目前，cBioPorta、GEPIA等現有生物學工具為基因表達分析提供了許多有用的可視化和分析工具，但是并不能充分解決實驗生物學家要求的其他一些快速分析。例如，根據初步結果選擇特定的細胞系進行進一步研究，從多個組織和細胞系的RNA水平和蛋白質水平以及磷酸化蛋白分析基因表達，可視化腫瘤與正常組織之間的miRNA表達等。今天，小編就來給大家介紹一個直觀地定量，比較和可視化組織和細胞系中的基因表達的數據庫：GEDS（地址見文末），從mRNA，miRNA和蛋白質水平對基因表達進行定量。GEDS數據庫整合了TCGA，GTEx，CCLE和MCLP4個數據庫標準化的mRNA，miRNA和蛋白質表達數據。

如圖所示，我們可以在不同面板中搜索mRNA，?miRNA和蛋白質的表達。下面我們就來簡要的講解一下具體使用方法。

1. mRNA

在mRNA面板，我們輸入基因名稱CDK1，點擊搜索。

GEDS將以圖片（以箱線圖形式）及表格兩種形式顯示基因的表達譜。

Figure of expression以圖片形式顯示基因的表達譜。主要包括3個方面：

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總結

以上是生活随笔為你收集整理的基因表达可视化工具使用指南的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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