近幾年，單細胞的研究蔚然成風，受到很多科研人員的青睞。小編為大家整理了迄今為止，最全的單細胞線上數據庫，可以幫助你更準確地進行細胞注釋和分析，也可以用作研究前期的數據探索。

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單細胞數據庫分類

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Human Cell Landscape (HCL)

Human Cell Atlas (HCA )

Human Protein Atlas (HPA)

SC2disease

Cell BLAST

CellMarker

PanglaoDB

CancerSEA

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單細胞數據庫詳情

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01

Human Cell Landscape

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Human Cell Landscape?

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HCL是由浙江大學團隊打造的人類細胞譜圖平臺，包含60種人體組織和7種細胞系的細胞，跨越胚胎和成年兩個時期，涵蓋八大系統的人類細胞圖譜。該成果于2020年3月份發表于Nature，作者開發了scHCL單細胞比對系統，可幫助鑒定人類細胞類型。

其中幾大功能介紹如下：

名稱	功能介紹
Landscape	可對人體102種細胞類型進行可視化、也可以對細胞分組、篩選特定組織或基因進行可視化。
Gallery	可下載特征組織的單細胞的表達矩陣以及基因聚類分析的結果。
Search	可選擇特定組織下的感興趣基因，并獲取該基因表達的柱狀圖和tSNE聚類圖。
Run-scHCL	允許用戶自行上傳RNA表達矩陣(scRNA或bulk RNA都可以)，運行該模塊后，可鑒定數據中的細胞類型，并提供交互式熱圖和csv文件結果。

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02

Human Cell?Atlas

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人類細胞圖譜(HCA)目前收錄了33個組織，289個供體，共包含450，0000個單細胞測序數據，可呈現人體內不同組織下的細胞類型、數目、位置、以及彼此間的關聯等。

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剩余內容及詳細使用指南<<<<

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總結

以上是生活随笔為你收集整理的2021常用单细胞数据库整理汇总的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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