轉錄因子（Transcription factor，TF）是一類能夠以序列特異性方式結合DNA并對基因轉錄起關鍵調控作用的蛋白質，在各種生物過程和疾病發生中起非常關鍵的作用。鑒定、分類和注釋轉錄因子以及分析轉錄因子的調控和功能等一直是研究的熱點和基礎，它們在生物體內形成一套指導基因表達的復雜系統引得眾多科學家濃厚的研究興趣。

為了揭開TF在生物體內調節機制的神秘面紗，科學家們探索了許多實驗方法（如CHIP-seq）和預測工具（如seq logo，Jaspar數據庫等）。

下面介紹由華中科技大學生命科學與技術學院郭安源教授團隊開發的動物轉錄因子注釋和預測數據庫（AnimalTFDB）。

AnimalTFDB數據庫建設工作于2011年11月完成了第一版，至今持續維護和更新了7年，三個版本的文章分別都發表在牛津大學出版社(Oxford University Press)出版物《核酸研究》(Nucleic Acids Research)（2017年影響因子11.56），最新的3.0版本文章于2018年9月11日在線發表

1. AnimalTFDB 3.0 概覽

AnimalTFDB 3.0版本中作者鑒定、分類和注釋了97個物種全基因組水平的125,135個TF基因和80,060個轉錄輔因子基因。其中，根據轉錄因子DNA結合結構域（DBD），將TF進一步分為73個家族，根據TF輔助因子功能分為83個家族。新版本除了在數據上的擴展外，還提供多種搜索瀏覽方式（Famliy、Species或自定義搜索）、2個在線預測工具Predict TF和Predict TFBS（分別可以批量預測轉錄因子和預測DNA序列上的轉錄因子結合位點）、Blast工具和數據下載功能。因為人類轉錄因子使用的廣泛需求，作者在新版AnimalTFDB數據庫中單獨設計了一個人類TF數據庫網絡界面（HumanTFDB：文末）。文章剩余內容<<<<

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總結

以上是生活随笔為你收集整理的AnimalTFDB 3.0：动物转录因子注释和预测的综合资源库的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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