?? 免疫腫瘤學的發展使免疫療法成為癌癥治療的有力工具。目前，在腫瘤免疫治療中開發的大多數藥物是阻斷T細胞檢查點受體及其同源配體的單克隆抗體。然而，并非所有患者都能從這些藥物中獲益，而且它們存在一定的副作用。為了解決這些問題，小分子方法已被提出作為輔助治療，它是生物制劑的補充，并顯示出潛在的協同效應。小分子可以調節適應性和先天免疫系統，并最終影響腫瘤微環境中事件的進程。與生物制劑相比，小分子藥物具有可行性高、腫瘤微環境暴露量大、劑型多樣、成本低等優勢。這些優點說明小分子在腫瘤免疫治療中存在機會。研究表明，中藥在免疫調節中起著重要作用，說明它們在癌癥免疫治療中具有廣闊的前景。

? ? ??本文介紹一個中藥免疫腫瘤學綜合數據庫TCMIO, 供研究腫瘤免疫學的同學們參考。數據庫相關論文于2020年4月發表在Frontiers in Pharmacology雜志上

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一、數據庫的整體框架

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? ? ? ? TCMIO數據庫的整體框架見下圖。

? ? 首先從文獻中提取腫瘤免疫學靶標（IO靶標）。對于每個靶標，使用公共數據庫UniProt對蛋白名稱和基因名稱進行標準化。然后從ChEMBL (version 24.0) 數據庫中提取作用于每個IO靶標的配體，活性閾值設定為10um, 活性類型僅包括Ki、Kd, IC50, C50，和potency。方劑和中藥均取自《中國藥典》(2015版)。利用Kew藥用植物名稱服務(Kew Medicinal Plant Names Services）收集中藥的種名。化學成分從TCMAnalyzer 下載，該軟件整合了TCMSP和TCMID的數據。數據庫還綜合分析了中藥與腫瘤免疫的關系。51xxziyuan.com

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二、數據量統計

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數據庫包含的各種類型的數據的數量統計見下表。

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總結

以上是生活随笔為你收集整理的中药免疫肿瘤学数据库，TCMIO使用指南的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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