在基于高通量測序的微生物群落分析中，若提到如何描述不同群落β多樣性是否存在差異或者評估組內或組間的差異程度，我們通常可以想到很多方法，這些都是描述群落β多樣性特征的常見分析。例如，一般我們首先會基于微生物分類群豐度數據計算不同群落樣本間的成對相似或相異矩陣，然后通過PCA、PCoA等觀察不同組的群落樣本是否沿特征軸具有明顯的分界，或者通過聚類分析觀察不同組的群落樣本是否劃分到不同的聚類簇中，以及通過一些統計檢驗方法如PERMANOVA等確定不同群落在物種組成方面的差異顯著性，等等……

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那么，如果想通過上述提到的相似或相異矩陣，去比較幾組群落β多樣性的高低，該如何實現呢？因為通常無論相似性或相異指數，都是在反映兩兩群落樣本之間的差異程度，又該如何通過它們描述整體群落的β多樣性的高低水平呢？

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通過相似性或相異指數的數值分布確定Beta多樣性高低

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既然這種樣本間的成對相似或相異矩陣是反映群落β多樣性的一種度量，那么它的數值差異肯定也可以用于描述β多樣性的高低，例如以下兩篇文獻中這樣。

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總結

以上是生活随笔為你收集整理的通过相似性或相异指数的数值分布比较群落Beta多样性高低的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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