空間基因表達

組織的復雜性使得在分子水平上以高通量的方式識別組織功能變得十分困難。而免疫組織化學和H&E染色是了解基于蛋白質表達和細胞形態的組織結構的基礎工具。近年來空間轉錄組技術的發展將傳統組織學技術的優點與RNA測序的巨大通量結合起來。在基因表達信息上分層的能力提供了更清晰、更全面的生物圖片，這些圖片是在組織切片上捕捉得到。

Visium 空間基因表達解決方案測量完整組織切片中的總 mRNA，并繪制發生作用的基因位置。在現有的實驗室基礎設施中易于采用，該解決方案能夠在多種組織中實現基因表達的空間分辨可視化，而不需要預選。在識別不同細胞群的同時，保持空間環境，以了解細胞功能、表型和組織微環境中位置的關系?，F在，可以通過非常簡單、互補的工作流程和解決方案，在同一樣本中揭示組織的 RNA 和形態表征。

圖1。小鼠腎臟的空間中聚類和基因表達。上面一行描述了組織形態、基因表達和聚類的整體分析，而下面一行描述了對一些特定基因的分析。A.冠狀小鼠腎臟切片H&E染色成像，然后通過Visium空間基因表達工作流進行處理。為包含UMI計數(B)、總基因計數(C)和數據的圖像覆蓋和基于總差異表達基因的空間聚類 (D)。在亞群 2（紅色）中最高表達的前 10 個基因比任何其他聚類顯示在最右邊。可以在單個實驗中分析的許多 mRNA 的例子也有描述：Slc22a8 (E) ,Slc34a1 (F) ,Slc22a12 (G) 和 Umod (H)，所有這些都與已知的表達模式相一致。

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總結

以上是生活随笔為你收集整理的可视化组织内的基因表达的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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