ijob]}" ]] || ! kill -0 ${PID[Ijob]} 2> /dev/null; then #（如果線程沒(méi)有被占用）

echo start $i with $Ijob

jobrun $i $Ijob& #（用Ijob線程執(zhí)行任務(wù)i）

PID[Ijob]=$! #（任務(wù)完成 釋放線程Ijob）

i=$((i+1))

fi

done

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wait #（等所有線程都空閑下來(lái)）

done

echo job finished!

date >>time

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的python多线程框架_基于python和bash的多线程任务框架 不要让cpu闲着了的全部?jī)?nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。

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