【学术】60%学者反映实验无法复现?Nature给出五招!
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在倡導開放科學、科研誠信的科研圈里,越來越多的學者開始關注實驗結果的可重復性、實驗數據的可分享性問題。比如,當研究人員在閱讀文獻時,期望能夠重復實驗而深入研究;當審稿人審閱一篇論文時,期望能夠看到更詳細的實驗過程和數據,以確保方法的正確性;當同行想交流研究方法時,則希望能夠快速理解實驗室過程,提高溝通效率。
然而在2016年Nature雜志的一項調查中,60%的調查者認為很難重復其他科學家的實驗;無獨有偶,美國細胞生物學家協會的一項會員調查中,70%的成員也表明很難重復已發表文章中的實驗結果,并認為主要原因是:實驗室過程描述不完整。一方面,是由于缺乏獎勵機制,來鼓勵科研人員在文章中詳細描述實驗過程;另一方面,缺乏相關的培訓和方法來幫助科研人員完整記錄和分享實驗過程。
圖片來自Nature
Nature 在9月份的一篇文章,介紹了利用現代數字平臺技術記錄和分享實驗細節的五個方法:
文本記錄
關于實驗過程與數據的詳細文本記錄是非常必要的。近年來,一些國際期刊、出版社或研究機構已經要求科研人員在論文中提供詳細的實驗細節,如Nature要求作者將與論文相關的實驗細節存儲在數字平臺Protocol Exchange、protocols.io上。一些研究所要求其科研人員在機構知識庫等平臺提交實驗過程及數據等材料。IJAC小編在稿件錄用通知中,也會建議作者將與論文相關的實驗數據等材料匯交至ScienceDB(https://www.doi.org/)。
因此,在投稿前,請做好文檔、實驗日志、數據等詳細記錄,并利用數字平臺技術進行存儲。當他人需要審核這些內容時,可以做到快速、及時地回復。
可視化記錄
你是否考慮過用短視頻來記錄實驗過程?在全媒體融合時代,短視頻的出現加快了人們對內容的接受、理解速度。全球首例視頻期刊Journal of Visualized Experiments(JoVE)雜志在同行評議階段會審核作者提交的實驗內容的文本內容,在稿件錄用后,則派出一個媒體團隊為作者錄制實驗過程,并編輯制作8-15分鐘長的實驗短片,發布在期刊網站。JoVE的視頻短片涉及生物、工程、醫學等9個領域,受到了國際廣泛關注。美國一家癌癥研究機構的一位學者采用視頻方式記錄實驗過程,方便了實驗室新人快速入門。(小廣告來啦:IJAC的視頻號“IJAC-人工智能前沿”也在為作者免費制作研究成果展示短視頻。如您需要制作一段實驗室介紹、實驗流程等短視頻,歡迎聯系我們)。
此外,圖、表形式也是一種直觀、快捷的實驗過程記錄方法,相關的平臺工具有Zenodo、Figshare等。
記錄存儲
根據不同學科的需求,尋求適合的記錄存儲平臺,來記錄或引用實驗細節、實驗過程的機理、數據、或代碼。如面向開源及私有軟件代碼的平臺Github,面向動物實驗的記錄平臺Experimental Design Assistant,面向生物、細胞領域的平臺Resource Identification Portal。
電子實驗室記錄本
基于網絡平臺的電子實驗室記錄本(Electronic lab notebooks),能夠方便實驗室研究人員了解實驗過程的細節、實驗材料和數據,并能鏈接到實驗室知識庫及各種相關材料的存儲數據庫。相對于普通的紙本實驗記錄,電子實驗室記錄本更方便每位使用者按照設定的模板、標準記錄實驗過程,也更便于讀者快速把握重要信息。
交流與溝通
充分、有效的交流也是實驗過程分析與復現的重要方式之一。在實驗過程及數據上傳至網絡數據庫之后,通過數據庫的alter功能及時關注讀者的留言、評價與問題,不僅可以幫助其他人復現自己的實驗過程,也為改進實驗提供了更多思路。
最后,小編非常歡迎讀者留言,分享您的實驗過程及數據的保存與分享方法!一套好的實驗流程記錄習慣,能讓您的科研工作更加高效。
來源
https://www.nature.com/articles/d41586-021-02428-3?
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總結
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