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编程问答

r导出html怎么保存,做植物谱系图,用Phylomatic软件将网页中的输出结果拷贝到文本文件中, 并另存为phylo...

發布時間:2025/3/11 编程问答 35 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 r导出html怎么保存,做植物谱系图,用Phylomatic软件将网页中的输出结果拷贝到文本文件中, 并另存为phylo... 小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.

我是一個本科生,大四做畢設,要用到Phylomatic在線軟件,我對計算機不是很熟,我的專業也只是環境科學,跟植物無關,所以對此非常不熟悉,用R做完plantlist后,再用Phylomatic在線軟件,要求用將網頁中的輸出結果拷貝到文本文件中, 并另存為 phylo文件, 請注意, 該phylo文件不能有任何擴展名. 該進化樹為Newick格式, 不含Singletons, 因此可以用R的ape讀取并進行數據處理,或者Figtree軟件繪圖. 。這一步不懂,另存為phylo文件是什么意思,然后也不知道怎么用R讀取phylo,希望有大神可以幫忙解決,萬分感謝!!!

((((Calophyllum_inophyllum:111.491,Euonymus_phellomanus:111.491):1.76773,((((Prunus_persica:26.2262,(Sorbus_tianschanica:9.43898,(Malus_baccata:3.70535,Pyrus_communis:3.70536):5.73362):16.7872):56.0678,(Prunus_domestiva:41.147,Prunus_salicinaLindl:41.147)Prunus:41.147,(Cerasus_tomentosa:41.147,Cerasus_tianshanica_Pojark:41.147)Cerasus:41.147,(Malus_prunifolia:41.147,Malus_pomila:41.147)Malus:41.147,Pyrus_armeniaca:82.2941,Padus_asiatica:82.2941,Crataegus_chlorocarpa:82.2941,Amygdalus_triloba:82.2941)Rosaceae:6.98304,Ulmus_pomila:89.2771)Rosales:17.7183,Caragana_arborescen:106.995):6.26322)Fabidae:4.27613,(Acer_platnoides:66.2502,Acer_negundo:66.2502)Sapindaceae:51.2845)Rosidae:1.63077,((((Lonicera_tatarica:7.89802,Lonicera_maackii:7.89802):83.4579,(Viburnum_opulus:75.3851,Sambucus_sibirica:75.3851)Adoxaceae:15.9708)Dipsacales:11.5156,(Catalpa_ovata:56.2405,((Syringa_villosa:15.7174,Forsythia_suspensa:15.7174):23.6353,Forsythia_ovata:39.3526,Syringa_persica:39.3526)Oleaceae:16.8879):46.6309):4.73798,Swida_alba:107.609)Asteridae:11.556)Gunneridae:321.128[NOTE: 1 taxa not matched: NA/Berbeis/Berbeis_macrofolia, ];

z? ? 這是phylomatic軟件生成的文件,求大神可以講解一下怎么另存為phylo文件

總結

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